60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0700 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  100 
 
 
374 aa  757    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  31.44 
 
 
355 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  27.97 
 
 
317 aa  97.4  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  28.38 
 
 
344 aa  96.7  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  33.81 
 
 
322 aa  96.3  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  30.98 
 
 
346 aa  95.1  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  30.8 
 
 
318 aa  89.4  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  36.13 
 
 
334 aa  89  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  29.36 
 
 
364 aa  89.4  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  27.88 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1789  putative RNA methylase  28.57 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  30.98 
 
 
343 aa  82.4  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  28.29 
 
 
367 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  26.87 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2015  putative RNA methylase  24.39 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  27.19 
 
 
351 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  29.02 
 
 
317 aa  78.2  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2630  putative RNA methylase  31.94 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  25.94 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  31.66 
 
 
365 aa  75.5  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0132  putative RNA methylase  31.82 
 
 
371 aa  74.3  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  25.93 
 
 
310 aa  72.4  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  28.81 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45681  predicted protein  29.21 
 
 
591 aa  67.4  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0592  putative RNA methylase  30.24 
 
 
225 aa  56.6  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1026  putative RNA methylase  30.18 
 
 
379 aa  56.2  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37849  predicted protein  25.93 
 
 
469 aa  55.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00619482  hitchhiker  0.00164206 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0899  hypothetical protein  29.32 
 
 
284 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000386994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0852  hypothetical protein  29.32 
 
 
317 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1659  putative RNA methylase  31.94 
 
 
224 aa  53.9  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.69991  hitchhiker  0.00475931 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1984  putative RNA methylase  33.1 
 
 
227 aa  53.9  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0987  hypothetical protein  29.32 
 
 
297 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.86692e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0801  methyltransferase  29.32 
 
 
317 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0941  hypothetical protein  28.57 
 
 
317 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4390  hypothetical protein  28.57 
 
 
317 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.043324  unclonable  2.45562e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1080  hypothetical protein  28.57 
 
 
317 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.118177  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0793  putative RNA methylase  28.57 
 
 
317 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.314828  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0211  putative methyltransferase  32.29 
 
 
183 aa  51.6  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.785474  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  32.74 
 
 
359 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0686  putative RNA methylase  32.86 
 
 
224 aa  51.2  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502689  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2993  putative RNA methylase  28.1 
 
 
350 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0615  putative RNA methylase  22.03 
 
 
247 aa  50.1  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2276  putative RNA methylase  22.62 
 
 
349 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50882  predicted protein  28.68 
 
 
437 aa  48.9  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.933008  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  36.84 
 
 
416 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0793  hypothetical protein  30.21 
 
 
182 aa  47.8  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.290865  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00740  hypothetical protein  30.94 
 
 
475 aa  47  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.635907  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.79 
 
 
947 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  26.3 
 
 
336 aa  46.2  0.0009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10450  RNA methylase family UPF0020 protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12140)  29.6 
 
 
499 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0006  methyltransferase small  29.46 
 
 
209 aa  45.8  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0847  methyltransferase small  28 
 
 
207 aa  45.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1421  putative RNA methylase  24.26 
 
 
375 aa  44.7  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2582  putative RNA methylase  30.32 
 
 
362 aa  43.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0797  methyltransferase  27.27 
 
 
317 aa  43.1  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  34.25 
 
 
393 aa  43.1  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  28.18 
 
 
212 aa  43.1  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0299  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  29.86 
 
 
189 aa  43.1  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.56429  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0985  hypothetical protein  27.27 
 
 
284 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0041  protein of unknown function Met10  26.75 
 
 
272 aa  42.7  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>