80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1210 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  100 
 
 
322 aa  661    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  60.44 
 
 
317 aa  392  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  51.55 
 
 
318 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  47.66 
 
 
317 aa  300  2e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  45.31 
 
 
317 aa  281  1e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  38.02 
 
 
346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  36.47 
 
 
355 aa  187  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  35.13 
 
 
344 aa  176  6e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  31.53 
 
 
364 aa  138  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  29.63 
 
 
350 aa  136  5e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  33.21 
 
 
350 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  32.83 
 
 
351 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  33.44 
 
 
343 aa  124  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  31.49 
 
 
365 aa  120  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  32.66 
 
 
334 aa  119  6e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  29.55 
 
 
367 aa  117  3e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2630  putative RNA methylase  33.21 
 
 
356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0132  putative RNA methylase  29.46 
 
 
371 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  29.96 
 
 
310 aa  101  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  33.81 
 
 
374 aa  96.3  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2015  putative RNA methylase  31.6 
 
 
314 aa  89.7  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  26.25 
 
 
315 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1789  putative RNA methylase  35.63 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1026  putative RNA methylase  31.95 
 
 
379 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  35.92 
 
 
359 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  30.23 
 
 
336 aa  62.8  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37849  predicted protein  25 
 
 
469 aa  62  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00619482  hitchhiker  0.00164206 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.38 
 
 
947 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2276  putative RNA methylase  30.43 
 
 
349 aa  59.3  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0899  hypothetical protein  24.68 
 
 
284 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000386994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0852  hypothetical protein  24.68 
 
 
317 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0801  methyltransferase  24.68 
 
 
317 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0987  hypothetical protein  24.68 
 
 
297 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.86692e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0793  putative RNA methylase  21.78 
 
 
317 aa  56.6  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.314828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0941  hypothetical protein  23.87 
 
 
317 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258982  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45681  predicted protein  26.82 
 
 
591 aa  56.6  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4390  hypothetical protein  23.87 
 
 
317 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.043324  unclonable  2.45562e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1080  hypothetical protein  23.87 
 
 
317 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.118177  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2993  putative RNA methylase  28.99 
 
 
350 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0253  putative RNA methylase  31.62 
 
 
360 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0592  putative RNA methylase  40 
 
 
225 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2582  putative RNA methylase  34.82 
 
 
362 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0985  hypothetical protein  23.78 
 
 
284 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  40.74 
 
 
418 aa  53.1  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2801  putative RNA methylase  34.82 
 
 
368 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0797  methyltransferase  24.03 
 
 
317 aa  52.8  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  34.58 
 
 
276 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1659  putative RNA methylase  36.47 
 
 
224 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.69991  hitchhiker  0.00475931 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50882  predicted protein  24.28 
 
 
437 aa  51.2  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.933008  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  26.96 
 
 
259 aa  50.4  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  28.44 
 
 
477 aa  50.1  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1582  putative RNA methylase  28.57 
 
 
357 aa  50.1  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3585  putative RNA methylase  31.19 
 
 
352 aa  49.3  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  hitchhiker  0.0000715951 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0615  putative RNA methylase  28.22 
 
 
247 aa  49.3  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1511  DNA methylase N-4/N-6  29.46 
 
 
329 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  34.12 
 
 
463 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5156  hypothetical protein  38.18 
 
 
393 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000726262 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6055  Methyltransferase type 11  32.04 
 
 
360 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  29.76 
 
 
461 aa  47  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  41.07 
 
 
416 aa  46.6  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00740  hypothetical protein  25.26 
 
 
475 aa  46.2  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.635907  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0686  putative RNA methylase  35.29 
 
 
224 aa  46.2  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502689  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6722  putative RNA methylase  27.03 
 
 
292 aa  46.2  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121582  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0829  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.78 
 
 
246 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1205  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  33.1 
 
 
249 aa  45.8  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.836419  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 
225 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
235 aa  44.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  40.43 
 
 
937 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  26.95 
 
 
238 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 
269 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  28.57 
 
 
412 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  25 
 
 
254 aa  43.5  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  31.36 
 
 
293 aa  43.5  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0218  putative RNA methylase  28.21 
 
 
348 aa  43.5  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000547055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  33.98 
 
 
706 aa  43.1  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  29.91 
 
 
307 aa  42.7  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 
267 aa  42.7  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1724  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 
249 aa  42.4  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.335663  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0286  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.71 
 
 
271 aa  42.4  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684049  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3569  putative RNA methylase  28.45 
 
 
430 aa  42.4  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>