More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3617 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3617  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  100 
 
 
296 aa  618  1e-176  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0379764  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3353  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  63.54 
 
 
314 aa  363  2e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2825  DNA methylase N-4/N-6  40 
 
 
373 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0864  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43 
 
 
299 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0646  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.26 
 
 
368 aa  243  3e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000621493  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2524  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.94 
 
 
368 aa  239  4e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000139446  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2345  DNA methylase N-4/N-6  41.67 
 
 
330 aa  238  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0319452  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1062  DNA binding domain protein, excisionase family  39.23 
 
 
365 aa  235  6e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00013023  unclonable  0.00000741257 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3152  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.5 
 
 
359 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1670  DNA methylase  35.26 
 
 
378 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000519085  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1029  gp56  36.02 
 
 
378 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0905816  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7332  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.21 
 
 
345 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000215646  hitchhiker  0.0000000024237 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1434  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.24 
 
 
345 aa  209  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.927906  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2240  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.21 
 
 
356 aa  206  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0162757  hitchhiker  0.0000599239 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4634  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.36 
 
 
352 aa  202  7e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4183  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.5 
 
 
370 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  hitchhiker  0.00000333681 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1670  DNA methyltransferase  36.83 
 
 
380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4235  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.91 
 
 
459 aa  189  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0833  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.33 
 
 
302 aa  175  8e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0560  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.45 
 
 
323 aa  172  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2670  DNA methylase N-4/N-6  39.73 
 
 
388 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000248914  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4169  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  53.15 
 
 
379 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6269  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.73 
 
 
333 aa  156  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2404  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.36 
 
 
305 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2446  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.57 
 
 
379 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.370845  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0702  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31 
 
 
367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0606262  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0941  DNA methylase  31.86 
 
 
309 aa  125  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1367  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.06 
 
 
360 aa  122  9e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2196  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.66 
 
 
292 aa  118  9e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2300  DNA methylase N-4/N-6  30.03 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.599897  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.47 
 
 
373 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  29.59 
 
 
377 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.03 
 
 
379 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4513  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.56 
 
 
279 aa  116  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0040831  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0627  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.19 
 
 
274 aa  116  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1626  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.94 
 
 
284 aa  116  5e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.61 
 
 
380 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4974  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.26 
 
 
597 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0675  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.11 
 
 
416 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.77 
 
 
293 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0940338  hitchhiker  0.00345461 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.86 
 
 
293 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0571  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.88 
 
 
361 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032193 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2649  DNA methylase N-4/N-6  29.45 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.19 
 
 
370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1468  site-specific DNA-methyltransferase  29.11 
 
 
372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3210  DNA methylase N-4/N-6  29.45 
 
 
367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0119  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.11 
 
 
372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.58 
 
 
284 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2333  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.56 
 
 
276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0137927 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1810  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.87 
 
 
329 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729703  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2231  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.07 
 
 
369 aa  112  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0921492  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3343  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.07 
 
 
369 aa  112  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  hitchhiker  0.00000416126 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0413  modification methylase CcrMI  29.19 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.69 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0066  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.77 
 
 
372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711822  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0229  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.77 
 
 
399 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0324708 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.16 
 
 
368 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0054  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.18 
 
 
416 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.549481  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2398  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.18 
 
 
313 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.22 
 
 
382 aa  109  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  26.15 
 
 
311 aa  109  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0073  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30 
 
 
429 aa  109  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2101  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.74 
 
 
376 aa  109  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.528087 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  29.66 
 
 
380 aa  109  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0965  DNA methylase N-4/N-6  28.37 
 
 
379 aa  108  9.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1982  DNA-methyltransferase (DNA-modification methylase) protein  28.57 
 
 
270 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0159066 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0875  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.1 
 
 
281 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000314247  unclonable  0.00000000054829 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  28.08 
 
 
368 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2242  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.59 
 
 
329 aa  106  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.310751  hitchhiker  0.0000644694 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3296  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.76 
 
 
253 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.912166  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.85 
 
 
377 aa  106  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.220402  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4367  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.42 
 
 
358 aa  106  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  31.45 
 
 
294 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  31.1 
 
 
294 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3043  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.99 
 
 
375 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00264807  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1593  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.93 
 
 
308 aa  104  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0446322  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0491  modification methylase BabI  27.52 
 
 
377 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  31.45 
 
 
294 aa  104  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.24 
 
 
308 aa  104  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  31.45 
 
 
294 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3008  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.99 
 
 
370 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.367581 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.24 
 
 
308 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0495  modification methylase BabI  27.52 
 
 
386 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  31.45 
 
 
294 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1812  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.96 
 
 
273 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0719  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.06 
 
 
368 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  31.45 
 
 
294 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  31.45 
 
 
294 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.1 
 
 
294 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  26.35 
 
 
304 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2136  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.5 
 
 
273 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.92 
 
 
359 aa  103  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3838  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.18 
 
 
311 aa  102  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0392  DNA methylase N-4/N-6  28.04 
 
 
367 aa  102  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  30.74 
 
 
294 aa  102  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0041  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.88 
 
 
441 aa  102  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2525  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.36 
 
 
396 aa  102  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000796245  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0710  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.87 
 
 
396 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.256759 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3181  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.23 
 
 
398 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6841  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.08 
 
 
301 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>