106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1117 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1117  Methyltransferase type 11  100 
 
 
324 aa  672    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.39297  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0584  methyltransferase type 11  31.56 
 
 
235 aa  88.2  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.950676  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2045  methyltransferase type 11  32.89 
 
 
358 aa  76.3  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.029361  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  30.6 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  30.49 
 
 
280 aa  70.5  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3647  methyltransferase type 11  35.34 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3940  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1252  Methyltransferase type 11  35.54 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  41.89 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  34.68 
 
 
254 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  36.08 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3644  methyltransferase type 11  32.82 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0152076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  42.68 
 
 
1476 aa  67.8  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  38.52 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  30.47 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  42.11 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2218  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4237  methyltransferase type 11  30 
 
 
311 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.579658  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  28.24 
 
 
239 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0141  methyltransferase type 11  38.82 
 
 
227 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
511 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2391  hypothetical protein  28.47 
 
 
181 aa  59.7  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000289093  hitchhiker  0.0000349979 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  31.94 
 
 
1082 aa  57.8  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0365  methyltransferase type 11  39.08 
 
 
243 aa  57.4  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3998  methyltransferase type 11  35.64 
 
 
322 aa  56.2  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72030  hypothetical protein  27.53 
 
 
287 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2454  methyltransferase type 11  35.96 
 
 
324 aa  55.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.314737  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3844  Methyltransferase type 11  28.23 
 
 
192 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3646  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
507 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0866  hypothetical protein  32.48 
 
 
224 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1844  methyltransferase type 11  27.85 
 
 
415 aa  52.8  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3716  hypothetical protein  27.89 
 
 
233 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3856  hypothetical protein  30.89 
 
 
189 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67552  normal  0.498735 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  33 
 
 
1124 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3339  methyltransferase type 11  45.21 
 
 
222 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52136  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0397  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
241 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3850  Generic methyltransferase  28.3 
 
 
197 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  30.32 
 
 
241 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  44.44 
 
 
196 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0435  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
241 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252383  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4780  methyltransferase type 11  35.11 
 
 
256 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0464151  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4072  methyltransferase type 11  28.3 
 
 
197 aa  49.7  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00042768  normal  0.252291 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1022  Methyltransferase type 11  25.93 
 
 
273 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14381  hypothetical protein  30.36 
 
 
239 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  38.46 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
222 aa  48.1  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  31.09 
 
 
279 aa  47.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  27.82 
 
 
268 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6874  Methyltransferase type 11  37.35 
 
 
260 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413969  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2320  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 
239 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46525  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  38.79 
 
 
258 aa  47  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  36.23 
 
 
257 aa  47  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03053  23S rRNA methyltransferase A  26.85 
 
 
317 aa  47  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1922  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
226 aa  47  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0742  type 11 methyltransferase  42.86 
 
 
266 aa  46.6  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.166057 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
706 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3712  Methyltransferase type 11  38.54 
 
 
244 aa  46.6  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.435938  normal  0.0474323 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  50 
 
 
272 aa  46.2  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  38.78 
 
 
211 aa  46.2  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.93 
 
 
258 aa  46.2  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2186  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
254 aa  46.2  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1848  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.71 
 
 
282 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.329247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  47.17 
 
 
345 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  35.9 
 
 
240 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  38.46 
 
 
488 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0634  methyltransferase type 11  27.64 
 
 
198 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839986  normal  0.828808 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  34.44 
 
 
284 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  44.9 
 
 
258 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 
226 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0725  chromosome segregation ATPases-like  29.41 
 
 
668 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.124276  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  47.92 
 
 
239 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  28.32 
 
 
285 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0738  methyltransferase type 11  37.65 
 
 
236 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  38.6 
 
 
255 aa  44.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  23.46 
 
 
870 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  28.32 
 
 
285 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7834  Methyltransferase type 11  33.85 
 
 
316 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26678  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  41.18 
 
 
279 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  27.96 
 
 
265 aa  44.3  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.77 
 
 
293 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2020  methyltransferase type 11  31.48 
 
 
239 aa  44.3  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00106429  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.33 
 
 
232 aa  43.9  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3545  hypothetical protein  28.93 
 
 
213 aa  44.3  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1146  Methyltransferase type 11  32.22 
 
 
256 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00784878 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  46.94 
 
 
710 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0658  Methyltransferase type 11  40 
 
 
233 aa  43.9  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.382141  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  45.28 
 
 
264 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  37.84 
 
 
457 aa  43.5  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  32.58 
 
 
241 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  39.62 
 
 
240 aa  43.5  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1204  Methyltransferase type 11  31.63 
 
 
223 aa  43.5  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.19766  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3485  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  32.2 
 
 
197 aa  43.1  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.171708 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2387  methyltransferase type 11  26.36 
 
 
238 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.247097  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4235  methyltransferase type 11  41.51 
 
 
244 aa  43.1  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0933321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  45.45 
 
 
275 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0789  methyltransferase type 11  38.1 
 
 
264 aa  42.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1589  23S rRNA methyltransferase A  28.17 
 
 
278 aa  42.7  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972827  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4435  methyltransferase type 11  37.65 
 
 
247 aa  42.7  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.937365  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  30.38 
 
 
293 aa  42.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  42.86 
 
 
711 aa  42.7  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>