270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0913 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0913  site-specific DNA-methyltransferase  100 
 
 
173 aa  353  5e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1409  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  96.75 
 
 
243 aa  308  2e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1486  site-specific DNA-methyltransferase  95.45 
 
 
243 aa  304  4.0000000000000004e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0420  site-specific DNA-methyltransferase  95.45 
 
 
243 aa  304  5.0000000000000004e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1423  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  95.65 
 
 
237 aa  272  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01365  DNA methylase  49.67 
 
 
236 aa  148  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.255281  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1308  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  49.67 
 
 
253 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169451 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1300  adenine specific DNA methyltransferase, putative  46.67 
 
 
247 aa  141  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0701  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  47.37 
 
 
238 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2741  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  48.25 
 
 
262 aa  137  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2608  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  46.05 
 
 
265 aa  134  8e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327193 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2900  prophage MuMc02, DNA methyltransferase  43.04 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470723  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0186  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  47.06 
 
 
249 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4855  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.71 
 
 
249 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.862856  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2104  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  43.05 
 
 
269 aa  118  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.636734  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1338  site-specific DNA-methyltransferase  45.81 
 
 
258 aa  117  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.287201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3651  DNA methylase  41.82 
 
 
200 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.061929  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.17 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2855  DNA methylase N-4/N-6  36.41 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0194641  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.34 
 
 
419 aa  79.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3036  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.64 
 
 
286 aa  78.2  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0660763  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2942  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.64 
 
 
286 aa  78.2  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3667  DNA methylase  39.69 
 
 
138 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2784  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.15 
 
 
282 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0534146  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0988  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.77 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0151076  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1611  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.59 
 
 
226 aa  70.5  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0132  putative methylase  29.61 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000100441 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0050  putative methylase  29.61 
 
 
227 aa  67.8  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000518664  normal  0.980078 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1402  DNA modification methylase-like  30.59 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0009  putative methylase  28.95 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0013  putative methylase  28.95 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  31.9 
 
 
436 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.81 
 
 
359 aa  66.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.79 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.59 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0043  putative methylase  29.38 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.181539  normal  0.0471117 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1452  DNA methylase N-4/N-6  30.17 
 
 
435 aa  64.3  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.48 
 
 
222 aa  64.3  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1982  DNA-methyltransferase (DNA-modification methylase) protein  46.48 
 
 
270 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0159066 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2649  DNA methylase N-4/N-6  30.06 
 
 
389 aa  63.5  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2607  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.41 
 
 
237 aa  62.4  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000328335 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0965  DNA methylase N-4/N-6  28.82 
 
 
379 aa  62.4  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  28.32 
 
 
368 aa  62.4  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.07 
 
 
368 aa  62  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2136  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  47.76 
 
 
273 aa  62  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0572  hypothetical protein  76.32 
 
 
51 aa  62  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0120  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.41 
 
 
225 aa  61.6  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3357  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.41 
 
 
225 aa  61.6  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4621  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.77 
 
 
283 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0315645  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3157  DNA methylase N-4/N-6  33.33 
 
 
266 aa  60.8  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.38 
 
 
488 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  49.18 
 
 
304 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2124  DNA methylase N-4/N-6  46.77 
 
 
283 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775437  normal  0.0115493 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3854  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.77 
 
 
283 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.49 
 
 
373 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  41.79 
 
 
311 aa  60.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4408  DNA methylase N-4/N-6  46.03 
 
 
283 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3569  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.03 
 
 
283 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3349  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.77 
 
 
283 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206831  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3959  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.03 
 
 
283 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135356  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1812  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  46.97 
 
 
273 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.31 
 
 
377 aa  59.7  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.220402  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0680  N-6 adenine-specific DNA methylase  46.03 
 
 
259 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1070  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.63 
 
 
223 aa  59.7  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0941  DNA methylase  46.67 
 
 
309 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.44 
 
 
305 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0066  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.33 
 
 
372 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711822  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0526  hypothetical protein  73.68 
 
 
51 aa  59.3  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.348941  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1720  N-6 adenine-specific DNA methylase  46.03 
 
 
282 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0768  DNA methylase  46.03 
 
 
258 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1468  site-specific DNA-methyltransferase  26.74 
 
 
372 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1650  N-6 adenine-specific DNA methylase  46.03 
 
 
282 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1859  N-6 adenine-specific DNA methylase  46.03 
 
 
282 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.229539  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0119  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.74 
 
 
372 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2444  DNA modification methylase RsrI  46.03 
 
 
282 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.462592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2306  DNA modification methylase RsrI  46.03 
 
 
282 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.436701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0530  DNA modification methylase RsrI  46.03 
 
 
282 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4367  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.64 
 
 
358 aa  58.9  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1597  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.7 
 
 
379 aa  58.2  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.07 
 
 
370 aa  58.2  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0392  DNA methylase N-4/N-6  27.33 
 
 
367 aa  58.2  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0763  DNA adenine methylase CcrM  29.7 
 
 
372 aa  58.2  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2384  DNA methylase  59.09 
 
 
232 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.114492  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0495  modification methylase BabI  29.07 
 
 
386 aa  58.2  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.19 
 
 
308 aa  58.2  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0491  modification methylase BabI  29.07 
 
 
377 aa  58.2  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0878  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.9 
 
 
464 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643395  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.19 
 
 
308 aa  58.2  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3376  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.59 
 
 
370 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3181  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.59 
 
 
398 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3505  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.59 
 
 
398 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.602417 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2101  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.23 
 
 
376 aa  57.8  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.528087 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.55 
 
 
380 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3340  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.47 
 
 
347 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000107199  hitchhiker  0.000000355353 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.55 
 
 
398 aa  57.4  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2880  putative modification methylase  42.86 
 
 
301 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150564  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0569  DNA methylase N-4/N-6  29.61 
 
 
215 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0627  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.56 
 
 
274 aa  57  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1809  DNA modification methylase-like protein  30.38 
 
 
273 aa  57  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6841  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.86 
 
 
301 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>