92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3998 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3998  methyltransferase type 11  100 
 
 		 322 aa  655    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1252  Methyltransferase type 11  28.9 
 
 		 305 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 		 1476 aa  79.3  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  37.17 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0584  methyltransferase type 11  34.34 
 
 		 235 aa  68.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.950676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 228 aa  67  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2045  methyltransferase type 11  37.27 
 
 		 358 aa  62  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.029361  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  38.64 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  33.07 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3646  glycosyl transferase family protein  38.78 
 
 		 507 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  41.94 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1117  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.39297  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  28.74 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3940  Methyltransferase type 11  39.29 
 
 		 242 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4855  hypothetical protein  49.21 
 
 		 349 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3647  methyltransferase type 11  39.29 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0141  methyltransferase type 11  37.31 
 
 		 227 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 511 aa  53.5  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14381  hypothetical protein  25.93 
 
 		 239 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  35.05 
 
 		 247 aa  52.8  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1844  methyltransferase type 11  39.24 
 
 		 415 aa  53.1  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 244 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 243 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 243 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 243 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2454  methyltransferase type 11  35.62 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.314737  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0365  methyltransferase type 11  32.94 
 
 		 243 aa  50.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3339  methyltransferase type 11  38.16 
 
 		 222 aa  50.1  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3743  methyltransferase type 11  29.33 
 
 		 331 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  27.21 
 
 		 1124 aa  49.7  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1864  hypothetical protein  35.96 
 
 		 221 aa  49.3  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  28.76 
 
 		 197 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  33.85 
 
 		 1082 aa  48.5  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  26.53 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  33.8 
 
 		 513 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 237 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2218  Methyltransferase type 11  26.13 
 
 		 254 aa  48.5  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 251 aa  47.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 249 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3716  hypothetical protein  32.84 
 
 		 233 aa  47.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  27.61 
 
 		 240 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.88 
 
 		 255 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  29.81 
 
 		 276 aa  47.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2391  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000289093  hitchhiker  0.0000349979 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  29.79 
 
 		 244 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  36.71 
 
 		 238 aa  47  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2836  methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 234 aa  46.6  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.167679 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0866  hypothetical protein  37.88 
 
 		 224 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 241 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2999  methyltransferase type 11  34.25 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0921858  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0994  methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0725  chromosome segregation ATPases-like  28.57 
 
 		 668 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.124276  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7379  SAM-dependent methyltransferase  39.29 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  32.23 
 
 		 222 aa  45.8  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4237  methyltransferase type 11  24.34 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.579658  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  33.78 
 
 		 870 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  39.06 
 
 		 706 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  40.38 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  24.55 
 
 		 238 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1722  hypothetical protein  30.95 
 
 		 350 aa  44.3  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  43.18 
 
 		 1106 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 259 aa  44.3  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0807  type 11 methyltransferase  33.82 
 
 		 245 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.887141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2387  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 238 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.247097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0634  methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 198 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839986  normal  0.828808 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 250 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0427  methyltransferase type 11  34.18 
 
 		 255 aa  43.9  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100064  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  31.02 
 
 		 250 aa  43.9  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  26.25 
 
 		 255 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5480  methyltransferase type 12  51.28 
 
 		 245 aa  43.5  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  23.38 
 
 		 254 aa  43.5  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4470  Methyltransferase type 11  44.19 
 
 		 252 aa  43.5  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.09133  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0094  methyltransferase type 11  32 
 
 		 235 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  46 
 
 		 225 aa  43.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0103  methyltransferase type 11  32 
 
 		 235 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  27.66 
 
 		 239 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0084  methyltransferase type 11  32 
 
 		 235 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3865  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 		 666 aa  43.1  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141274 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  32.61 
 
 		 196 aa  43.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  32.93 
 
 		 237 aa  43.1  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3545  hypothetical protein  37.5 
 
 		 213 aa  43.1  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0435  methyltransferase type 11  25.88 
 
 		 241 aa  43.1  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252383  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  26.21 
 
 		 241 aa  42.7  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.18 
 
 		 229 aa  42.7  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.416549  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  38.46 
 
 		 255 aa  42.7  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4000  hypothetical protein  38.46 
 
 		 212 aa  42.7  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3908  hypothetical protein  38.46 
 
 		 212 aa  42.7  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00391987  normal  0.262705 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  28.26 
 
 		 241 aa  42.7  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.34 
 
 		 272 aa  42.4  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>