More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2196 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1444  DNA methylase  96.78 
 
 		 349 aa  697    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1848  DNA methylase  93.64 
 
 		 352 aa  685    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000193192  hitchhiker  0.0000000226376 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3151  DNA methylase  93.64 
 
 		 352 aa  685    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000168176  hitchhiker  0.000000000119452 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1767  DNA methylase  91.33 
 
 		 352 aa  672    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000189808  hitchhiker  0.00347478 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2196  DNA methylase  100 
 
 		 391 aa  818    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000872225  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2150  DNA methylase  91.81 
 
 		 349 aa  664    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000209549  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1272  DNA methylase  87.72 
 
 		 349 aa  642    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.342929  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1263  DNA methylase  95.03 
 
 		 349 aa  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00126419  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1440  DNA methylase  83.82 
 
 		 348 aa  617  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.294057  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2250  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  72.09 
 
 		 348 aa  550  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0370672 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0037  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.96 
 
 		 325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000954073 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0019  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.45 
 
 		 327 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.846659  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4645  nitrite extrusion protein 2  93.88 
 
 		 49 aa  99.4  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0900  nitrite extrusion protein 2  93.88 
 
 		 49 aa  99  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2132  nitrite extrusion protein 2  73.53 
 
 		 67 aa  98.6  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.609003  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1566  nitrite extrusion protein 2  97.83 
 
 		 47 aa  97.4  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3994  nitrite extrusion protein 2  90.38 
 
 		 54 aa  97.8  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1951  nitrite extrusion protein 2  100 
 
 		 48 aa  97.1  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3273  nitrite extrusion protein 2  100 
 
 		 51 aa  97.1  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4300  nitrite extrusion protein 2  97.87 
 
 		 50 aa  97.1  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0389  nitrite extrusion protein 2  100 
 
 		 48 aa  96.7  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1123  hypothetical protein  93.88 
 
 		 315 aa  96.3  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  33.59 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6680  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.69 
 
 		 644 aa  73.2  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000759129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  35.87 
 
 		 311 aa  72.4  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.76 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6841  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.07 
 
 		 301 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2124  DNA methylase N-4/N-6  36.89 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775437  normal  0.0115493 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2880  putative modification methylase  35.71 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150564  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3349  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.92 
 
 		 283 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3854  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.92 
 
 		 283 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1982  DNA-methyltransferase (DNA-modification methylase) protein  35.87 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0159066 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1812  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.87 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3569  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4408  DNA methylase N-4/N-6  37 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3959  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135356  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2136  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.87 
 
 		 273 aa  67  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4621  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.1 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0315645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0680  N-6 adenine-specific DNA methylase  38.04 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1720  N-6 adenine-specific DNA methylase  34.95 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0768  DNA methylase  36.96 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1650  N-6 adenine-specific DNA methylase  34.95 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1859  N-6 adenine-specific DNA methylase  34.95 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.229539  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2444  DNA modification methylase RsrI  34.95 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.462592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2306  DNA modification methylase RsrI  34.95 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.436701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0530  DNA modification methylase RsrI  34.95 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0197  hypothetical protein  24.32 
 
 		 646 aa  63.9  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.18 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  54.55 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0828  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.29 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5436  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  45.71 
 
 		 707 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.81891 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.03 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3766  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.43 
 
 		 599 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0871751  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3192  type III restriction-modification system, Mod subunit  41.67 
 
 		 751 aa  60.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.854684  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3628  DNA methylase N-4/N-6  25.43 
 
 		 599 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2793  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.67 
 
 		 751 aa  60.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3531  putative methyltransferase  38.55 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.158156 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1491  adenine specific DNA-methyltransferase  24.15 
 
 		 779 aa  60.1  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00364069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0547  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.82 
 
 		 752 aa  60.1  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.392041  normal  0.581045 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0120  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.03 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2670  DNA methylase N-4/N-6  36.36 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000248914  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.71 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  36.71 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0951  DNA methylase  38.03 
 
 		 250 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000000248697  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  36.71 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  44.83 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  33.68 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1319  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.19 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000125948 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  41.94 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  35.48 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1080  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  42.31 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  36.71 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  36.71 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0869  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.55 
 
 		 505 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1670  DNA methylase  46.88 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000519085  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1029  gp56  45.45 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0905816  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.67 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4286  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  55.1 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3650  putative methyltransferase  31.96 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000365024  hitchhiker  0.00241657 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3747  putative methyltransferase  31.96 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00189132  normal  0.187537 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  34.41 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3577  putative methyltransferase  31.96 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00742062  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3684  putative methyltransferase  31.96 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220289  normal  0.0704128 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4367  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.39 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3578  putative methyltransferase  31.96 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0177776  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1911  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.26 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0124  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  42.31 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3051  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.36 
 
 		 305 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.766 
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  35.85 
 
 		 409 aa  57  0.0000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0132  putative methylase  47.89 
 
 		 225 aa  57  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000100441 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1294  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.21 
 
 		 1015 aa  56.6  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474007  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4096  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.07 
 
 		 545 aa  56.6  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.480555 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1043  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  50 
 
 		 733 aa  56.6  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1962  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.71 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1471  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.19 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.8 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0594  prophage LambdaW4, DNA methylase  34.91 
 
 		 408 aa  56.2  0.0000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0766546  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3357  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.54 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1392  putative type II DNA modification enzyme (methyltransferase)  36.71 
 
 		 351 aa  55.8  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0204297  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  26.67 
 
 		 436 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>