74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1864 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  100 
 
 
365 aa  717    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0132  putative RNA methylase  72.85 
 
 
371 aa  498  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  60.55 
 
 
334 aa  376  1e-103  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2630  putative RNA methylase  57.03 
 
 
356 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  55.59 
 
 
343 aa  319  3.9999999999999996e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  31.65 
 
 
355 aa  166  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  31.6 
 
 
344 aa  160  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  31.79 
 
 
317 aa  159  8e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  33.24 
 
 
317 aa  157  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  34.15 
 
 
346 aa  146  6e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  31.59 
 
 
318 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  31.06 
 
 
317 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  30.35 
 
 
322 aa  123  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  28.57 
 
 
364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  28.92 
 
 
350 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  26.22 
 
 
351 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  25.78 
 
 
350 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  23.15 
 
 
367 aa  93.6  5e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1789  putative RNA methylase  36.22 
 
 
304 aa  91.3  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  29.38 
 
 
310 aa  91.7  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  31.66 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4390  hypothetical protein  32.43 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.043324  unclonable  2.45562e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0941  hypothetical protein  32.43 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1080  hypothetical protein  32.43 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.118177  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2015  putative RNA methylase  26.2 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0793  putative RNA methylase  31.89 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.314828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0987  hypothetical protein  31.15 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.86692e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0852  hypothetical protein  31.15 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0797  methyltransferase  32.52 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0801  methyltransferase  31.15 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0899  hypothetical protein  31.15 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000386994  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  27.01 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0985  hypothetical protein  30.81 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0408  putative RNA methylase  24.08 
 
 
334 aa  60.1  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1254  putative RNA methylase  26.09 
 
 
330 aa  59.7  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00904523  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1720  putative RNA methylase  24.92 
 
 
333 aa  58.5  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0118315  decreased coverage  0.000010347 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  41.33 
 
 
461 aa  57.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37849  predicted protein  38.95 
 
 
469 aa  56.6  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00619482  hitchhiker  0.00164206 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45681  predicted protein  32.17 
 
 
591 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  28.65 
 
 
359 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10450  RNA methylase family UPF0020 protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12140)  28.65 
 
 
499 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1100  putative RNA methylase  26.28 
 
 
329 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.75 
 
 
947 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1743  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  24.75 
 
 
706 aa  47.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.171189  hitchhiker  0.000865534 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1820  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 
315 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0592  putative RNA methylase  30.97 
 
 
225 aa  47.4  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50882  predicted protein  31.78 
 
 
437 aa  47  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.933008  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6722  putative RNA methylase  30.95 
 
 
292 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121582  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1659  putative RNA methylase  32.8 
 
 
224 aa  46.2  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.69991  hitchhiker  0.00475931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6055  Methyltransferase type 11  29.71 
 
 
360 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  34.43 
 
 
262 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  35.71 
 
 
504 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03589  hypothetical protein  25.1 
 
 
342 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  38.71 
 
 
495 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  26.28 
 
 
336 aa  45.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  23.75 
 
 
493 aa  44.3  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  36 
 
 
266 aa  44.3  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1236  putative RNA methylase  44.74 
 
 
385 aa  44.3  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6843  putative RNA methylase  37.68 
 
 
305 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223663  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2171  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  48.65 
 
 
702 aa  43.5  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000766949  normal  0.466381 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2695  putative RNA methylase  48.65 
 
 
702 aa  43.5  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0489936  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2460  methyltransferase type 11  31.01 
 
 
260 aa  43.5  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.930517  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1057  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  48.65 
 
 
702 aa  43.5  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2648  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  48.65 
 
 
702 aa  43.5  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0833868  hitchhiker  0.000556962 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1112  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  48.65 
 
 
702 aa  43.5  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000933928  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2369  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  48.65 
 
 
702 aa  43.5  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0183103  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1460  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  48.65 
 
 
702 aa  43.1  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.372421  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00959  hypothetical protein  48.65 
 
 
702 aa  43.5  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000774517  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2276  putative RNA methylase  28.96 
 
 
349 aa  43.5  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1026  putative RNA methylase  29.1 
 
 
379 aa  43.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1063  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  48.65 
 
 
702 aa  43.1  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000372198  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00952  predicted methyltransferase  48.65 
 
 
702 aa  43.5  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000729792  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  29.23 
 
 
234 aa  43.1  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2993  putative RNA methylase  28.27 
 
 
350 aa  42.7  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.021793 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>