More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1440 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3151  DNA methylase  85.55 
 
 
352 aa  641    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000168176  hitchhiker  0.000000000119452 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1848  DNA methylase  85.55 
 
 
352 aa  641    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000193192  hitchhiker  0.0000000226376 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1263  DNA methylase  85.84 
 
 
349 aa  641    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00126419  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1767  DNA methylase  85.26 
 
 
352 aa  640    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000189808  hitchhiker  0.00347478 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1444  DNA methylase  85.84 
 
 
349 aa  642    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2150  DNA methylase  85.84 
 
 
349 aa  640    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000209549  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1272  DNA methylase  90.17 
 
 
349 aa  671    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.342929  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1440  DNA methylase  100 
 
 
348 aa  734    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.294057  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2196  DNA methylase  83.82 
 
 
391 aa  617  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000872225  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2250  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  74.71 
 
 
348 aa  570  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0370672 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0037  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.79 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000954073 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0019  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.99 
 
 
327 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.846659  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6680  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.88 
 
 
644 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000759129  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.18 
 
 
305 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  36.36 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  30.17 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2124  DNA methylase N-4/N-6  39 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775437  normal  0.0115493 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2880  putative modification methylase  36 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150564  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6841  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3854  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3569  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4408  DNA methylase N-4/N-6  39 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3349  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206831  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3959  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135356  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1812  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.46 
 
 
273 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2136  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.42 
 
 
273 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4621  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.14 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0315645  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1982  DNA-methyltransferase (DNA-modification methylase) protein  34.38 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0159066 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0680  N-6 adenine-specific DNA methylase  37 
 
 
259 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1720  N-6 adenine-specific DNA methylase  36 
 
 
282 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0768  DNA methylase  36 
 
 
258 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1670  DNA methyltransferase  23.5 
 
 
380 aa  68.9  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0530  DNA modification methylase RsrI  36 
 
 
282 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1650  N-6 adenine-specific DNA methylase  36 
 
 
282 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1859  N-6 adenine-specific DNA methylase  36 
 
 
282 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.229539  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2306  DNA modification methylase RsrI  36 
 
 
282 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.436701  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2444  DNA modification methylase RsrI  36 
 
 
282 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.462592  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0951  DNA methylase  41.43 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000000248697  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0708  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.87 
 
 
545 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2240  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.78 
 
 
356 aa  66.6  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0162757  hitchhiker  0.0000599239 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  56.36 
 
 
327 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0197  hypothetical protein  22.98 
 
 
646 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1294  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.35 
 
 
1015 aa  65.1  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474007  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1491  adenine specific DNA-methyltransferase  23.83 
 
 
779 aa  64.3  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00364069  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  47.44 
 
 
225 aa  64.7  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2706  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.65 
 
 
438 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0547  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.37 
 
 
752 aa  63.2  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.392041  normal  0.581045 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3192  type III restriction-modification system, Mod subunit  40 
 
 
751 aa  63.2  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.854684  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2793  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40 
 
 
751 aa  63.2  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  35.42 
 
 
294 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  35.42 
 
 
294 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3577  putative methyltransferase  32.04 
 
 
294 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00742062  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  34.38 
 
 
294 aa  62  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  35.42 
 
 
294 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  35.42 
 
 
294 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3684  putative methyltransferase  32.04 
 
 
294 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220289  normal  0.0704128 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1319  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.62 
 
 
258 aa  62.4  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000125948 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  35.42 
 
 
294 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3650  putative methyltransferase  32.04 
 
 
294 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000365024  hitchhiker  0.00241657 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  35.42 
 
 
294 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3747  putative methyltransferase  32.04 
 
 
294 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00189132  normal  0.187537 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3531  putative methyltransferase  34 
 
 
283 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.158156 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3578  putative methyltransferase  32.04 
 
 
294 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0177776  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4304  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.58 
 
 
874 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.38 
 
 
294 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0120  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.25 
 
 
225 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  34.38 
 
 
294 aa  61.2  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0828  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.25 
 
 
323 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1080  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  54.72 
 
 
305 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0594  prophage LambdaW4, DNA methylase  35.58 
 
 
408 aa  60.1  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0766546  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1670  DNA methylase  37.84 
 
 
378 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000519085  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4183  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.96 
 
 
370 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  hitchhiker  0.00000333681 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4286  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.03 
 
 
447 aa  60.1  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1029  gp56  37.84 
 
 
378 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0905816  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1962  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.68 
 
 
259 aa  59.7  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2670  DNA methylase N-4/N-6  36.36 
 
 
388 aa  59.7  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000248914  normal 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  45 
 
 
419 aa  59.7  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  35.58 
 
 
409 aa  59.7  0.00000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2231  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.9 
 
 
369 aa  59.3  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0921492  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0124  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  54.72 
 
 
303 aa  59.3  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3357  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.67 
 
 
225 aa  59.3  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3343  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.76 
 
 
369 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  hitchhiker  0.00000416126 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3157  DNA methylase N-4/N-6  43.66 
 
 
266 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1471  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.86 
 
 
276 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  41.54 
 
 
239 aa  58.9  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  41.27 
 
 
377 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  47.17 
 
 
380 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1392  putative type II DNA modification enzyme (methyltransferase)  41.1 
 
 
351 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0204297  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0655  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.77 
 
 
442 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000525307  normal  0.106062 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  47.17 
 
 
379 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.27 
 
 
377 aa  58.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.220402  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5436  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  41.67 
 
 
707 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.81891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3519  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  21.8 
 
 
331 aa  57.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000244279  normal  0.486943 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2332  DNA adenine methylase CcrM  50 
 
 
344 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.160434  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0355  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  46.48 
 
 
289 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0550  site-specific DNA-methyltransferase, putative  40 
 
 
250 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.20676  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1421  site-specific DNA-methyltransferase  44.83 
 
 
251 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.171704  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1911  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.93 
 
 
322 aa  57.8  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4634  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.12 
 
 
352 aa  57.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0988  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.02 
 
 
225 aa  57.8  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0151076  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>