253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4304 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4304  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  100 
 
 
874 aa  1815    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3014  DNA methylase N-4/N-6  53.68 
 
 
301 aa  376  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.718378  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3185  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  51.98 
 
 
394 aa  349  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3337  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  48.77 
 
 
345 aa  321  5e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149909  unclonable  0.0000000199825 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0454  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  43.44 
 
 
329 aa  313  6.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.558336  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1593  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  46.06 
 
 
308 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0446322  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3519  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  45.76 
 
 
331 aa  298  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000244279  normal  0.486943 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  47.83 
 
 
313 aa  297  5e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.304507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4803  DNA methylase  44.58 
 
 
322 aa  270  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1044  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.9 
 
 
330 aa  254  6e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0407  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.41 
 
 
338 aa  251  6e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0646308  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2196  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.23 
 
 
292 aa  131  7.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4984  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.18 
 
 
412 aa  130  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.677083  normal  0.015231 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.62 
 
 
293 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.23 
 
 
293 aa  127  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0940338  hitchhiker  0.00345461 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.15 
 
 
284 aa  127  9e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4974  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.61 
 
 
597 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2333  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.22 
 
 
276 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0137927 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0627  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.47 
 
 
274 aa  112  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4481  DNA methylase N-4/N-6  26.61 
 
 
416 aa  112  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5389  DNA methylase N-4/N-6  26.61 
 
 
355 aa  108  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.352939 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0277  hypothetical protein  26.91 
 
 
413 aa  98.2  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.294361  normal  0.0427595 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.55 
 
 
283 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0875  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.48 
 
 
281 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000314247  unclonable  0.00000000054829 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.77 
 
 
377 aa  72  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.220402  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0491  modification methylase BabI  25.3 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0495  modification methylase BabI  25.61 
 
 
386 aa  71.6  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.24 
 
 
398 aa  71.2  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.55 
 
 
359 aa  70.9  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  24.62 
 
 
377 aa  70.1  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1272  DNA methylase  23.43 
 
 
349 aa  69.7  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.342929  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.77 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4513  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.76 
 
 
279 aa  68.9  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0040831  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  45.83 
 
 
379 aa  68.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  45.21 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0965  DNA methylase N-4/N-6  40.96 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1221  modification methylase, putative  40.91 
 
 
204 aa  66.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000763333  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.59 
 
 
370 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3210  DNA methylase N-4/N-6  33.63 
 
 
367 aa  65.1  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.77 
 
 
373 aa  64.3  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3617  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.64 
 
 
296 aa  63.9  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0379764  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  40.54 
 
 
368 aa  63.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1173  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.11 
 
 
389 aa  63.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0066  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.89 
 
 
372 aa  63.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711822  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1263  DNA methylase  22.34 
 
 
349 aa  62.4  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00126419  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3343  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.33 
 
 
369 aa  62.4  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  hitchhiker  0.00000416126 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2231  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.33 
 
 
369 aa  62.4  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0921492  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1218  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.52 
 
 
376 aa  62  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1440  DNA methylase  21.58 
 
 
348 aa  62  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.294057  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3573  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.09 
 
 
306 aa  61.2  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.116756  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  37.35 
 
 
380 aa  61.2  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.1 
 
 
471 aa  60.5  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0392  DNA methylase N-4/N-6  22.15 
 
 
367 aa  60.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2649  DNA methylase N-4/N-6  40 
 
 
389 aa  60.8  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0708  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.54 
 
 
545 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40 
 
 
222 aa  60.8  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1468  site-specific DNA-methyltransferase  39.19 
 
 
372 aa  59.7  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2101  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.02 
 
 
376 aa  60.1  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.528087 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0413  modification methylase CcrMI  43.84 
 
 
378 aa  60.1  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0119  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.19 
 
 
372 aa  59.7  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1449  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.06 
 
 
360 aa  60.1  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.103238  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3181  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.39 
 
 
398 aa  58.9  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  43.94 
 
 
294 aa  58.9  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1597  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.48 
 
 
379 aa  58.9  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111041 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1767  DNA methylase  22.47 
 
 
352 aa  58.5  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000189808  hitchhiker  0.00347478 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1848  DNA methylase  22.28 
 
 
352 aa  58.2  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000193192  hitchhiker  0.0000000226376 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3151  DNA methylase  22.28 
 
 
352 aa  58.2  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000168176  hitchhiker  0.000000000119452 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1466  adenine-specific DNA-methyltransferase-like protein  45.9 
 
 
312 aa  57.8  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307706  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4169  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.03 
 
 
379 aa  57.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  37.65 
 
 
294 aa  57.8  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3505  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.39 
 
 
398 aa  57.8  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.602417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3051  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.46 
 
 
305 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3376  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.39 
 
 
370 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0763  DNA adenine methylase CcrM  44.62 
 
 
372 aa  57.4  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  37.65 
 
 
294 aa  57.4  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.65 
 
 
294 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0702  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.3 
 
 
367 aa  56.6  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0606262  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  37.65 
 
 
294 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  42.42 
 
 
294 aa  56.2  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  42.42 
 
 
294 aa  56.2  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  42.42 
 
 
294 aa  56.2  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4366  DNA methylase N-4/N-6  31.62 
 
 
377 aa  56.2  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.436205  normal  0.0199247 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  42.42 
 
 
294 aa  56.2  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2150  DNA methylase  24.41 
 
 
349 aa  55.8  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000209549  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.47 
 
 
368 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1073  DNA methylase N-4/N-6  21.88 
 
 
377 aa  55.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981822  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1200  DNA methylase N-4/N-6  21.25 
 
 
377 aa  55.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2756  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.36 
 
 
311 aa  55.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1480  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.58 
 
 
255 aa  55.1  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.292437  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4169  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.91 
 
 
553 aa  55.1  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1491  adenine specific DNA-methyltransferase  36.36 
 
 
779 aa  55.1  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00364069  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1444  DNA methylase  24.41 
 
 
349 aa  55.1  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.3 
 
 
327 aa  55.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2240  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.84 
 
 
356 aa  55.1  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0162757  hitchhiker  0.0000599239 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  41.27 
 
 
441 aa  54.7  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2603  DNA methylase N-4/N-6  40 
 
 
376 aa  54.7  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.592749  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.26 
 
 
308 aa  54.7  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0686  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.03 
 
 
266 aa  54.7  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000562829  hitchhiker  2.64678e-17 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.26 
 
 
308 aa  54.7  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2196  DNA methylase  24.41 
 
 
391 aa  54.3  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000872225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>