273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2384 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2384  DNA methylase  100 
 
 
232 aa  477  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.114492  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.05 
 
 
222 aa  105  8e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2784  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.31 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0534146  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0941  DNA methylase  42.86 
 
 
309 aa  65.5  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  47.89 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4974  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  50 
 
 
597 aa  65.1  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2855  DNA methylase N-4/N-6  40.48 
 
 
285 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0194641  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1480  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  45.59 
 
 
255 aa  63.9  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.292437  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.96 
 
 
308 aa  62.4  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.96 
 
 
308 aa  62.4  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2942  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.82 
 
 
286 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3036  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.29 
 
 
286 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0660763  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2398  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.23 
 
 
313 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.4 
 
 
283 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1200  DNA methylase N-4/N-6  41.1 
 
 
306 aa  59.7  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00320922  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0735  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.93 
 
 
330 aa  59.7  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.833245  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1300  adenine specific DNA methyltransferase, putative  60 
 
 
247 aa  58.9  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0117  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  43.59 
 
 
315 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00741013  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0701  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  52.08 
 
 
238 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2337  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.78 
 
 
334 aa  58.9  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.628508 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.05 
 
 
370 aa  58.5  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3051  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.36 
 
 
305 aa  58.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.766 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0913  site-specific DNA-methyltransferase  59.09 
 
 
173 aa  58.5  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1071  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.74 
 
 
391 aa  58.5  0.00000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6611  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  38.46 
 
 
396 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0283  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.75 
 
 
292 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.51 
 
 
293 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0940338  hitchhiker  0.00345461 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2608  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.28 
 
 
265 aa  57  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327193 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0013  putative methylase  29.49 
 
 
227 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  49.23 
 
 
368 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  45.28 
 
 
293 aa  57  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3343  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  60 
 
 
369 aa  57  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  hitchhiker  0.00000416126 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0686  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  50 
 
 
266 aa  56.2  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000562829  hitchhiker  2.64678e-17 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3340  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.29 
 
 
347 aa  56.2  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000107199  hitchhiker  0.000000355353 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  50 
 
 
436 aa  55.8  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1308  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  55.56 
 
 
253 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169451 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  37.97 
 
 
294 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1409  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  57.14 
 
 
243 aa  56.2  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  38.46 
 
 
294 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.97 
 
 
294 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  38.46 
 
 
294 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1962  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.58 
 
 
259 aa  55.5  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0420  site-specific DNA-methyltransferase  54.76 
 
 
243 aa  55.8  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3157  DNA methylase N-4/N-6  42.25 
 
 
266 aa  55.5  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2607  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  48.33 
 
 
237 aa  55.5  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000328335 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  37.97 
 
 
294 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  36.71 
 
 
294 aa  55.5  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  38.46 
 
 
294 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1486  site-specific DNA-methyltransferase  54.76 
 
 
243 aa  55.8  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  45.59 
 
 
382 aa  55.8  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  57.14 
 
 
373 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.08 
 
 
421 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2231  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  55.56 
 
 
369 aa  55.1  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0921492  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0050  putative methylase  27.57 
 
 
227 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000518664  normal  0.980078 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  37.18 
 
 
294 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  38.89 
 
 
380 aa  55.1  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.5 
 
 
330 aa  55.1  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.61 
 
 
379 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1402  DNA modification methylase-like  43.75 
 
 
264 aa  54.3  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  35.9 
 
 
311 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4064  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  36.84 
 
 
281 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.461209  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3617  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  47.92 
 
 
296 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0379764  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.97 
 
 
350 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0040014  hitchhiker  0.000116244 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2900  prophage MuMc02, DNA methyltransferase  54.35 
 
 
265 aa  53.9  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470723  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0469  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  49.21 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321742  normal  0.0206265 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0009  putative methylase  27.44 
 
 
227 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3181  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  50.82 
 
 
398 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  36.71 
 
 
294 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  46.67 
 
 
304 aa  53.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2649  DNA methylase N-4/N-6  45.9 
 
 
389 aa  53.1  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2196  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.21 
 
 
292 aa  53.5  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0646  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  50 
 
 
368 aa  53.5  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000621493  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.71 
 
 
425 aa  53.5  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2101  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  50.82 
 
 
376 aa  53.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.528087 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0043  putative methylase  27.44 
 
 
227 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.181539  normal  0.0471117 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3376  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  50.82 
 
 
370 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  36.78 
 
 
421 aa  53.1  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.61 
 
 
380 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1767  DNA methylase  40.62 
 
 
352 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000189808  hitchhiker  0.00347478 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1466  adenine-specific DNA-methyltransferase-like protein  31.33 
 
 
312 aa  53.1  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307706  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3151  DNA methylase  40.62 
 
 
352 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000168176  hitchhiker  0.000000000119452 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  59.52 
 
 
377 aa  53.1  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  45.9 
 
 
368 aa  53.1  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.47 
 
 
377 aa  52.8  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.220402  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2118  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  47.06 
 
 
395 aa  52.8  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32 
 
 
483 aa  53.1  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1848  DNA methylase  40.62 
 
 
352 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000193192  hitchhiker  0.0000000226376 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.11 
 
 
359 aa  52.8  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3505  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  49.18 
 
 
398 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.602417 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  60.98 
 
 
398 aa  52.8  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2333  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  46.15 
 
 
276 aa  52.4  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0137927 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.29 
 
 
284 aa  52.4  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1229  DNA methylase  34.12 
 
 
271 aa  52.4  0.000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1626  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  53.19 
 
 
284 aa  52  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0864  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.15 
 
 
299 aa  52  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2152  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.33 
 
 
265 aa  52  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1684  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.06 
 
 
835 aa  52  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.530875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1746  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.06 
 
 
835 aa  52  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.663869  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.32 
 
 
327 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0491  modification methylase BabI  44.44 
 
 
377 aa  51.6  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>