More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3216 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  88.51 
 
 		 421 aa  759    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  82.59 
 
 		 411 aa  690    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  100 
 
 		 425 aa  872    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  79.04 
 
 		 421 aa  668    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0594  prophage LambdaW4, DNA methylase  48.41 
 
 		 408 aa  407  1.0000000000000001e-112  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0766546  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  48.53 
 
 		 409 aa  404  1e-111  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0653  nuclease  47.37 
 
 		 459 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739439  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1092  DNA methylase  44.56 
 
 		 421 aa  347  2e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0878  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  43.98 
 
 		 464 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643395  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2068  nuclease  41.38 
 
 		 463 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204845 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1729  DNA methylase N-4/N-6  41.86 
 
 		 411 aa  293  6e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1638  ParB-like nuclease  41.44 
 
 		 417 aa  291  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0822558  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0392  DNA methylase, family protein  41.16 
 
 		 413 aa  288  9e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2055  nuclease  40.09 
 
 		 448 aa  288  9e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00544489  normal  0.0145428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2753  nuclease  40.52 
 
 		 452 aa  288  9e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2842  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.16 
 
 		 413 aa  288  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.137249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1244  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.31 
 
 		 412 aa  287  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1318  nuclease  40.28 
 
 		 452 aa  288  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.09005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2583  nuclease  40.28 
 
 		 452 aa  288  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2825  nuclease  40.09 
 
 		 448 aa  288  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1249  nuclease  41.84 
 
 		 444 aa  286  4e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.535856  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2905  nuclease  42.08 
 
 		 444 aa  286  4e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117629  normal  0.708215 
 
 
-
 
NC_002936  DET0066  DNA methylase  38.69 
 
 		 411 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1452  DNA methylase N-4/N-6  39.58 
 
 		 435 aa  259  9e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1480  ParB-like nuclease domain-containing protein  39.24 
 
 		 408 aa  257  2e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.39 
 
 		 488 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  38.03 
 
 		 436 aa  251  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1546  DNA methylase N-4/N-6  38.07 
 
 		 470 aa  250  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.572545  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS06032  hypothetical protein  60.89 
 
 		 222 aa  241  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.77 
 
 		 483 aa  240  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0959  nuclease  35.75 
 
 		 396 aa  216  5.9999999999999996e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273915 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  50.95 
 
 		 471 aa  195  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0872  nuclease  39.46 
 
 		 684 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2654  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  52.15 
 
 		 447 aa  178  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0816  ParB-like nuclease  67.74 
 
 		 247 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207727  hitchhiker  0.00120051 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1639  DNA methylase N-4/N-6  31.11 
 
 		 432 aa  173  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  51.11 
 
 		 441 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_003296  RS06031  hypothetical protein  86.08 
 
 		 82 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7135  nuclease  53.33 
 
 		 183 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.782385  hitchhiker  0.0000459905 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4924  nuclease  48.55 
 
 		 196 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.180395 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3400  nuclease  49.32 
 
 		 200 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360285  hitchhiker  0.000000903225 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1511  nuclease  49.28 
 
 		 178 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4927  nuclease  46.32 
 
 		 203 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.603092 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2231  ParB family protein  43.26 
 
 		 169 aa  119  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.119979  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6991  ParB domain protein nuclease  47.4 
 
 		 184 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2276  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  45.71 
 
 		 403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2933  ParB-like nuclease  54.37 
 
 		 177 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2386  hypothetical protein  50.38 
 
 		 459 aa  106  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6266  ParB domain protein nuclease  43.8 
 
 		 212 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697996  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02830  ParB-like nuclease  42.62 
 
 		 410 aa  95.1  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0823901  hitchhiker  4.66219e-31 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.19 
 
 		 419 aa  94  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2279  ParB domain protein nuclease  53.09 
 
 		 87 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01340  conserved hypothetical protein  56.94 
 
 		 131 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0070  ParB domain-containing protein  40.98 
 
 		 222 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01351  hypothetical protein  56.94 
 
 		 77 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.739231  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0830  ParB domain protein nuclease  40.18 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00729707  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0283  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.86 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1611  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.64 
 
 		 226 aa  72.4  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  27.78 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  27.04 
 
 		 311 aa  72  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3157  DNA methylase N-4/N-6  28.38 
 
 		 266 aa  72  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3289  DNA methylase N-4/N-6  28.85 
 
 		 218 aa  72.4  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  28.87 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2855  DNA methylase N-4/N-6  46.75 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0194641  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0988  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.03 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0151076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2784  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.05 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0534146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.87 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.87 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  27.47 
 
 		 294 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.35 
 
 		 294 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  27.47 
 
 		 294 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  27.54 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  27.47 
 
 		 294 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  27.47 
 
 		 294 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  27.47 
 
 		 294 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  25.64 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.88 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2398  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.48 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3036  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  43.9 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0660763  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1319  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.11 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000125948 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1962  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.97 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2942  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  43.9 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361147  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0286  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.95 
 
 		 271 aa  67  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.52 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1308  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169451 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1480  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.39 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.292437  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.41 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1911  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.35 
 
 		 322 aa  65.9  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.41 
 
 		 380 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1982  DNA-methyltransferase (DNA-modification methylase) protein  44.87 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0159066 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3747  putative methyltransferase  27.13 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00189132  normal  0.187537 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3650  putative methyltransferase  27.13 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000365024  hitchhiker  0.00241657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3578  putative methyltransferase  27.13 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0177776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3577  putative methyltransferase  27.13 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00742062  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3684  putative methyltransferase  27.13 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220289  normal  0.0704128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0828  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.1 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2238  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.6 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000832138  hitchhiker  0.0000505476 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0599  ParB-like nuclease domain-containing protein  42.5 
 
 		 94 aa  64.7  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0661  ParB-like nuclease domain-containing protein  42.5 
 
 		 94 aa  64.7  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2741  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.8 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.706454 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>