210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0442 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0442  putative RNA methylase  100 
 
 
258 aa  528  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2383  DNA modification methylase-like protein  30.86 
 
 
307 aa  122  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.389013  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0021  DNA modification methylase-like protein  30.74 
 
 
481 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2920  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.75 
 
 
309 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0871  hypothetical protein  29.52 
 
 
281 aa  99.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.41 
 
 
368 aa  77.8  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.38 
 
 
375 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000888828  hitchhiker  0.0000001156 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.35 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0490664  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.31 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0038  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.44 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  22.89 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0884  DNA methylase N-4/N-6  35.87 
 
 
451 aa  65.9  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.946324  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1511  DNA methylase N-4/N-6  24.3 
 
 
329 aa  64.7  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0953  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.48 
 
 
372 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0675  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40 
 
 
416 aa  63.2  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0004  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.43 
 
 
396 aa  62.8  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.0090313 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0286  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40 
 
 
271 aa  62.8  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684049  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0117  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.37 
 
 
315 aa  62.4  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00741013  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0041  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.62 
 
 
441 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0114  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.31 
 
 
353 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1982  DNA-methyltransferase (DNA-modification methylase) protein  37.11 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0159066 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0460  putative RNA methylase  24.02 
 
 
259 aa  60.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.258821  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2118  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.21 
 
 
395 aa  60.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0022  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.58 
 
 
412 aa  61.2  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1172  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.59 
 
 
366 aa  59.7  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2337  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.46 
 
 
334 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.628508 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1038  putative RNA methylase  23.96 
 
 
249 aa  60.1  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4621  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35 
 
 
283 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0315645  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  35.05 
 
 
311 aa  59.3  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0680  N-6 adenine-specific DNA methylase  34.31 
 
 
259 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3349  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34 
 
 
283 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206831  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0469  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  47.69 
 
 
256 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321742  normal  0.0206265 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0735  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.59 
 
 
330 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.833245  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1720  N-6 adenine-specific DNA methylase  34.34 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0768  DNA methylase  34.34 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2124  DNA methylase N-4/N-6  34.34 
 
 
283 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775437  normal  0.0115493 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1402  DNA modification methylase-like  35.44 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4408  DNA methylase N-4/N-6  34.34 
 
 
283 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2136  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.11 
 
 
273 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05110  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40 
 
 
386 aa  57.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3959  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.34 
 
 
283 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135356  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1650  N-6 adenine-specific DNA methylase  34.34 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1859  N-6 adenine-specific DNA methylase  34.34 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.229539  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1626  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.08 
 
 
284 aa  57.4  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2444  DNA modification methylase RsrI  34.34 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.462592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2306  DNA modification methylase RsrI  34.34 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.436701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0530  DNA modification methylase RsrI  34.34 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3569  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.34 
 
 
283 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2419  hypothetical protein  25.28 
 
 
361 aa  57  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0768  hypothetical protein  41.67 
 
 
262 aa  57  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000323613 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6841  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.67 
 
 
301 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3854  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33 
 
 
283 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.78 
 
 
283 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2242  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.7 
 
 
329 aa  55.8  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.310751  hitchhiker  0.0000644694 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4192  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.71 
 
 
267 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.291791 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3838  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.9 
 
 
311 aa  55.8  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0283  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.81 
 
 
292 aa  55.8  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1809  DNA modification methylase-like protein  42.31 
 
 
273 aa  55.5  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0088  putative DNA methylase protein  27.45 
 
 
217 aa  55.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.346919 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1812  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.48 
 
 
273 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1099  DNA modification methylase-like  30.07 
 
 
413 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000152418  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1639  DNA methylase N-4/N-6  38.89 
 
 
432 aa  55.5  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.85 
 
 
308 aa  55.5  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.85 
 
 
308 aa  55.5  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0054  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.62 
 
 
416 aa  55.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.549481  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.66 
 
 
305 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3051  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.65 
 
 
305 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.766 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4513  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.54 
 
 
279 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0040831  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0875  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.27 
 
 
281 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000314247  unclonable  0.00000000054829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1810  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.16 
 
 
329 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729703  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  35.96 
 
 
304 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2104  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.86 
 
 
269 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.636734  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.84 
 
 
471 aa  53.9  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4087  putative RNA methylase  25.57 
 
 
329 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1670  DNA methyltransferase  38.27 
 
 
380 aa  53.9  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3617  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.58 
 
 
296 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0379764  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01365  DNA methylase  44.78 
 
 
236 aa  53.5  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.255281  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3340  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.91 
 
 
347 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000107199  hitchhiker  0.000000355353 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2880  putative modification methylase  32.63 
 
 
301 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150564  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0073  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.62 
 
 
429 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0627  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.68 
 
 
274 aa  53.1  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0192  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40 
 
 
446 aa  53.1  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.151287  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  42.03 
 
 
239 aa  52.8  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.79 
 
 
359 aa  52.8  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1480  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.78 
 
 
255 aa  53.1  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.292437  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2525  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.76 
 
 
396 aa  52.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000796245  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1741  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.74 
 
 
158 aa  52.4  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.902503  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0951  DNA methylase  30.59 
 
 
250 aa  52.4  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000000248697  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.54 
 
 
483 aa  52.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3152  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.22 
 
 
359 aa  52  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0037  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.3 
 
 
325 aa  52  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000954073 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.63 
 
 
284 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0019  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.81 
 
 
327 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.846659  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2654  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  34.72 
 
 
447 aa  51.2  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2240  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.04 
 
 
356 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0162757  hitchhiker  0.0000599239 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2608  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  43.08 
 
 
265 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6843  putative RNA methylase  26.11 
 
 
305 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223663  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  35.38 
 
 
416 aa  50.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1466  adenine-specific DNA-methyltransferase-like protein  29.41 
 
 
312 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307706  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.62 
 
 
293 aa  50.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>