47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2630 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2630  putative RNA methylase  100 
 
 		 356 aa  687    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0132  putative RNA methylase  58.31 
 
 		 371 aa  367  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  59.44 
 
 		 334 aa  355  7.999999999999999e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  57.03 
 
 		 365 aa  351  8.999999999999999e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  54.7 
 
 		 343 aa  306  3e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  32.04 
 
 		 355 aa  166  8e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  31.62 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  31.18 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  33.05 
 
 		 318 aa  142  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  30.7 
 
 		 317 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  31.93 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  30.77 
 
 		 346 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  31.22 
 
 		 322 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  26.54 
 
 		 351 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  26.2 
 
 		 350 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  26.3 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  25.54 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  27.17 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1789  putative RNA methylase  33.89 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  31.94 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2015  putative RNA methylase  27.32 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  23.81 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  27.49 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1720  putative RNA methylase  27.68 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0118315  decreased coverage  0.000010347 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0408  putative RNA methylase  25.71 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  25 
 
 		 359 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1100  putative RNA methylase  27.73 
 
 		 329 aa  53.1  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1254  putative RNA methylase  25.83 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00904523  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4390  hypothetical protein  26.97 
 
 		 317 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.043324  unclonable  2.45562e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0941  hypothetical protein  26.97 
 
 		 317 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1080  hypothetical protein  26.97 
 
 		 317 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.118177  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0793  putative RNA methylase  26.4 
 
 		 317 aa  49.7  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.314828  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37849  predicted protein  24.86 
 
 		 469 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00619482  hitchhiker  0.00164206 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0899  hypothetical protein  25.84 
 
 		 284 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000386994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0987  hypothetical protein  25.84 
 
 		 297 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.86692e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0801  methyltransferase  25.84 
 
 		 317 aa  47  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0852  hypothetical protein  25.84 
 
 		 317 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  25.54 
 
 		 336 aa  46.6  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  42.27 
 
 		 266 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  38.78 
 
 		 461 aa  44.3  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3569  putative RNA methylase  30.51 
 
 		 430 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1659  putative RNA methylase  34.34 
 
 		 224 aa  44.3  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.69991  hitchhiker  0.00475931 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0592  putative RNA methylase  30.28 
 
 		 225 aa  43.5  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  32.85 
 
 		 251 aa  43.5  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10450  RNA methylase family UPF0020 protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12140)  28 
 
 		 499 aa  43.5  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0985  hypothetical protein  24.72 
 
 		 284 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  29.93 
 
 		 234 aa  42.7  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>