227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1236 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1236  putative RNA methylase  100 
 
 
385 aa  794    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0282  putative RNA methylase:THUMP  58.36 
 
 
380 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377639  normal  0.859939 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3705  putative RNA methylase  53.42 
 
 
387 aa  428  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1032  putative RNA methylase  53.14 
 
 
399 aa  426  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2424  N6-adenine-specific DNA methylase  48.81 
 
 
398 aa  357  9.999999999999999e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0623  putative RNA methylase  48.09 
 
 
432 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244531  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0598  putative RNA methylase  47.85 
 
 
432 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116947  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2537  putative RNA methylase  46.46 
 
 
425 aa  349  5e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0675  putative RNA methylase  47.13 
 
 
434 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.936037  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0224  putative RNA methylase  47.13 
 
 
434 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0708  putative RNA methylase  47.13 
 
 
434 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2374  THUMP domain-containing protein  48.1 
 
 
430 aa  338  7e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3387  N6-adenine-specific DNA methylase  48.1 
 
 
430 aa  338  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0288  THUMP domain-containing protein  48.1 
 
 
430 aa  338  7e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1150  THUMP domain-containing protein  48.1 
 
 
430 aa  338  7e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3378  THUMP domain-containing protein  48.1 
 
 
430 aa  338  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.270297  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2557  THUMP domain-containing protein  48.1 
 
 
430 aa  338  7e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3344  THUMP domain-containing protein  48.1 
 
 
430 aa  338  9e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615958  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3795  putative RNA methylase  46.41 
 
 
433 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405369  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1265  THUMP domain-containing protein  47.17 
 
 
430 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4003  hypothetical protein  43.46 
 
 
430 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656935  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0696  putative RNA methylase  43.75 
 
 
433 aa  332  5e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273634  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2677  putative RNA methylase  47.02 
 
 
432 aa  331  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2828  putative RNA methylase:THUMP  43.69 
 
 
417 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2967  putative RNA methylase  41.9 
 
 
419 aa  323  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0473  putative RNA methylase  41.32 
 
 
413 aa  301  9e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0339  putative RNA methylase  40 
 
 
437 aa  296  3e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.179905  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0683  putative RNA methylase  38.41 
 
 
426 aa  296  4e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0350  putative RNA methylase  40 
 
 
440 aa  296  5e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.9 
 
 
709 aa  289  7e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0237  putative RNA methylase  38.22 
 
 
485 aa  287  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.601089  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0259  putative RNA methylase  39.37 
 
 
480 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2822  putative RNA methylase  40 
 
 
393 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.28 
 
 
712 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.64 
 
 
711 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.64 
 
 
713 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.64 
 
 
713 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.64 
 
 
713 aa  285  7e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0477  putative RNA methylase  38.81 
 
 
376 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0422  putative RNA methylase  37.9 
 
 
441 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.472219  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.86 
 
 
709 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000568014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.86 
 
 
709 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.86 
 
 
709 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2570  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.86 
 
 
709 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0113028  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0494  putative RNA methylase  39.08 
 
 
376 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00380676 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0579  putative RNA methylase  38.97 
 
 
430 aa  280  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3994  putative RNA methylase  38.5 
 
 
375 aa  280  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000218402  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.1 
 
 
711 aa  279  6e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2568  putative RNA methylase  36.7 
 
 
472 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.509771 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2473  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.99 
 
 
711 aa  277  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00287682 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.24 
 
 
711 aa  277  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4180  putative RNA methylase  37.59 
 
 
440 aa  277  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2978  putative RNA methylase  37.25 
 
 
472 aa  277  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1261  putative RNA methylase  37.43 
 
 
375 aa  276  6e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1292  putative RNA methylase  37.43 
 
 
375 aa  276  6e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.963614  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.76 
 
 
708 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1946  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.53 
 
 
711 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478167  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2283  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.13 
 
 
749 aa  271  1e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.402285  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2355  putative RNA methylase  38.38 
 
 
393 aa  270  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00636349  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0712  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.36 
 
 
738 aa  270  4e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0779  putative RNA methylase  38.21 
 
 
428 aa  269  5e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.11 
 
 
713 aa  268  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2739  hypothetical protein  36.44 
 
 
471 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.895962  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1263  N6-adenine-specific DNA methylase-like  39.35 
 
 
374 aa  266  4e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0245346  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1739  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.37 
 
 
721 aa  266  5e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.876202  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3086  hypothetical protein  37.63 
 
 
391 aa  264  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0398  putative RNA methylase:THUMP  36.39 
 
 
389 aa  261  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0174402  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0889  putative RNA methylase  37.43 
 
 
375 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2143  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.79 
 
 
711 aa  258  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0499  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.98 
 
 
734 aa  258  2e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.639423  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2495  putative RNA methylase  37.53 
 
 
387 aa  256  5e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256792  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4484  putative RNA methylase  42.04 
 
 
468 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0249  putative RNA methylase  36.12 
 
 
374 aa  254  3e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0789594  normal  0.0276638 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3711  putative RNA methylase  42.49 
 
 
471 aa  253  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.770893  normal  0.0760034 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1987  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.94 
 
 
706 aa  252  7e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2641  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.94 
 
 
706 aa  252  7e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2552  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.94 
 
 
706 aa  252  7e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1743  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.94 
 
 
706 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.171189  hitchhiker  0.000865534 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0429  putative RNA methylase  36.26 
 
 
380 aa  249  8e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.000469504  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1699  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.03 
 
 
722 aa  247  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1791  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.4 
 
 
705 aa  246  4e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2064  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.86 
 
 
705 aa  246  6.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2096  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.2 
 
 
730 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.110427 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1680  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.13 
 
 
707 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3643  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.2 
 
 
730 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.698608 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2005  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.39 
 
 
701 aa  243  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.391349  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1608  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.46 
 
 
730 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1460  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.4 
 
 
702 aa  243  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.372421  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03361  RNA methylase family protein  35.79 
 
 
374 aa  243  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1020  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.12 
 
 
718 aa  242  7e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.164858  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1420  putative RNA methylase  36.72 
 
 
388 aa  242  7.999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00712049  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1615  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.25 
 
 
730 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000568261 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00591  RNA methylase family protein  34.62 
 
 
374 aa  242  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00952  predicted methyltransferase  36.59 
 
 
702 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000729792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2695  putative RNA methylase  36.59 
 
 
702 aa  241  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0489936  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2648  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.59 
 
 
702 aa  241  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0833868  hitchhiker  0.000556962 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1649  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.74 
 
 
705 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1063  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.59 
 
 
702 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000372198  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1057  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.59 
 
 
702 aa  241  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00959  hypothetical protein  36.59 
 
 
702 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000774517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>