197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3799 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  100 
 
 		 393 aa  809    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.3 
 
 		 947 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  28.37 
 
 		 463 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  25.06 
 
 		 416 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  27.17 
 
 		 438 aa  117  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  28.1 
 
 		 393 aa  116  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  22.65 
 
 		 418 aa  107  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  28.34 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  24.54 
 
 		 412 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  32.62 
 
 		 464 aa  96.3  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.92 
 
 		 383 aa  90.9  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1242  modification methylase  27.89 
 
 		 441 aa  87.8  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00503065  hitchhiker  0.00000000592753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  31.36 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  25.94 
 
 		 495 aa  84  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1306  hypothetical protein  22.34 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000125163  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  24.01 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  24.18 
 
 		 467 aa  79  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0843  Site-specific DNA-methyltransferase (cytosine- N(4)-specific)  21.45 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140978  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0894  hypothetical protein  31.13 
 
 		 445 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.118931  hitchhiker  0.00000342492 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  24 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1918  putative modification methylase  26.32 
 
 		 353 aa  77  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00266275  hitchhiker  0.00000000000360377 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  25 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  25 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  27.59 
 
 		 444 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  22.71 
 
 		 433 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  22.58 
 
 		 450 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  24.82 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  29.12 
 
 		 512 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2389  putative DNA modification methylase  26.14 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.198556  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3691  hypothetical protein  26.34 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  26.22 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  21.76 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.97 
 
 		 524 aa  67  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0329  hypothetical protein  28.93 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0325  hypothetical protein  25.6 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.103576  hitchhiker  0.00000188519 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5156  hypothetical protein  21.91 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000726262 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4787  hypothetical protein  24.05 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4077  hypothetical protein  23.04 
 
 		 614 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  29.57 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1000  DNA methyltransferase  29.02 
 
 		 472 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0958  hypothetical protein  23.01 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607753 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3926  putative DNA modification methylase  26.09 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2828  hypothetical protein  23.56 
 
 		 474 aa  60.5  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26692  predicted protein  22.87 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0281046  decreased coverage  0.00284905 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.54 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1681  cyclase family protein  22.19 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.259173  hitchhiker  0.0000210949 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  28 
 
 		 535 aa  58.2  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0286  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.42 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0642  hypothetical protein  21.53 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1620  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.21 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0374  hypothetical protein  37.37 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000208638  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.21 
 
 		 528 aa  55.8  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1593  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.51 
 
 		 308 aa  55.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0446322  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0332  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  27.97 
 
 		 530 aa  54.7  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00994221  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.34 
 
 		 633 aa  54.7  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  36.84 
 
 		 892 aa  53.9  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  28.66 
 
 		 916 aa  53.9  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.36 
 
 		 375 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000888828  hitchhiker  0.0000001156 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0460  putative RNA methylase  35.71 
 
 		 259 aa  53.5  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.258821  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.14 
 
 		 372 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0114  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.35 
 
 		 353 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2731  methyltransferase DNA modification enzyme  24.4 
 
 		 410 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0953  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.38 
 
 		 372 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00410  adenine-specific DNA modification methyltransferase  21.32 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0875  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.33 
 
 		 281 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000314247  unclonable  0.00000000054829 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  45.31 
 
 		 894 aa  50.8  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  31.94 
 
 		 315 aa  50.8  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0038  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.41 
 
 		 257 aa  50.8  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4359  hypothetical protein  26.34 
 
 		 425 aa  50.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000708265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  32.73 
 
 		 596 aa  49.7  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4513  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.33 
 
 		 279 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0040831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2118  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.92 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1809  DNA modification methylase-like protein  37.63 
 
 		 273 aa  49.3  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  39.34 
 
 		 703 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0950  hypothetical protein  32.08 
 
 		 501 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0387274 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.68 
 
 		 371 aa  48.9  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0490664  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2404  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.83 
 
 		 305 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  36.47 
 
 		 475 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  20.8 
 
 		 482 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  43.18 
 
 		 792 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1670  DNA methyltransferase  43.55 
 
 		 380 aa  48.9  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1741  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.56 
 
 		 158 aa  48.5  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.902503  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0442  putative RNA methylase  31.11 
 
 		 258 aa  48.9  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  46.81 
 
 		 731 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4304  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.11 
 
 		 874 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0675  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.97 
 
 		 416 aa  47.8  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2206  methyltransferase DNA modification enzyme  24.47 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.612218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1018  protein of unknown function DUF1156  32.22 
 
 		 968 aa  47.8  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1511  DNA methylase N-4/N-6  29.23 
 
 		 329 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6722  putative RNA methylase  34.85 
 
 		 292 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  29.41 
 
 		 259 aa  47.4  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.49 
 
 		 488 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2104  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.14 
 
 		 269 aa  47.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.636734  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  37.93 
 
 		 878 aa  47  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1720  N-6 adenine-specific DNA methylase  47.46 
 
 		 282 aa  46.6  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4192  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.92 
 
 		 267 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.291791 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1650  N-6 adenine-specific DNA methylase  47.46 
 
 		 282 aa  46.6  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  44.62 
 
 		 1071 aa  46.6  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1859  N-6 adenine-specific DNA methylase  47.46 
 
 		 282 aa  46.6  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.229539  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2444  DNA modification methylase RsrI  47.46 
 
 		 282 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.462592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>