158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1193 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  100 
 
 
330 aa  692    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3059  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  65.31 
 
 
325 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1200  DNA methylase N-4/N-6  40.99 
 
 
306 aa  250  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00320922  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8236  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.26 
 
 
311 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0880  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.41 
 
 
753 aa  237  2e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.842424  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2353  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.65 
 
 
854 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.07 
 
 
883 aa  123  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0341  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.35 
 
 
881 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1684  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.01 
 
 
835 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.530875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1746  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.16 
 
 
835 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.663869  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2337  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  21.7 
 
 
334 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.628508 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0117  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.02 
 
 
315 aa  67  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00741013  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.29 
 
 
350 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0040014  hitchhiker  0.000116244 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0041  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.49 
 
 
441 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1468  site-specific DNA-methyltransferase  42.65 
 
 
372 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0054  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.9 
 
 
416 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.549481  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0119  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.65 
 
 
372 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3051  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.03 
 
 
305 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.766 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0828  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.78 
 
 
323 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.49 
 
 
293 aa  55.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2649  DNA methylase N-4/N-6  50 
 
 
389 aa  55.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0066  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.18 
 
 
372 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711822  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0192  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  21.92 
 
 
446 aa  55.8  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.151287  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0941  DNA methylase  32.91 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0525  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.18 
 
 
284 aa  55.5  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2384  DNA methylase  37.5 
 
 
232 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.114492  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  45.16 
 
 
368 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0735  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  19.94 
 
 
330 aa  53.9  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.833245  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  39.13 
 
 
239 aa  53.9  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1480  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.86 
 
 
255 aa  53.5  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.292437  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2196  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.83 
 
 
292 aa  53.5  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  39.71 
 
 
368 aa  53.5  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.43 
 
 
222 aa  53.1  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1670  DNA methylase  28.75 
 
 
378 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000519085  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1099  DNA modification methylase-like  21.14 
 
 
413 aa  52  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000152418  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1029  gp56  28.75 
 
 
378 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0905816  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0073  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.64 
 
 
429 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.68 
 
 
308 aa  52  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.68 
 
 
308 aa  52  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.36 
 
 
327 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  37.97 
 
 
377 aa  50.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0675  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.3 
 
 
416 aa  50.1  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  38.6 
 
 
294 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6843  putative RNA methylase  26.37 
 
 
305 aa  49.7  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223663  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0702  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.68 
 
 
367 aa  49.7  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0606262  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  38.6 
 
 
294 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  38.6 
 
 
294 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.6 
 
 
294 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0965  DNA methylase N-4/N-6  40.82 
 
 
379 aa  49.7  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  40.35 
 
 
294 aa  49.3  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.47 
 
 
398 aa  49.3  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  38.6 
 
 
294 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  40.35 
 
 
294 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  38.6 
 
 
294 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2101  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  48.78 
 
 
376 aa  49.3  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.528087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0875  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.25 
 
 
281 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000314247  unclonable  0.00000000054829 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2855  DNA methylase N-4/N-6  36 
 
 
285 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0194641  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0392  DNA methylase N-4/N-6  46.67 
 
 
367 aa  48.5  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.44 
 
 
359 aa  48.5  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.22 
 
 
382 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.71 
 
 
377 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.220402  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1810  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.51 
 
 
329 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729703  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0710  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  45.45 
 
 
396 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.256759 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4974  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.49 
 
 
597 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.44 
 
 
380 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2242  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.48 
 
 
329 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.310751  hitchhiker  0.0000644694 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  51.22 
 
 
373 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1597  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  47.83 
 
 
379 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111041 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1308  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.67 
 
 
253 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169451 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1848  DNA methylase  21.02 
 
 
352 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000193192  hitchhiker  0.0000000226376 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3151  DNA methylase  21.02 
 
 
352 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000168176  hitchhiker  0.000000000119452 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4367  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.86 
 
 
358 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  38.6 
 
 
294 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4087  putative RNA methylase  29.21 
 
 
329 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3014  DNA methylase N-4/N-6  32.89 
 
 
301 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.718378  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0413  modification methylase CcrMI  38.24 
 
 
378 aa  47.4  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4304  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.44 
 
 
874 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0132  putative methylase  35.14 
 
 
225 aa  47.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000100441 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0719  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  55.56 
 
 
368 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6680  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.48 
 
 
644 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000759129  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0491  modification methylase BabI  35.44 
 
 
377 aa  47  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0936  adenine specific DNA methylase MOD  29.67 
 
 
577 aa  47.4  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000403504  normal  0.65434 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3210  DNA methylase N-4/N-6  29.81 
 
 
367 aa  47.4  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3343  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.91 
 
 
369 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  hitchhiker  0.00000416126 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3617  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.68 
 
 
296 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0379764  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0495  modification methylase BabI  35.44 
 
 
386 aa  47  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.44 
 
 
379 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3340  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.47 
 
 
347 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000107199  hitchhiker  0.000000355353 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  20.97 
 
 
293 aa  46.6  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0940338  hitchhiker  0.00345461 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2126  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.54 
 
 
370 aa  47  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.48 
 
 
370 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0229  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.33 
 
 
399 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0324708 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2231  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.91 
 
 
369 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0921492  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.07 
 
 
283 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  36.73 
 
 
380 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1593  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.58 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0446322  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2784  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.33 
 
 
282 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0534146  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1440  DNA methylase  37.31 
 
 
348 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.294057  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0442  putative RNA methylase  33.33 
 
 
258 aa  45.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3650  putative methyltransferase  36.84 
 
 
294 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000365024  hitchhiker  0.00241657 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>