228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1504 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1015  hypothetical protein  87.8 
 
 
378 aa  707    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.842194  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1504  hypothetical protein  100 
 
 
381 aa  785    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1533  hypothetical protein  100 
 
 
381 aa  785    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2381  putative RNA methylase  57.98 
 
 
380 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1904  putative RNA methylase  56.49 
 
 
384 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1282  putative RNA methylase  54.13 
 
 
379 aa  424  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000499107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1484  putative RNA methylase  53.87 
 
 
379 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140153  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1690  hypothetical protein  52.8 
 
 
381 aa  412  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1468  hypothetical protein  52.8 
 
 
379 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1440  methyltransferase  52.8 
 
 
379 aa  412  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1441  methyltransferase  52.8 
 
 
379 aa  412  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00219601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1729  hypothetical protein  52.8 
 
 
379 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1584  hypothetical protein  52.8 
 
 
379 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1617  hypothetical protein  52.8 
 
 
379 aa  412  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.595181  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1654  hypothetical protein  52.8 
 
 
379 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0207358 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3727  hypothetical protein  52.8 
 
 
379 aa  413  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00339425  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0925  putative RNA methylase  50.79 
 
 
398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0287  putative RNA methylase  51.34 
 
 
379 aa  394  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2429  putative RNA methylase  50.4 
 
 
384 aa  392  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2939  putative RNA methylase  47.24 
 
 
390 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000322588  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0293  putative RNA methylase  49.47 
 
 
377 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.107871  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0971  putative RNA methylase  47.62 
 
 
384 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.143771  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3242  putative RNA methylase  47.61 
 
 
382 aa  371  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000019855  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1378  N6-adenine-specific DNA methylase  50.27 
 
 
377 aa  371  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0282  hypothetical protein  49.21 
 
 
388 aa  365  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.439028  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0028  hypothetical protein  47.11 
 
 
400 aa  363  2e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3084  putative RNA methylase  48.39 
 
 
378 aa  360  2e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08600  putative RNA methylase  46.9 
 
 
379 aa  359  4e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1081  N6-adenine-specific DNA methylase  48.14 
 
 
376 aa  351  1e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.117372  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0303  hypothetical protein  46.32 
 
 
384 aa  348  9e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00482447  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1020  N6-adenine-specific DNA methylase  45.7 
 
 
374 aa  343  4e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2102  putative methyltransferase  47.57 
 
 
375 aa  339  4e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1816  methyltransferase, putative  47.57 
 
 
375 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.961633  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0366  putative RNA methylase  45.12 
 
 
380 aa  329  5.0000000000000004e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203497  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4151  putative RNA methylase  45.45 
 
 
398 aa  328  1.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.949301  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1816  N6-adenine-specific DNA methylase  46.84 
 
 
384 aa  322  8e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0979861  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1763  putative RNA methylase  42.74 
 
 
371 aa  292  6e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1421  putative RNA methylase  39.04 
 
 
375 aa  256  3e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0398  putative RNA methylase:THUMP  35.14 
 
 
389 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0174402  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3086  hypothetical protein  33.88 
 
 
391 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2355  putative RNA methylase  34.05 
 
 
393 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00636349  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3994  putative RNA methylase  34.42 
 
 
375 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000218402  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1292  putative RNA methylase  30.98 
 
 
375 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.963614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1261  putative RNA methylase  30.98 
 
 
375 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0938  hypothetical protein  33.67 
 
 
403 aa  206  4e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.493272  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0477  putative RNA methylase  32.7 
 
 
376 aa  206  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.11 
 
 
712 aa  205  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0180  putative RNA methylase  34.96 
 
 
340 aa  204  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0494  putative RNA methylase  32.97 
 
 
376 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00380676 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.1 
 
 
711 aa  204  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.56 
 
 
709 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000568014  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.08 
 
 
709 aa  202  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2570  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.3 
 
 
709 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0113028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.3 
 
 
709 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1362  hypothetical protein  35.03 
 
 
484 aa  202  9.999999999999999e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.3 
 
 
709 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1236  putative RNA methylase  32.52 
 
 
385 aa  200  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2822  putative RNA methylase  31.91 
 
 
393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.54 
 
 
711 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2256  N6-adenine-specific DNA methylase  31.71 
 
 
369 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00159755  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1946  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.25 
 
 
711 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478167  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0249  putative RNA methylase  32.53 
 
 
374 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0789594  normal  0.0276638 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2283  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.06 
 
 
749 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.402285  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.03 
 
 
713 aa  191  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.03 
 
 
713 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.77 
 
 
713 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.32 
 
 
708 aa  189  5e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3705  putative RNA methylase  30.54 
 
 
387 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1018  putative RNA methylase  33.16 
 
 
377 aa  187  4e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2250  putative RNA methylase  31.89 
 
 
380 aa  186  6e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.959304  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2473  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.12 
 
 
711 aa  186  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00287682 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1032  putative RNA methylase  29.3 
 
 
399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0889  putative RNA methylase  30.98 
 
 
375 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3279  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.66 
 
 
715 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.77 
 
 
711 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2495  putative RNA methylase  31.64 
 
 
387 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256792  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03361  RNA methylase family protein  29.84 
 
 
374 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1263  N6-adenine-specific DNA methylase-like  31.72 
 
 
374 aa  180  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0245346  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1420  putative RNA methylase  31.44 
 
 
388 aa  180  4e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00712049  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1699  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.05 
 
 
722 aa  179  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2424  N6-adenine-specific DNA methylase  32.07 
 
 
398 aa  176  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0429  putative RNA methylase  29.27 
 
 
380 aa  176  6e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.000469504  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.21 
 
 
713 aa  176  9e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1739  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.8 
 
 
721 aa  176  9e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.876202  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0401  putative RNA methylase  32.35 
 
 
387 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1488  hypothetical protein  31.88 
 
 
393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00216876  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08561  putative N6-adenine-specific DNA methylase  30.54 
 
 
381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1743  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.55 
 
 
706 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.171189  hitchhiker  0.000865534 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0282  putative RNA methylase:THUMP  30.65 
 
 
380 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377639  normal  0.859939 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2641  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.9 
 
 
706 aa  173  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1987  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.9 
 
 
706 aa  173  5e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3009  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.8 
 
 
725 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30746  hitchhiker  0.0000000000188031 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2552  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.9 
 
 
706 aa  172  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02010  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.82 
 
 
699 aa  172  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.347097  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1112  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.75 
 
 
702 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000933928  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2005  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.72 
 
 
701 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.391349  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0623  putative RNA methylase  29.76 
 
 
432 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244531  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0196  putative RNA methylase  30.95 
 
 
395 aa  169  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.289998 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3255  RNA methylase family protein  29.92 
 
 
392 aa  168  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.710684  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00768  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.97 
 
 
711 aa  168  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>