More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_D0009 on replicon NC_009788
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009788  EcE24377A_D0009  putative methylase  100 
 
 
227 aa  478  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0043  putative methylase  96.92 
 
 
227 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.181539  normal  0.0471117 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0013  putative methylase  93.83 
 
 
227 aa  454  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0050  putative methylase  93.39 
 
 
227 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000518664  normal  0.980078 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0132  putative methylase  87.67 
 
 
225 aa  421  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000100441 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  62.31 
 
 
327 aa  254  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0569  DNA methylase N-4/N-6  58.21 
 
 
215 aa  254  9e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0028  putative DNA methylase  96.55 
 
 
261 aa  246  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.412045  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3357  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  52.61 
 
 
225 aa  235  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0120  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  52.13 
 
 
225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  51.9 
 
 
225 aa  232  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0988  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  52.5 
 
 
225 aa  223  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0151076  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1611  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  51 
 
 
226 aa  223  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1070  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  50 
 
 
223 aa  214  7e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3720  DNA modification methylase-like protein  59.41 
 
 
131 aa  138  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773851  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1319  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.87 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000125948 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.62 
 
 
419 aa  109  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2741  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.63 
 
 
262 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2649  DNA methylase N-4/N-6  27.2 
 
 
389 aa  93.6  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2104  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.72 
 
 
269 aa  92.8  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.636734  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  27.2 
 
 
368 aa  93.2  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1308  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.69 
 
 
253 aa  92.8  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169451 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0705  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.91 
 
 
220 aa  92.4  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.592771  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0066  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.2 
 
 
372 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711822  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1468  site-specific DNA-methyltransferase  26.8 
 
 
372 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.89 
 
 
359 aa  90.5  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0119  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.8 
 
 
372 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4855  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.06 
 
 
249 aa  90.9  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.862856  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0186  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.59 
 
 
249 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2101  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26 
 
 
376 aa  87  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.528087 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3289  DNA methylase N-4/N-6  29.17 
 
 
218 aa  86.3  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.97 
 
 
382 aa  86.3  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1300  adenine specific DNA methyltransferase, putative  28.88 
 
 
247 aa  85.9  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01365  DNA methylase  25.96 
 
 
236 aa  85.1  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.255281  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2608  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.57 
 
 
265 aa  84.7  9e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327193 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0821  haemagglutinin associated protein  29.03 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.893321  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25 
 
 
398 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3210  DNA methylase N-4/N-6  28.63 
 
 
367 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0392  DNA methylase N-4/N-6  26.4 
 
 
367 aa  84  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4367  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.05 
 
 
358 aa  83.2  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.46 
 
 
379 aa  82.4  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3650  putative methyltransferase  27.82 
 
 
294 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000365024  hitchhiker  0.00241657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3578  putative methyltransferase  27.82 
 
 
294 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0177776  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3577  putative methyltransferase  27.82 
 
 
294 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00742062  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3684  putative methyltransferase  27.82 
 
 
294 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220289  normal  0.0704128 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3747  putative methyltransferase  27.82 
 
 
294 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00189132  normal  0.187537 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.68 
 
 
380 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3051  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.98 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.766 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2231  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.67 
 
 
369 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0921492  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1729  DNA methylase N-4/N-6  28.19 
 
 
411 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3343  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.67 
 
 
369 aa  80.5  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  hitchhiker  0.00000416126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.84 
 
 
368 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  25.38 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  26.42 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1173  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.25 
 
 
389 aa  79  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1367  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.1 
 
 
360 aa  79  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0413  modification methylase CcrMI  26.38 
 
 
378 aa  78.6  0.00000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  27.83 
 
 
304 aa  78.6  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0420  site-specific DNA-methyltransferase  26.72 
 
 
243 aa  78.6  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1486  site-specific DNA-methyltransferase  26.75 
 
 
243 aa  78.6  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0491  modification methylase BabI  23.46 
 
 
377 aa  78.2  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0495  modification methylase BabI  23.46 
 
 
386 aa  78.2  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.98 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1449  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.6 
 
 
360 aa  77.8  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.103238  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  28.98 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.08 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.220402  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  29.34 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  28.93 
 
 
294 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  28.93 
 
 
294 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0501  haemagglutinin associated protein  27.54 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0486042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  28.93 
 
 
294 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0505  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.31 
 
 
239 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.2 
 
 
239 aa  77  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  28.57 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  28.93 
 
 
294 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.29 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1402  DNA modification methylase-like  26.29 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1409  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.94 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0702  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.51 
 
 
367 aa  76.3  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0606262  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0763  DNA adenine methylase CcrM  25.51 
 
 
372 aa  76.3  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  29.22 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1982  DNA-methyltransferase (DNA-modification methylase) protein  25.73 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0159066 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3854  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.18 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3349  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.18 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206831  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.61 
 
 
308 aa  75.1  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.61 
 
 
308 aa  75.1  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4621  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.06 
 
 
283 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0315645  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.61 
 
 
370 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1218  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.1 
 
 
376 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1480  ParB-like nuclease domain-containing protein  29.13 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3008  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.12 
 
 
370 aa  73.6  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.367581 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2124  DNA methylase N-4/N-6  28.76 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775437  normal  0.0115493 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1597  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.8 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111041 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2842  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.95 
 
 
413 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.137249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1244  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.31 
 
 
412 aa  72.4  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2900  prophage MuMc02, DNA methyltransferase  25.84 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470723  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0203  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.2 
 
 
319 aa  72.4  0.000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3296  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.53 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.912166  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2306  DNA modification methylase RsrI  29.46 
 
 
282 aa  72  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.436701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0530  DNA modification methylase RsrI  29.46 
 
 
282 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>