153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1059 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  100 
 
 		 317 aa  633  1e-180  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  60.44 
 
 		 322 aa  392  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  56.96 
 
 		 318 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  51.42 
 
 		 317 aa  323  2e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  47.78 
 
 		 317 aa  310  2e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  39.24 
 
 		 344 aa  219  3e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  39.13 
 
 		 355 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  38.84 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  36.42 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  37.84 
 
 		 334 aa  144  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  37.24 
 
 		 350 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  34.07 
 
 		 350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  29.71 
 
 		 364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  33.21 
 
 		 351 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  31.36 
 
 		 365 aa  125  9e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2630  putative RNA methylase  41.85 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0132  putative RNA methylase  32.07 
 
 		 371 aa  119  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  28.28 
 
 		 367 aa  117  3e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  31.9 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2015  putative RNA methylase  30.45 
 
 		 314 aa  99  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1789  putative RNA methylase  38.51 
 
 		 304 aa  90.9  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  27.76 
 
 		 315 aa  89.4  7e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  27.88 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  31.93 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37849  predicted protein  23.94 
 
 		 469 aa  73.6  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00619482  hitchhiker  0.00164206 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0852  hypothetical protein  27.73 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0801  methyltransferase  29.61 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0899  hypothetical protein  27.73 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000386994  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0941  hypothetical protein  28.64 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4390  hypothetical protein  28.64 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.043324  unclonable  2.45562e-26 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1026  putative RNA methylase  31.82 
 
 		 379 aa  66.2  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0987  hypothetical protein  27.73 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.86692e-62 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  35.82 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1080  hypothetical protein  27.05 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.118177  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0985  hypothetical protein  28.27 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0793  putative RNA methylase  27.75 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.314828  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0592  putative RNA methylase  42.35 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0797  methyltransferase  28.16 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3585  putative RNA methylase  33.33 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  hitchhiker  0.0000715951 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  34.73 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6055  Methyltransferase type 11  29.67 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50882  predicted protein  29.26 
 
 		 437 aa  59.3  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.933008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0686  putative RNA methylase  37.89 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1582  putative RNA methylase  32.33 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0253  putative RNA methylase  29.55 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00740  hypothetical protein  28.78 
 
 		 475 aa  57.4  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.635907  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3569  putative RNA methylase  33.91 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.86 
 
 		 947 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1659  putative RNA methylase  37.65 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.69991  hitchhiker  0.00475931 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1254  putative RNA methylase  34 
 
 		 330 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00904523  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2801  putative RNA methylase  34.78 
 
 		 368 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45681  predicted protein  26.37 
 
 		 591 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  29.22 
 
 		 225 aa  54.3  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6722  putative RNA methylase  31.58 
 
 		 292 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2582  putative RNA methylase  30.77 
 
 		 362 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.22 
 
 		 235 aa  51.6  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  34.43 
 
 		 262 aa  50.8  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0064  Methyltransferase type 11  29.86 
 
 		 247 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0650  methyltransferase type 11  31.33 
 
 		 424 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541697  normal  0.369974 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1590  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.82 
 
 		 385 aa  50.4  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278078  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10450  RNA methylase family UPF0020 protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12140)  25.74 
 
 		 499 aa  50.1  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 236 aa  50.1  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1984  putative RNA methylase  36.47 
 
 		 227 aa  49.7  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0286  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.31 
 
 		 271 aa  49.7  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 239 aa  49.3  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  41.38 
 
 		 463 aa  49.3  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  44.07 
 
 		 495 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  32.82 
 
 		 253 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2276  putative RNA methylase  27.01 
 
 		 349 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  28.44 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.81 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  28.44 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  28.44 
 
 		 267 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 		 252 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 251 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  37.74 
 
 		 418 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0829  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.66 
 
 		 246 aa  48.1  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  26.57 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  31.91 
 
 		 263 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2993  putative RNA methylase  28.78 
 
 		 350 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  31.58 
 
 		 461 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  22.73 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4087  putative RNA methylase  31.9 
 
 		 329 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 260 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  32.2 
 
 		 233 aa  47.4  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0467  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.78 
 
 		 231 aa  47  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.197938  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.65 
 
 		 368 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  37.74 
 
 		 393 aa  46.6  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.38 
 
 		 240 aa  46.6  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0615  putative RNA methylase  27.5 
 
 		 247 aa  46.6  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 238 aa  46.6  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.81 
 
 		 252 aa  46.2  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  43.14 
 
 		 358 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2635  Methyltransferase type 11  39.02 
 
 		 199 aa  46.2  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0422  HemK family modification methylase  31.55 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  34.09 
 
 		 361 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  30.7 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  25.87 
 
 		 254 aa  45.8  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1720  putative RNA methylase  29.25 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0118315  decreased coverage  0.000010347 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>