More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0599 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0599  ParB-like nuclease domain-containing protein  100 
 
 		 94 aa  194  4.0000000000000005e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0661  ParB-like nuclease domain-containing protein  100 
 
 		 94 aa  194  4.0000000000000005e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0830  ParB domain protein nuclease  53.62 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00729707  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0872  nuclease  44 
 
 		 684 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0594  prophage LambdaW4, DNA methylase  42.03 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0766546  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  41.67 
 
 		 409 aa  68.2  0.00000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0653  nuclease  42.5 
 
 		 459 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739439  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  43.75 
 
 		 411 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.75 
 
 		 421 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0959  nuclease  45.07 
 
 		 396 aa  67.4  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273915 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2905  nuclease  40.74 
 
 		 444 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117629  normal  0.708215 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  43.75 
 
 		 421 aa  66.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1249  nuclease  39.51 
 
 		 444 aa  65.5  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.535856  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7135  nuclease  40.54 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.782385  hitchhiker  0.0000459905 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2055  nuclease  41.25 
 
 		 448 aa  64.7  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00544489  normal  0.0145428 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3400  nuclease  39.73 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360285  hitchhiker  0.000000903225 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1318  nuclease  41.25 
 
 		 452 aa  64.3  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.09005 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.25 
 
 		 471 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2583  nuclease  41.25 
 
 		 452 aa  64.3  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2753  nuclease  41.25 
 
 		 452 aa  64.3  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.5 
 
 		 425 aa  64.7  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2825  nuclease  41.25 
 
 		 448 aa  64.3  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS06032  hypothetical protein  44.93 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0816  ParB-like nuclease  39.51 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207727  hitchhiker  0.00120051 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2231  ParB family protein  41.54 
 
 		 169 aa  62  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.119979  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0096  ParB family chromosome partitioning protein  46.58 
 
 		 278 aa  62  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0136  ParB family chromosome partitioning protein  46.58 
 
 		 278 aa  62  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0108  ParB family chromosome partitioning protein  46.58 
 
 		 278 aa  62  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1511  nuclease  40.51 
 
 		 178 aa  60.5  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  35.62 
 
 		 436 aa  60.5  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2279  ParB domain protein nuclease  36.49 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01351  hypothetical protein  40 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.739231  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01340  conserved hypothetical protein  37.5 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1729  DNA methylase N-4/N-6  38.96 
 
 		 411 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  39.47 
 
 		 272 aa  58.2  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2068  nuclease  37.04 
 
 		 463 aa  57.4  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204845 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4924  nuclease  36.62 
 
 		 196 aa  57.4  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.180395 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  41.46 
 
 		 286 aa  57  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4927  nuclease  41.67 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.603092 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  42.25 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1092  DNA methylase  35 
 
 		 421 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  40.85 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2933  ParB-like nuclease  37.84 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1638  ParB-like nuclease  37.18 
 
 		 417 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0822558  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  38.36 
 
 		 295 aa  55.1  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2654  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  49.02 
 
 		 447 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1546  DNA methylase N-4/N-6  32.88 
 
 		 470 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.572545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  44 
 
 		 401 aa  55.1  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  40.85 
 
 		 278 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0878  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.44 
 
 		 464 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643395  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  37.84 
 
 		 282 aa  54.3  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0070  ParB domain-containing protein  42.19 
 
 		 222 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1732  stage 0 sporulation protein J  39.47 
 
 		 286 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  38.89 
 
 		 284 aa  53.5  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  51.16 
 
 		 441 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  39.71 
 
 		 272 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  38.67 
 
 		 283 aa  53.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0358  stage 0 sporulation protein J  38.16 
 
 		 286 aa  52.4  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000194185  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  37.66 
 
 		 282 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  40.26 
 
 		 285 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  36.47 
 
 		 255 aa  52.8  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  41.33 
 
 		 290 aa  52  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  41.33 
 
 		 288 aa  52  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  38.03 
 
 		 279 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  37.66 
 
 		 289 aa  51.2  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2755  parB-like partition protein  40.51 
 
 		 280 aa  51.2  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  36.49 
 
 		 283 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  38.03 
 
 		 279 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6266  ParB domain protein nuclease  42.62 
 
 		 212 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697996  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  36.49 
 
 		 283 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  39.44 
 
 		 274 aa  50.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  35.53 
 
 		 268 aa  50.4  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  35.14 
 
 		 283 aa  50.4  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0189  chromosome partitioning protein ParB  34.26 
 
 		 283 aa  50.4  0.000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.807287  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  36.49 
 
 		 283 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  35.8 
 
 		 282 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  37.84 
 
 		 283 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  39.13 
 
 		 256 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1727  parB-like partition protein  36.36 
 
 		 280 aa  49.7  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0135  nuclease  37.33 
 
 		 434 aa  50.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00112116 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  39.13 
 
 		 256 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3268  ParB family protein  42.31 
 
 		 565 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1452  DNA methylase N-4/N-6  39.66 
 
 		 435 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  37.84 
 
 		 283 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2422  parB-like partition protein  35.9 
 
 		 285 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568139 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  35.53 
 
 		 288 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  37.18 
 
 		 288 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1149  ParB domain protein nuclease  29.33 
 
 		 422 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  36.49 
 
 		 283 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  37.66 
 
 		 294 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  35.8 
 
 		 290 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  40.85 
 
 		 281 aa  48.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  35.8 
 
 		 290 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  37.66 
 
 		 286 aa  48.5  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0940  parB-like partition protein  32.14 
 
 		 409 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6163  ParB family protein  38.16 
 
 		 323 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670147  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2569  transcriptional regulator  34.57 
 
 		 284 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  35.14 
 
 		 283 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  35.14 
 
 		 283 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1639  DNA methylase N-4/N-6  32.05 
 
 		 432 aa  47.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>