32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK00740 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006680  CNK00740  hypothetical protein  100 
 
 		 475 aa  969    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.635907  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10450  RNA methylase family UPF0020 protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12140)  35.31 
 
 		 499 aa  265  1e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50882  predicted protein  36.1 
 
 		 437 aa  246  6.999999999999999e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.933008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37849  predicted protein  37.7 
 
 		 469 aa  160  3e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00619482  hitchhiker  0.00164206 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45681  predicted protein  27.29 
 
 		 591 aa  148  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  30.22 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  26.51 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1659  putative RNA methylase  34.65 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.69991  hitchhiker  0.00475931 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  24.82 
 
 		 364 aa  56.6  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  27.81 
 
 		 318 aa  56.2  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  32.37 
 
 		 374 aa  55.5  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0592  putative RNA methylase  34 
 
 		 225 aa  54.3  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  28 
 
 		 350 aa  53.5  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0686  putative RNA methylase  32.67 
 
 		 224 aa  53.9  0.000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  29.79 
 
 		 310 aa  53.9  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  28 
 
 		 351 aa  53.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  26.84 
 
 		 322 aa  49.7  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  31.09 
 
 		 343 aa  49.7  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  27.2 
 
 		 350 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  29.52 
 
 		 355 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  28.1 
 
 		 359 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  29.73 
 
 		 334 aa  47.4  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  29.9 
 
 		 336 aa  46.6  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2630  putative RNA methylase  28.21 
 
 		 356 aa  45.8  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1984  putative RNA methylase  31 
 
 		 227 aa  45.1  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  31.3 
 
 		 317 aa  45.1  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  28.45 
 
 		 346 aa  44.3  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0028  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.27 
 
 		 434 aa  43.5  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  25.88 
 
 		 500 aa  43.5  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  26.53 
 
 		 317 aa  43.5  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0520  methyltransferase small  24.19 
 
 		 210 aa  43.1  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2015  putative RNA methylase  26.61 
 
 		 314 aa  43.1  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>