More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3143 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2374  methyltransferase type 11  45.75 
 
 
212 aa  177  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.404257 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  33.74 
 
 
228 aa  94  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  34.19 
 
 
244 aa  90.1  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  32.46 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0658  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.382141  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  37.31 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2218  Methyltransferase type 11  35.16 
 
 
254 aa  72.4  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  29.14 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3339  methyltransferase type 11  32.2 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52136  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  30.95 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1117  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
324 aa  65.9  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.39297  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.28 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0584  methyltransferase type 11  33.86 
 
 
235 aa  63.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.950676  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
242 aa  63.2  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2391  hypothetical protein  35.54 
 
 
181 aa  62.8  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000289093  hitchhiker  0.0000349979 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2045  methyltransferase type 11  31.07 
 
 
358 aa  61.6  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.029361  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  28.67 
 
 
238 aa  61.6  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  33.62 
 
 
235 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3644  methyltransferase type 11  26.77 
 
 
296 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0152076 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0141  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
227 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  27.69 
 
 
261 aa  58.9  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  31.68 
 
 
243 aa  58.9  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0147  Methyltransferase type 11  31.2 
 
 
240 aa  58.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
222 aa  58.5  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 
242 aa  58.5  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2515  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 
213 aa  57.8  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  32.99 
 
 
240 aa  56.2  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  24.26 
 
 
267 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  34.65 
 
 
222 aa  55.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4237  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
311 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.579658  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2836  methyltransferase type 11  33.68 
 
 
234 aa  55.1  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.167679 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1252  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 
305 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  32.89 
 
 
870 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4780  methyltransferase type 11  31.78 
 
 
256 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0464151  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  27.72 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  27.12 
 
 
197 aa  53.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  29.08 
 
 
281 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1510  hypothetical protein  31.86 
 
 
247 aa  53.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.702399  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3716  hypothetical protein  28.16 
 
 
233 aa  53.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1204  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 
223 aa  53.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.19766  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30.33 
 
 
225 aa  52.8  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2233  Methyltransferase type 11  26.06 
 
 
204 aa  52.8  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.569046  hitchhiker  0.00169364 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  43.14 
 
 
284 aa  52.8  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2999  methyltransferase type 11  27.21 
 
 
246 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0921858  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0410  Methyltransferase type 11  29.84 
 
 
233 aa  52.4  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
634 aa  52.4  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  25.34 
 
 
238 aa  52  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  31.45 
 
 
196 aa  51.6  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  22.42 
 
 
269 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.57 
 
 
764 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  25.9 
 
 
511 aa  50.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2460  methyltransferase type 11  28.85 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.930517  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  21.25 
 
 
272 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  23.77 
 
 
296 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  34.31 
 
 
258 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4270  Methyltransferase type 11  28.72 
 
 
299 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0859626  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10226  methyltransferase  29.36 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0994  methyltransferase type 11  29.01 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.430888 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3940  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
242 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  26.35 
 
 
275 aa  50.1  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  33.63 
 
 
194 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3647  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
242 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0842  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.68 
 
 
235 aa  50.1  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3305  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3856  hypothetical protein  37.31 
 
 
189 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67552  normal  0.498735 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  23.44 
 
 
253 aa  49.7  0.00004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  29.36 
 
 
711 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
710 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  23.35 
 
 
274 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  20.62 
 
 
276 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  30.1 
 
 
257 aa  49.7  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.31 
 
 
258 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.63 
 
 
345 aa  49.3  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  21.21 
 
 
269 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  19.76 
 
 
268 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  26.61 
 
 
269 aa  48.5  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2867  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 
355 aa  48.5  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  23.08 
 
 
279 aa  48.5  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  29.81 
 
 
240 aa  48.5  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  30.88 
 
 
278 aa  48.5  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  26.79 
 
 
262 aa  48.5  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  25.45 
 
 
244 aa  48.5  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2387  methyltransferase type 11  25.83 
 
 
238 aa  48.5  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.247097  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
1476 aa  48.1  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  27.68 
 
 
1124 aa  48.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  26.26 
 
 
258 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2186  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
254 aa  48.1  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  23.95 
 
 
353 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.34 
 
 
279 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  23.95 
 
 
353 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 
255 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  32.47 
 
 
255 aa  47.8  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1844  methyltransferase type 11  29.46 
 
 
415 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1141  methyltransferase type 11  34.11 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  29.01 
 
 
341 aa  47  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.59 
 
 
230 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  26.85 
 
 
348 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  36.54 
 
 
265 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1773  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.83 
 
 
265 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3615  methyltransferase type 11  35.59 
 
 
266 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.134512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>