More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0235 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  100 
 
 
242 aa  489  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 
254 aa  90.1  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  42.74 
 
 
280 aa  88.6  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2218  Methyltransferase type 11  25.22 
 
 
254 aa  85.1  8e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  39.82 
 
 
511 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2374  methyltransferase type 11  29.85 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.404257 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  37.98 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
1476 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  30.52 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  32.37 
 
 
293 aa  72.4  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3152  methyltransferase type 11  30.48 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.23938  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  34.45 
 
 
238 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3998  methyltransferase type 11  38.94 
 
 
322 aa  69.3  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  38.1 
 
 
706 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1252  Methyltransferase type 11  37.62 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  35.2 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  38 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  41.18 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1117  Methyltransferase type 11  42.11 
 
 
324 aa  66.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.39297  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.62 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  37.38 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7834  Methyltransferase type 11  37.17 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26678  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10226  methyltransferase  33.33 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0147  Methyltransferase type 11  40.21 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  35.25 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0658  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 
233 aa  65.5  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.382141  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  36.52 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  32.17 
 
 
244 aa  65.1  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  41.3 
 
 
259 aa  65.1  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  32.48 
 
 
241 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  30.89 
 
 
216 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  36.28 
 
 
243 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  33.07 
 
 
258 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
241 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0866  hypothetical protein  29.93 
 
 
224 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  35.2 
 
 
240 aa  63.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
225 aa  63.2  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14381  hypothetical protein  26.83 
 
 
239 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4470  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 
252 aa  62.8  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.09133  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
237 aa  62.4  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 
261 aa  62.4  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
261 aa  62.4  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3339  methyltransferase type 11  39.08 
 
 
222 aa  62  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52136  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  27.07 
 
 
244 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  42.39 
 
 
244 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  33.63 
 
 
243 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.77 
 
 
228 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0141  methyltransferase type 11  38.46 
 
 
227 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  31.51 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  33.63 
 
 
243 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0579  methyltransferase type 11  35.11 
 
 
339 aa  60.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  33.63 
 
 
243 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0357  methyltransferase type 11  39.13 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  35.35 
 
 
235 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
270 aa  60.1  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  33.04 
 
 
289 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 
205 aa  60.1  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.71 
 
 
235 aa  60.1  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0584  methyltransferase type 11  37.18 
 
 
235 aa  60.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.950676  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  28.79 
 
 
242 aa  59.7  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3615  methyltransferase type 11  31.93 
 
 
266 aa  59.7  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.134512 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0241  methyltransferase type 11  34.51 
 
 
255 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.114576 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.98 
 
 
232 aa  59.7  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  44.78 
 
 
240 aa  59.7  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 
272 aa  59.3  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.03 
 
 
229 aa  59.3  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1107  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 
218 aa  58.9  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.000000024233 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  29.25 
 
 
243 aa  59.3  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.86 
 
 
252 aa  58.9  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4237  methyltransferase type 11  31.69 
 
 
311 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.579658  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  32.76 
 
 
276 aa  59.3  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  30.97 
 
 
243 aa  58.9  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  51.79 
 
 
255 aa  58.9  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 
237 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  39.8 
 
 
247 aa  58.5  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
225 aa  58.9  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  33.55 
 
 
254 aa  58.5  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2661  hypothetical protein  33.01 
 
 
261 aa  58.5  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.588792  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  34.38 
 
 
238 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1376  Methyltransferase type 11  32.8 
 
 
274 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.331989 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  30.15 
 
 
283 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0988  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.48 
 
 
212 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.387372  decreased coverage  0.00000591406 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3007  methyltransferase type 11  36.46 
 
 
429 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2999  methyltransferase type 11  41.41 
 
 
246 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0921858  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.56 
 
 
258 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  31.86 
 
 
237 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  26.97 
 
 
306 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2472  methyltransferase type 11  33.79 
 
 
367 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3485  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  34.71 
 
 
197 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.171708 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.04 
 
 
233 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  51.06 
 
 
293 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4394  methyltransferase type 11  37 
 
 
265 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  33.98 
 
 
233 aa  57.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  31.91 
 
 
222 aa  57  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0854  methyltransferase type 11  40.54 
 
 
266 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.860107  normal  0.0122771 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  36.56 
 
 
231 aa  57  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 
284 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.71 
 
 
240 aa  56.6  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  31.85 
 
 
392 aa  57  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>