71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2993 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2993  putative RNA methylase  100 
 
 		 350 aa  699    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2276  putative RNA methylase  76.59 
 
 		 349 aa  517  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3585  putative RNA methylase  48.96 
 
 		 352 aa  296  4e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  hitchhiker  0.0000715951 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0253  putative RNA methylase  45.54 
 
 		 360 aa  279  5e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1582  putative RNA methylase  43.24 
 
 		 357 aa  243  5e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0171  putative RNA methylase  37.94 
 
 		 442 aa  172  7.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.316441  hitchhiker  0.00204483 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15560  predicted N6-adenine-specific DNA methylase  36.18 
 
 		 339 aa  166  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2582  putative RNA methylase  29.64 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2801  putative RNA methylase  30.15 
 
 		 368 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  35.71 
 
 		 359 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1026  putative RNA methylase  34.57 
 
 		 379 aa  90.5  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3569  putative RNA methylase  33.12 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1254  putative RNA methylase  26.42 
 
 		 330 aa  67  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00904523  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  27 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  25.91 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  30.94 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  28.4 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  28.99 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6055  Methyltransferase type 11  29.38 
 
 		 360 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0408  putative RNA methylase  24.07 
 
 		 334 aa  53.9  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  29.71 
 
 		 367 aa  53.1  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  30.19 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  30.3 
 
 		 351 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  32.23 
 
 		 350 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0282  putative RNA methylase:THUMP  26.02 
 
 		 380 aa  51.6  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377639  normal  0.859939 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1720  putative RNA methylase  23.4 
 
 		 333 aa  51.2  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0118315  decreased coverage  0.000010347 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  33.96 
 
 		 350 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1100  putative RNA methylase  25.22 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1236  putative RNA methylase  26 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  29.03 
 
 		 334 aa  51.2  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  28.1 
 
 		 374 aa  50.8  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1504  hypothetical protein  22.77 
 
 		 381 aa  50.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1533  hypothetical protein  22.77 
 
 		 381 aa  50.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  28.78 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3705  putative RNA methylase  24.79 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  26.01 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1015  hypothetical protein  21.78 
 
 		 378 aa  47  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.842194  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2283  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  22.46 
 
 		 749 aa  47.4  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.402285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00611  RNA methylase family protein  22.62 
 
 		 374 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  25.81 
 
 		 253 aa  47  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1038  putative RNA methylase  31.51 
 
 		 249 aa  47  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  25.81 
 
 		 253 aa  47  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  21.99 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2178  methyltransferase small  25.79 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.599131  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  32.65 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  29.6 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  33.75 
 
 		 233 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  36.49 
 
 		 340 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126777 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  26.42 
 
 		 161 aa  44.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  26.85 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2417  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.06 
 
 		 250 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327625 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.73 
 
 		 238 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  27.48 
 
 		 355 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1066  putative methyltransferase  26.88 
 
 		 273 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000495873  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0054  putative RNA methylase  22.32 
 
 		 374 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.86 
 
 		 237 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00768  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  23.56 
 
 		 711 aa  43.9  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192916  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  27.14 
 
 		 341 aa  43.9  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  28.79 
 
 		 283 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  28.04 
 
 		 365 aa  43.5  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  25.85 
 
 		 344 aa  43.1  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0793  hypothetical protein  35.06 
 
 		 182 aa  43.1  0.007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.290865  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 268 aa  43.1  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0729  putative methyltransferase  32.22 
 
 		 246 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1430  modification methylase, HemK family  28.33 
 
 		 273 aa  42.7  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000467016  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1789  putative RNA methylase  28.26 
 
 		 304 aa  43.1  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1492  methyltransferase small  32.35 
 
 		 207 aa  42.7  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3142  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  25.95 
 
 		 343 aa  42.7  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.764065  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4511  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  26.8 
 
 		 250 aa  42.7  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>