273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0186 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0186  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  100 
 
 
249 aa  513  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4855  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  89.96 
 
 
249 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.862856  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1338  site-specific DNA-methyltransferase  61.9 
 
 
258 aa  310  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.287201  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1300  adenine specific DNA methyltransferase, putative  47.39 
 
 
247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01365  DNA methylase  47.88 
 
 
236 aa  211  7e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.255281  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1308  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  46.96 
 
 
253 aa  203  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169451 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3651  DNA methylase  61.39 
 
 
200 aa  201  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.061929  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2741  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.35 
 
 
262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1409  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  45.49 
 
 
243 aa  188  5.999999999999999e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0420  site-specific DNA-methyltransferase  42.92 
 
 
243 aa  181  8.000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1486  site-specific DNA-methyltransferase  42.67 
 
 
243 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1423  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  45.37 
 
 
237 aa  175  6e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0701  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.92 
 
 
238 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3667  DNA methylase  66.13 
 
 
138 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2608  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.98 
 
 
265 aa  165  6.9999999999999995e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327193 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2900  prophage MuMc02, DNA methyltransferase  38.72 
 
 
265 aa  159  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470723  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2104  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.34 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.636734  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0913  site-specific DNA-methyltransferase  47.06 
 
 
173 aa  125  8.000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3289  DNA methylase N-4/N-6  31.54 
 
 
218 aa  105  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.5 
 
 
382 aa  102  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  31.52 
 
 
368 aa  99  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3210  DNA methylase N-4/N-6  28.91 
 
 
367 aa  99.4  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0988  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.51 
 
 
225 aa  98.2  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0151076  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  29.01 
 
 
380 aa  97.1  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.8 
 
 
368 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.1 
 
 
373 aa  95.5  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.69 
 
 
359 aa  95.1  9e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1611  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.83 
 
 
226 aa  95.1  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1070  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.46 
 
 
223 aa  94.7  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0392  DNA methylase N-4/N-6  30.08 
 
 
367 aa  92.8  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2101  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.47 
 
 
376 aa  92.8  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.528087 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1468  site-specific DNA-methyltransferase  29.5 
 
 
372 aa  92  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0119  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.5 
 
 
372 aa  92  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0821  haemagglutinin associated protein  27.13 
 
 
230 aa  92  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.893321  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4367  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.19 
 
 
358 aa  91.3  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0066  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.69 
 
 
372 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711822  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0132  putative methylase  29.06 
 
 
225 aa  90.9  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000100441 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.88 
 
 
370 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3343  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.35 
 
 
369 aa  90.5  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  hitchhiker  0.00000416126 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2231  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.56 
 
 
369 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0921492  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1597  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.44 
 
 
379 aa  90.1  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111041 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0569  DNA methylase N-4/N-6  29.66 
 
 
215 aa  90.1  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0702  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.47 
 
 
367 aa  89.7  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0606262  normal 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0009  putative methylase  27.59 
 
 
227 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0050  putative methylase  27.78 
 
 
227 aa  89  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000518664  normal  0.980078 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0705  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.69 
 
 
220 aa  89  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.592771  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1402  DNA modification methylase-like  25.82 
 
 
264 aa  88.2  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0965  DNA methylase N-4/N-6  29.5 
 
 
379 aa  87  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0013  putative methylase  27.59 
 
 
227 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.3 
 
 
327 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1367  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.79 
 
 
360 aa  87  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0710  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.99 
 
 
396 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.256759 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2649  DNA methylase N-4/N-6  29.23 
 
 
389 aa  85.5  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.61 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0043  putative methylase  26.72 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.181539  normal  0.0471117 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.69 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.220402  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  23.95 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1173  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.84 
 
 
389 aa  83.2  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1218  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.69 
 
 
376 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3357  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.33 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1449  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.31 
 
 
360 aa  83.2  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.103238  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0491  modification methylase BabI  28.46 
 
 
377 aa  82.8  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0495  modification methylase BabI  28.63 
 
 
386 aa  82.8  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0120  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.75 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.98 
 
 
419 aa  82.4  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1319  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.48 
 
 
258 aa  82  0.000000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000125948 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  28.03 
 
 
377 aa  80.5  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3157  DNA methylase N-4/N-6  31.58 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.46 
 
 
398 aa  79.3  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3181  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.04 
 
 
398 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.65 
 
 
379 aa  79.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0413  modification methylase CcrMI  27.17 
 
 
378 aa  79  0.00000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0750  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.48 
 
 
395 aa  79  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.296291  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3505  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.04 
 
 
398 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.602417 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1809  DNA modification methylase-like protein  25.31 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3008  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.79 
 
 
370 aa  77.4  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.367581 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.27 
 
 
380 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0763  DNA adenine methylase CcrM  27.6 
 
 
372 aa  77  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3376  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.52 
 
 
370 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0501  haemagglutinin associated protein  23.98 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0486042  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3043  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.27 
 
 
375 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00264807  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.64 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  27.17 
 
 
311 aa  73.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.64 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1073  DNA methylase N-4/N-6  27.69 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981822  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3225  DNA methylase N-4/N-6  27.48 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2784  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.92 
 
 
282 aa  72  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0534146  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0828  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.7 
 
 
323 aa  72  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05110  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.25 
 
 
386 aa  72  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2603  DNA methylase N-4/N-6  27.38 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.592749  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1200  DNA methylase N-4/N-6  27.35 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0719  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3569  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.38 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4408  DNA methylase N-4/N-6  27.38 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3959  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.38 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135356  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0686  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.75 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000562829  hitchhiker  2.64678e-17 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0680  N-6 adenine-specific DNA methylase  26.37 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2332  DNA adenine methylase CcrM  27.89 
 
 
344 aa  69.3  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.160434  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4621  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.32 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0315645  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2124  DNA methylase N-4/N-6  26.32 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775437  normal  0.0115493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>