More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5912 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  100 
 
 
706 aa  1431    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6095  methyltransferase type 11  49.31 
 
 
438 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3945  hypothetical protein  39.78 
 
 
547 aa  236  7e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7834  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 
316 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26678  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.94 
 
 
455 aa  188  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325123  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6925  hypothetical protein  32.6 
 
 
574 aa  139  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.487787 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.38 
 
 
232 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3133  methyltransferase FkbM family  39.37 
 
 
358 aa  103  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0108  hypothetical protein  29.91 
 
 
313 aa  87.4  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  39.62 
 
 
358 aa  69.3  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  44.44 
 
 
240 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 
242 aa  68.6  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  29.63 
 
 
280 aa  65.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  33.12 
 
 
239 aa  66.6  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  31.63 
 
 
265 aa  65.1  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  35.51 
 
 
276 aa  64.7  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  40.4 
 
 
225 aa  63.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  29.7 
 
 
226 aa  61.6  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  34.38 
 
 
244 aa  61.2  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  38.57 
 
 
1476 aa  60.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 
226 aa  60.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  37.62 
 
 
257 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  30.18 
 
 
283 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0658  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 
233 aa  58.9  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.382141  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  37.04 
 
 
238 aa  58.9  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  29.84 
 
 
252 aa  59.3  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 
196 aa  58.9  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  50 
 
 
241 aa  58.5  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  36.04 
 
 
260 aa  58.5  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6874  Methyltransferase type 11  29.28 
 
 
260 aa  57.8  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413969  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 
222 aa  57.4  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  36.04 
 
 
236 aa  57.8  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  35.2 
 
 
275 aa  57.4  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  30.11 
 
 
1106 aa  57.4  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.92 
 
 
282 aa  57  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1015  Methyltransferase type 11  48 
 
 
213 aa  56.6  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371605  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  40.3 
 
 
281 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  37.23 
 
 
258 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
266 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  32.79 
 
 
870 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  34.86 
 
 
785 aa  56.2  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 
273 aa  56.6  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.7 
 
 
291 aa  55.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  53.33 
 
 
204 aa  55.8  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  53.33 
 
 
204 aa  55.8  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  53.33 
 
 
204 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  30.52 
 
 
232 aa  55.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 
281 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  38.04 
 
 
240 aa  55.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  36.67 
 
 
243 aa  55.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3132  hypothetical protein  34.02 
 
 
364 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.77 
 
 
255 aa  54.7  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 
382 aa  55.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 
242 aa  54.7  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.91 
 
 
236 aa  54.7  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  42.19 
 
 
267 aa  54.7  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 
242 aa  54.7  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.87 
 
 
213 aa  54.7  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 
207 aa  54.7  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 
226 aa  54.3  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  39 
 
 
442 aa  54.3  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  34.68 
 
 
258 aa  54.3  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
243 aa  54.3  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  36.25 
 
 
511 aa  53.9  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.08 
 
 
205 aa  53.9  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 
244 aa  53.9  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  35 
 
 
261 aa  53.9  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  31.78 
 
 
342 aa  53.9  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2807  Methyltransferase type 11  39.39 
 
 
228 aa  53.9  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  34.96 
 
 
810 aa  53.9  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  35.29 
 
 
658 aa  53.9  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1252  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 
305 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
354 aa  53.5  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.38 
 
 
271 aa  53.9  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2218  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 
254 aa  53.5  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  31.63 
 
 
211 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  36.46 
 
 
237 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  47.17 
 
 
238 aa  53.5  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 
270 aa  53.5  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  35.65 
 
 
226 aa  53.5  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  31.85 
 
 
244 aa  53.5  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  37.5 
 
 
325 aa  52.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  28.44 
 
 
258 aa  53.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  39.22 
 
 
244 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  40 
 
 
331 aa  52.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0010  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 
248 aa  52.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1773  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.95 
 
 
265 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  31.32 
 
 
274 aa  53.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  42.55 
 
 
279 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2867  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 
355 aa  52.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  32.41 
 
 
241 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.36 
 
 
241 aa  52.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.11 
 
 
201 aa  52.4  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.02 
 
 
258 aa  52.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  29 
 
 
263 aa  52.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  37.89 
 
 
178 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6865  Methyltransferase type 11  46.77 
 
 
282 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  36.08 
 
 
238 aa  52.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  36.89 
 
 
204 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>