More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1070 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1070  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  100 
 
 
223 aa  461  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0988  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  77.23 
 
 
225 aa  361  6e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0151076  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1611  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  77.21 
 
 
226 aa  352  2.9999999999999997e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0120  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  67.27 
 
 
225 aa  305  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3357  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  66.36 
 
 
225 aa  303  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  67.3 
 
 
225 aa  299  3e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0569  DNA methylase N-4/N-6  61.4 
 
 
215 aa  280  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  56 
 
 
327 aa  221  9e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0050  putative methylase  51.74 
 
 
227 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000518664  normal  0.980078 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0013  putative methylase  52 
 
 
227 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0132  putative methylase  51.24 
 
 
225 aa  216  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000100441 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0043  putative methylase  50.5 
 
 
227 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.181539  normal  0.0471117 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0009  putative methylase  50 
 
 
227 aa  214  7e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0028  putative DNA methylase  47.73 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.412045  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3720  DNA modification methylase-like protein  52.63 
 
 
131 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773851  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01365  DNA methylase  30.21 
 
 
236 aa  98.2  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.255281  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0186  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.46 
 
 
249 aa  94.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4855  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.74 
 
 
249 aa  93.2  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.862856  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2104  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.17 
 
 
269 aa  92.8  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.636734  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2608  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.87 
 
 
265 aa  88.2  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327193 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3210  DNA methylase N-4/N-6  27.53 
 
 
367 aa  85.9  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1338  site-specific DNA-methyltransferase  29.66 
 
 
258 aa  85.1  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.287201  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3289  DNA methylase N-4/N-6  29.58 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.92 
 
 
382 aa  84  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.38 
 
 
419 aa  83.6  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1092  DNA methylase  31.72 
 
 
421 aa  82.8  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0965  DNA methylase N-4/N-6  27.71 
 
 
379 aa  82.8  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2741  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.37 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1468  site-specific DNA-methyltransferase  27.76 
 
 
372 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0119  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.76 
 
 
372 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  27.64 
 
 
368 aa  79.7  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0066  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.35 
 
 
372 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711822  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1809  DNA modification methylase-like protein  28.22 
 
 
273 aa  79  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1319  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  21.9 
 
 
258 aa  78.6  0.00000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000125948 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0392  DNA methylase N-4/N-6  26.53 
 
 
367 aa  78.6  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3157  DNA methylase N-4/N-6  30.67 
 
 
266 aa  78.2  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2649  DNA methylase N-4/N-6  27.82 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0821  haemagglutinin associated protein  27.83 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.893321  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1729  DNA methylase N-4/N-6  28.14 
 
 
411 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1308  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.83 
 
 
253 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169451 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0501  haemagglutinin associated protein  27.67 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0486042  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  25.71 
 
 
380 aa  77.4  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0413  modification methylase CcrMI  27.53 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0705  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.94 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.592771  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0420  site-specific DNA-methyltransferase  26.75 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1244  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.9 
 
 
412 aa  75.5  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1409  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.93 
 
 
243 aa  75.1  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3296  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.11 
 
 
253 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.912166  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.63 
 
 
379 aa  75.1  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  28.8 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  28.8 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  28.8 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  28.8 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.42 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.45 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  28.8 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  28.8 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.8 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0702  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.48 
 
 
367 aa  73.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0606262  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  28.11 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2101  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.53 
 
 
376 aa  73.6  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.528087 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1300  adenine specific DNA methyltransferase, putative  27.23 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3854  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.09 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1486  site-specific DNA-methyltransferase  26.41 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3349  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.09 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206831  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  28.4 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3569  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.97 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4408  DNA methylase N-4/N-6  25.97 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3959  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.97 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135356  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2124  DNA methylase N-4/N-6  26.09 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775437  normal  0.0115493 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  28.4 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3684  putative methyltransferase  26.94 
 
 
294 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220289  normal  0.0704128 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3650  putative methyltransferase  26.94 
 
 
294 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000365024  hitchhiker  0.00241657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3578  putative methyltransferase  26.94 
 
 
294 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0177776  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3747  putative methyltransferase  26.94 
 
 
294 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00189132  normal  0.187537 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3577  putative methyltransferase  26.94 
 
 
294 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00742062  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.27 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1480  ParB-like nuclease domain-containing protein  29.59 
 
 
408 aa  71.2  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1471  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.8 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2880  putative modification methylase  25.1 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150564  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1962  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.4 
 
 
259 aa  70.1  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.89 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4367  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.09 
 
 
358 aa  70.1  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  25.11 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1173  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.27 
 
 
389 aa  69.7  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2607  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.16 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000328335 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2238  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.15 
 
 
304 aa  68.6  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000832138  hitchhiker  0.0000505476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.41 
 
 
370 aa  68.6  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0701  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.51 
 
 
238 aa  68.2  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2842  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28 
 
 
413 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.137249  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4621  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.78 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0315645  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2231  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.39 
 
 
369 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0921492  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_002936  DET0066  DNA methylase  28.35 
 
 
411 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0941  DNA methylase  25 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0392  DNA methylase, family protein  28 
 
 
413 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0491  modification methylase BabI  26.61 
 
 
377 aa  67  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3693  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.74 
 
 
332 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00816735  hitchhiker  0.000000112456 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3343  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.39 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  hitchhiker  0.00000416126 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1402  DNA modification methylase-like  25.31 
 
 
264 aa  67  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6841  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.58 
 
 
301 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>