98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4087 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4087  putative RNA methylase  100 
 
 		 329 aa  660    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6843  putative RNA methylase  54.58 
 
 		 305 aa  301  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6722  putative RNA methylase  52.48 
 
 		 292 aa  271  8.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0021  DNA modification methylase-like protein  26.67 
 
 		 481 aa  69.3  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2734  hypothetical protein  32.77 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2539  hypothetical protein  31.95 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.55 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0490664  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1687  hypothetical protein  29.54 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00398874  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0871  hypothetical protein  28.38 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  20.07 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0038  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.3 
 
 		 257 aa  57  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1511  DNA methylase N-4/N-6  22.77 
 
 		 329 aa  57  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8574  hypothetical protein  29.78 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0679954  normal  0.110095 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2383  DNA modification methylase-like protein  28.49 
 
 		 307 aa  55.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.389013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2920  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.76 
 
 		 309 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.85 
 
 		 368 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  46 
 
 		 416 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0875  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.09 
 
 		 281 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000314247  unclonable  0.00000000054829 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0442  putative RNA methylase  25.57 
 
 		 258 aa  53.9  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4513  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.57 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0040831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  30.85 
 
 		 463 aa  52.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.3 
 
 		 375 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000888828  hitchhiker  0.0000001156 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0114  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.89 
 
 		 353 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  27.72 
 
 		 355 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4367  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.06 
 
 		 358 aa  50.1  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.62 
 
 		 308 aa  50.1  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.62 
 
 		 308 aa  50.1  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.94 
 
 		 327 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0953  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.88 
 
 		 372 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4192  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.38 
 
 		 267 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.291791 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0829  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.69 
 
 		 246 aa  49.3  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  28.57 
 
 		 315 aa  49.3  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4974  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.47 
 
 		 597 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.36 
 
 		 947 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.21 
 
 		 330 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  25.19 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2525  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.46 
 
 		 396 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000796245  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.19 
 
 		 372 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.62 
 
 		 382 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  26.36 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  32.29 
 
 		 483 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  31.9 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3059  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.58 
 
 		 325 aa  47.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  25.37 
 
 		 351 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0828  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.68 
 
 		 323 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  25.37 
 
 		 350 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  40.3 
 
 		 368 aa  46.6  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0203  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.04 
 
 		 319 aa  46.6  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0460  putative RNA methylase  28.24 
 
 		 259 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.258821  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002448  hypothetical protein  33.77 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1038  putative RNA methylase  28.8 
 
 		 249 aa  45.8  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1982  DNA-methyltransferase (DNA-modification methylase) protein  28.07 
 
 		 270 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0159066 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1440  DNA methylase  45.1 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.294057  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1810  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.96 
 
 		 329 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  24.63 
 
 		 350 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2242  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.35 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.310751  hitchhiker  0.0000644694 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3008  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.77 
 
 		 370 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.367581 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1611  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.82 
 
 		 226 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.1 
 
 		 368 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.27 
 
 		 379 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  27.27 
 
 		 535 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2337  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.78 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.628508 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1263  DNA methylase  52 
 
 		 349 aa  43.9  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00126419  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3357  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  47.27 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  42 
 
 		 412 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.33 
 
 		 524 aa  44.3  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  42.86 
 
 		 418 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1580  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.63 
 
 		 570 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  36.11 
 
 		 407 aa  44.3  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  27.59 
 
 		 317 aa  43.9  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2487  hypothetical protein  53.66 
 
 		 328 aa  43.9  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2689  N-6 DNA methylase  30.38 
 
 		 709 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.227134 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0009  putative methylase  35.94 
 
 		 227 aa  43.9  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0050  putative methylase  35.94 
 
 		 227 aa  43.9  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000518664  normal  0.980078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31 
 
 		 483 aa  43.9  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0043  putative methylase  35.94 
 
 		 227 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.181539  normal  0.0471117 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.5 
 
 		 380 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1044  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.5 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2101  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.81 
 
 		 376 aa  43.5  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.528087 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2250  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.14 
 
 		 348 aa  43.1  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0370672 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.48 
 
 		 350 aa  43.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0040014  hitchhiker  0.000116244 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  36.92 
 
 		 540 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1444  DNA methylase  50 
 
 		 349 aa  43.5  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4086  hypothetical protein  31.18 
 
 		 264 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0014284  normal  0.0315701 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  38.03 
 
 		 377 aa  43.1  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.06 
 
 		 883 aa  43.1  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0833  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.1 
 
 		 302 aa  43.1  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  22.14 
 
 		 310 aa  43.1  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2240  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.81 
 
 		 356 aa  43.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0162757  hitchhiker  0.0000599239 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2196  DNA methylase  50 
 
 		 391 aa  42.7  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000872225  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0120  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  55.26 
 
 		 225 aa  42.7  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0408  putative RNA methylase  27.04 
 
 		 334 aa  42.7  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1590  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.6 
 
 		 385 aa  42.7  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278078  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1681  cyclase family protein  42.5 
 
 		 366 aa  42.7  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.259173  hitchhiker  0.0000210949 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2384  DNA methylase  30.99 
 
 		 232 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.114492  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1720  putative RNA methylase  28.28 
 
 		 333 aa  42.4  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0118315  decreased coverage  0.000010347 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  31 
 
 		 436 aa  42.7  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1626  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.21 
 
 		 284 aa  42.4  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>