More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1611 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1611  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  100 
 
 
226 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0988  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  86.1 
 
 
225 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0151076  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1070  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  77.21 
 
 
223 aa  352  2.9999999999999997e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  64.98 
 
 
225 aa  293  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0120  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  66.99 
 
 
225 aa  290  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3357  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  65.53 
 
 
225 aa  290  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0569  DNA methylase N-4/N-6  61.5 
 
 
215 aa  284  8e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  57.43 
 
 
327 aa  234  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0050  putative methylase  51.72 
 
 
227 aa  229  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000518664  normal  0.980078 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0013  putative methylase  52.5 
 
 
227 aa  228  8e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0043  putative methylase  51.5 
 
 
227 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.181539  normal  0.0471117 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0132  putative methylase  50.74 
 
 
225 aa  224  8e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000100441 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0009  putative methylase  51 
 
 
227 aa  223  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0028  putative DNA methylase  53.64 
 
 
261 aa  139  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.412045  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3720  DNA modification methylase-like protein  50 
 
 
131 aa  118  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773851  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0186  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.83 
 
 
249 aa  95.1  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1319  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.24 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000125948 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01365  DNA methylase  28.94 
 
 
236 aa  93.2  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.255281  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2649  DNA methylase N-4/N-6  28.69 
 
 
389 aa  92.8  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2741  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.67 
 
 
262 aa  92.4  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4855  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.51 
 
 
249 aa  91.7  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.862856  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.57 
 
 
382 aa  91.7  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.74 
 
 
419 aa  91.3  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2104  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.8 
 
 
269 aa  89.4  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.636734  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3210  DNA methylase N-4/N-6  27.35 
 
 
367 aa  89.4  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3289  DNA methylase N-4/N-6  29.63 
 
 
218 aa  88.6  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1300  adenine specific DNA methyltransferase, putative  30.6 
 
 
247 aa  87  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1338  site-specific DNA-methyltransferase  29.91 
 
 
258 aa  86.3  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.287201  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2608  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.83 
 
 
265 aa  85.5  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327193 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  28.86 
 
 
368 aa  84.7  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2101  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.51 
 
 
376 aa  84.7  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.528087 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1468  site-specific DNA-methyltransferase  27.76 
 
 
372 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0392  DNA methylase N-4/N-6  28 
 
 
367 aa  84  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3157  DNA methylase N-4/N-6  31.49 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0119  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.76 
 
 
372 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2607  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.37 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000328335 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0066  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.76 
 
 
372 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711822  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1809  DNA modification methylase-like protein  28.15 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1308  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.7 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169451 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.11 
 
 
359 aa  82.8  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0965  DNA methylase N-4/N-6  27.57 
 
 
379 aa  82.4  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4367  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.24 
 
 
358 aa  81.6  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_002936  DET1092  DNA methylase  29.03 
 
 
421 aa  80.9  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3296  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.46 
 
 
253 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.912166  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1402  DNA modification methylase-like  25.85 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  29.55 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  29.55 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  29.55 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  29.55 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  29.55 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0705  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.85 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.592771  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1409  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.67 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  29.55 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  29.55 
 
 
294 aa  75.5  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.55 
 
 
294 aa  75.1  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  26.75 
 
 
380 aa  75.5  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0702  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.16 
 
 
367 aa  75.1  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0606262  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1471  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.95 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  29.15 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1486  site-specific DNA-methyltransferase  24.58 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2784  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.17 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0534146  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0420  site-specific DNA-methyltransferase  24.89 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0821  haemagglutinin associated protein  28.71 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.893321  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3844  DNA methylase N-4/N-6  31.89 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.64 
 
 
425 aa  72.4  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3349  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.87 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206831  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0505  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.34 
 
 
239 aa  72  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4974  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.82 
 
 
597 aa  72  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3569  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.87 
 
 
283 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4408  DNA methylase N-4/N-6  28.87 
 
 
283 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3959  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.87 
 
 
283 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135356  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0413  modification methylase CcrMI  24.71 
 
 
378 aa  71.6  0.000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1367  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.21 
 
 
360 aa  71.6  0.000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2124  DNA methylase N-4/N-6  28.87 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775437  normal  0.0115493 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0701  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.89 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.79 
 
 
370 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0004  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.05 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.0090313 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3854  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.45 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0913  site-specific DNA-methyltransferase  29.59 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1244  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.86 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1729  DNA methylase N-4/N-6  26.15 
 
 
411 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0501  haemagglutinin associated protein  26.27 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0486042  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.69 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4621  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.71 
 
 
283 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0315645  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.69 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2880  putative modification methylase  26.34 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150564  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0763  DNA adenine methylase CcrM  26.56 
 
 
372 aa  69.3  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.89 
 
 
373 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2238  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.76 
 
 
304 aa  69.3  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000832138  hitchhiker  0.0000505476 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05110  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.8 
 
 
386 aa  68.9  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1423  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.09 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0680  N-6 adenine-specific DNA methylase  26.94 
 
 
259 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2855  DNA methylase N-4/N-6  26.46 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0194641  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3693  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.57 
 
 
332 aa  68.9  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00816735  hitchhiker  0.000000112456 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3051  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.18 
 
 
305 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.766 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.94 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1546  DNA methylase N-4/N-6  28.16 
 
 
470 aa  68.6  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.572545  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1962  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.1 
 
 
259 aa  68.6  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  25.32 
 
 
239 aa  68.6  0.00000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0768  DNA methylase  27.35 
 
 
258 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>