47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4481 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007901  Rfer_4481  DNA methylase N-4/N-6  100 
 
 		 416 aa  862    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0277  hypothetical protein  51.15 
 
 		 413 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.294361  normal  0.0427595 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5389  DNA methylase N-4/N-6  49 
 
 		 355 aa  344  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.352939 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4984  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.11 
 
 		 412 aa  338  9e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.677083  normal  0.015231 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3337  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.42 
 
 		 345 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149909  unclonable  0.0000000199825 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1593  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.82 
 
 		 308 aa  150  4e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0446322  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.84 
 
 		 313 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.304507 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1044  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.85 
 
 		 330 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3519  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.17 
 
 		 331 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000244279  normal  0.486943 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3014  DNA methylase N-4/N-6  29.57 
 
 		 301 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.718378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3185  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.19 
 
 		 394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0454  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.72 
 
 		 329 aa  133  6.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.558336  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0407  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.21 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0646308  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4803  DNA methylase  27.81 
 
 		 322 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4304  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.61 
 
 		 874 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4974  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.69 
 
 		 597 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.05 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1221  modification methylase, putative  41.41 
 
 		 204 aa  67  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000763333  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2333  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.8 
 
 		 276 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0137927 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0627  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.8 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2196  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.74 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.09 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0940338  hitchhiker  0.00345461 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.35 
 
 		 284 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6265  hypothetical protein  43.75 
 
 		 80 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.73 
 
 		 471 aa  51.2  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2654  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  26.81 
 
 		 447 aa  50.4  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.17 
 
 		 308 aa  49.3  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.17 
 
 		 308 aa  49.3  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1055  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.73 
 
 		 849 aa  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000157491  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6856  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.75 
 
 		 313 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0555121 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1840  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.51 
 
 		 1019 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0062  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.51 
 
 		 1019 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.218127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1809  DNA modification methylase-like protein  40.3 
 
 		 273 aa  46.6  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4096  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.87 
 
 		 545 aa  47  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.480555 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1080  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  43.66 
 
 		 305 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1466  adenine-specific DNA-methyltransferase-like protein  22.34 
 
 		 312 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307706  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2276  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.88 
 
 		 403 aa  45.8  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0004  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.35 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0090313 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1085  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.71 
 
 		 540 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  26.33 
 
 		 441 aa  45.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1826  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.67 
 
 		 460 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478282 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1741  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.31 
 
 		 158 aa  43.9  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.902503  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.29 
 
 		 382 aa  43.9  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3210  DNA methylase N-4/N-6  29.17 
 
 		 367 aa  43.9  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3617  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.06 
 
 		 296 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0379764  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1650  modification methylase BslI  23.75 
 
 		 413 aa  43.1  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235232  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1229  DNA methylase  39.34 
 
 		 271 aa  43.1  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>