More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3289 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_3289  DNA methylase N-4/N-6  100 
 
 
218 aa  457  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0705  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  72.22 
 
 
220 aa  337  5.9999999999999996e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.592771  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0821  haemagglutinin associated protein  72.43 
 
 
230 aa  337  9.999999999999999e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.893321  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0501  haemagglutinin associated protein  67.92 
 
 
230 aa  311  2.9999999999999996e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0486042  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0682  DNA methylase N-4/N-6  59.07 
 
 
230 aa  274  7e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0186  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.54 
 
 
249 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4855  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.25 
 
 
249 aa  99.8  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.862856  normal 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.78 
 
 
419 aa  97.1  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0120  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.73 
 
 
225 aa  94  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0050  putative methylase  31.48 
 
 
227 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000518664  normal  0.980078 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1471  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.34 
 
 
276 aa  91.3  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.82 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3357  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.82 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1300  adenine specific DNA methyltransferase, putative  28.14 
 
 
247 aa  88.6  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1611  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.63 
 
 
226 aa  88.6  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0419  DNA methylase N-4/N-6  30.37 
 
 
238 aa  87.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.883975  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0013  putative methylase  30.73 
 
 
227 aa  87  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2649  DNA methylase N-4/N-6  26.21 
 
 
389 aa  86.7  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0009  putative methylase  29.17 
 
 
227 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0132  putative methylase  30.09 
 
 
225 aa  85.9  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000100441 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0988  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.95 
 
 
225 aa  85.5  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0151076  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3210  DNA methylase N-4/N-6  25 
 
 
367 aa  84.7  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1070  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.58 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1319  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.98 
 
 
258 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000125948 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0043  putative methylase  29.63 
 
 
227 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.181539  normal  0.0471117 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2238  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.69 
 
 
304 aa  84  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000832138  hitchhiker  0.0000505476 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.7 
 
 
359 aa  82  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0569  DNA methylase N-4/N-6  31.94 
 
 
215 aa  82  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  26.42 
 
 
368 aa  81.3  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1071  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.16 
 
 
391 aa  80.9  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3693  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.31 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00816735  hitchhiker  0.000000112456 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2101  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.87 
 
 
376 aa  81.3  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.528087 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2784  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.15 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0534146  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1468  site-specific DNA-methyltransferase  24.9 
 
 
372 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  23.29 
 
 
380 aa  77.4  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0505  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.31 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.91 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01365  DNA methylase  30.08 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.255281  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0119  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.9 
 
 
372 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.54 
 
 
382 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0066  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.46 
 
 
372 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711822  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3157  DNA methylase N-4/N-6  26.5 
 
 
266 aa  75.9  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2231  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.77 
 
 
369 aa  75.9  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0921492  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0763  DNA adenine methylase CcrM  26.53 
 
 
372 aa  75.9  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3343  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.77 
 
 
369 aa  75.5  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  hitchhiker  0.00000416126 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1308  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.31 
 
 
253 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169451 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2855  DNA methylase N-4/N-6  25.58 
 
 
285 aa  75.1  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0194641  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.62 
 
 
373 aa  75.1  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4367  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.9 
 
 
358 aa  74.7  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1367  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.1 
 
 
360 aa  74.7  0.0000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1338  site-specific DNA-methyltransferase  27.27 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.287201  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2104  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.636734  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2741  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.31 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3008  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.31 
 
 
370 aa  74.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.367581 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.21 
 
 
370 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  26.88 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3043  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.62 
 
 
375 aa  73.2  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00264807  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0392  DNA methylase N-4/N-6  24.8 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0750  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.14 
 
 
395 aa  72.8  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.296291  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.59 
 
 
488 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1200  DNA methylase N-4/N-6  26.03 
 
 
377 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  29.78 
 
 
421 aa  72.4  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.85 
 
 
425 aa  72.4  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.2 
 
 
368 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.45 
 
 
239 aa  71.6  0.000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  29.91 
 
 
411 aa  71.6  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1173  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.83 
 
 
389 aa  70.9  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2942  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.81 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3036  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.81 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0660763  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1218  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.71 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.48 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2900  prophage MuMc02, DNA methyltransferase  28.02 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470723  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  26.51 
 
 
409 aa  70.9  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0878  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.33 
 
 
464 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643395  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  25.69 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  25.69 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  25.3 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1073  DNA methylase N-4/N-6  25.82 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981822  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3225  DNA methylase N-4/N-6  24.69 
 
 
376 aa  69.7  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0965  DNA methylase N-4/N-6  22.12 
 
 
379 aa  69.7  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  25.69 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  25.69 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  25.69 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1962  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.48 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  25.69 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0702  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.21 
 
 
367 aa  69.7  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0606262  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.43 
 
 
421 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  26.61 
 
 
304 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.83 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.57 
 
 
483 aa  68.9  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.77 
 
 
377 aa  68.6  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.220402  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0413  modification methylase CcrMI  25.39 
 
 
378 aa  68.2  0.00000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1452  DNA methylase N-4/N-6  25 
 
 
435 aa  68.2  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0066  DNA methylase  27.91 
 
 
411 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0491  modification methylase BabI  24.3 
 
 
377 aa  67.4  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1402  DNA modification methylase-like  24.48 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  23.79 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0495  modification methylase BabI  24.3 
 
 
386 aa  67.4  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0710  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.75 
 
 
396 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.256759 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1409  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.65 
 
 
243 aa  67  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>