138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1775 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  100 
 
 		 315 aa  636    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  31.45 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  28.91 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  31.84 
 
 		 351 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  32.39 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  28.24 
 
 		 364 aa  98.2  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  32.09 
 
 		 310 aa  96.7  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  33.92 
 
 		 367 aa  94.4  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  30.31 
 
 		 355 aa  92.4  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  29.26 
 
 		 318 aa  91.7  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  27.71 
 
 		 317 aa  90.9  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  33.14 
 
 		 343 aa  87.4  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  26.99 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  26.25 
 
 		 322 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1789  putative RNA methylase  31.63 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  22.64 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  22.96 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  29.94 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  27.59 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2630  putative RNA methylase  27.65 
 
 		 356 aa  72  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0592  putative RNA methylase  26.35 
 
 		 225 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0132  putative RNA methylase  25.97 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2015  putative RNA methylase  32.57 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  25.9 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1659  putative RNA methylase  26.44 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.69991  hitchhiker  0.00475931 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0686  putative RNA methylase  29.49 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0941  hypothetical protein  28.92 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4390  hypothetical protein  28.92 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.043324  unclonable  2.45562e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1080  hypothetical protein  28.92 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.118177  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0793  putative RNA methylase  28.31 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.314828  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0985  hypothetical protein  24.24 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0852  hypothetical protein  27.11 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0801  methyltransferase  27.7 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0987  hypothetical protein  27.7 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.86692e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0899  hypothetical protein  27.11 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000386994  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.33 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  56.76 
 
 		 535 aa  54.3  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2337  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.79 
 
 		 334 aa  53.9  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.628508 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  51.16 
 
 		 461 aa  54.3  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0151  putative RNA methylase  30.47 
 
 		 356 aa  53.5  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  51.35 
 
 		 524 aa  53.1  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6722  putative RNA methylase  24.65 
 
 		 292 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  27.33 
 
 		 359 aa  52.8  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1511  DNA methylase N-4/N-6  39.13 
 
 		 329 aa  52.8  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  23.6 
 
 		 336 aa  52  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0797  methyltransferase  25.17 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  36.25 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0442  putative RNA methylase  28.92 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0833  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.38 
 
 		 302 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  31.94 
 
 		 393 aa  50.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45681  predicted protein  28.1 
 
 		 591 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0282  putative RNA methylase:THUMP  24.18 
 
 		 380 aa  50.4  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377639  normal  0.859939 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0041  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.58 
 
 		 441 aa  50.4  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0286  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.88 
 
 		 271 aa  50.1  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.07 
 
 		 371 aa  49.7  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0490664  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  28.92 
 
 		 495 aa  49.3  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0953  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.18 
 
 		 372 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4087  putative RNA methylase  28.57 
 
 		 329 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37849  predicted protein  24.26 
 
 		 469 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00619482  hitchhiker  0.00164206 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  39.47 
 
 		 483 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1670  DNA methyltransferase  35.14 
 
 		 380 aa  48.9  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1984  putative RNA methylase  25.81 
 
 		 227 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2903  RNA methyltransferase, TrmA family  30.97 
 
 		 438 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6843  putative RNA methylase  27.96 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2562  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 227 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000154268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0460  putative RNA methylase  43.75 
 
 		 259 aa  47.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.258821  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  46.34 
 
 		 528 aa  46.6  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  28.92 
 
 		 266 aa  46.6  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1415  putative RNA methylase  22.27 
 
 		 374 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.941781  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  32.47 
 
 		 318 aa  46.6  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  45.24 
 
 		 475 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0022  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.82 
 
 		 412 aa  46.2  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  31.78 
 
 		 418 aa  45.8  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.54 
 
 		 372 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4183  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  54.29 
 
 		 370 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  hitchhiker  0.00000333681 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4192  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.43 
 
 		 267 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.291791 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0852  hypothetical protein  25.29 
 
 		 196 aa  45.8  0.0009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0871  hypothetical protein  25.25 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3431  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25 
 
 		 403 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2276  putative RNA methylase  21.09 
 
 		 349 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.88 
 
 		 947 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2993  putative RNA methylase  21.99 
 
 		 350 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1047  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25 
 
 		 403 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03498  oxidoreductase  26.5 
 
 		 364 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.906105  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  27.36 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0365  putative RNA methylase  29.49 
 
 		 161 aa  44.3  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01161  RNA methylase family protein  21.8 
 
 		 374 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  33.33 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1395  putative methyltransferase  24.32 
 
 		 175 aa  44.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.86 
 
 		 375 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000888828  hitchhiker  0.0000001156 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.19 
 
 		 234 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40 
 
 		 488 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1441  methyltransferase  24.32 
 
 		 175 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  32.89 
 
 		 264 aa  45.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2558  RNA methyltransferase, TrmA family  27.5 
 
 		 480 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2083  methyltransferase small  23.53 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2104  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.1 
 
 		 269 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.636734  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  32.89 
 
 		 264 aa  44.3  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0038  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.22 
 
 		 257 aa  44.3  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1471  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.55 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>