222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0357 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0357  methyltransferase type 11  100 
 
 		 194 aa  401  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2861  hypothetical protein  40 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0954  hypothetical protein  37.14 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1454  methyltransferase type 11  38.82 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.398758  normal  0.372191 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2180  hypothetical protein  27.84 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.810913  hitchhiker  0.000154627 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  39.13 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2092  Methyltransferase type 11  36.14 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.80059  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  44.58 
 
 		 710 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.65 
 
 		 345 aa  58.9  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0854  methyltransferase type 11  40.79 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.860107  normal  0.0122771 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3038  methyltransferase type 11  41.98 
 
 		 643 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236938  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4962  Methyltransferase type 11  42.17 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2566  Methyltransferase type 11  38.54 
 
 		 281 aa  57  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  43.86 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4047  hypothetical protein  34.12 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440642  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6325  hypothetical protein  38.89 
 
 		 403 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  47.69 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  62.22 
 
 		 711 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  45.61 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  35.16 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2663  hypothetical protein  35.87 
 
 		 413 aa  55.1  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.236265 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  54.35 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  52 
 
 		 237 aa  53.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  56.82 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0087  glycosyl transferase  36.59 
 
 		 712 aa  53.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.533314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  36.14 
 
 		 596 aa  52.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  49.02 
 
 		 237 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4068  hypothetical protein  31.25 
 
 		 678 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.720614  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  43.94 
 
 		 238 aa  52  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  40 
 
 		 243 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  40 
 
 		 243 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  40 
 
 		 243 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2186  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 254 aa  52  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2761  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 278 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  hitchhiker  0.00634675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0435  methyltransferase type 11  40.24 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252383  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2551  methyltransferase type 11  36.71 
 
 		 250 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  47.83 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  52.27 
 
 		 240 aa  49.7  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.25 
 
 		 851 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.25 
 
 		 851 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.25 
 
 		 851 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  40.54 
 
 		 511 aa  49.7  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  34.25 
 
 		 851 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.25 
 
 		 851 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5441  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.61 
 
 		 248 aa  49.7  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0577674  normal  0.255989 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2060  hypothetical protein  31.63 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.572806  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 254 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 267 aa  48.9  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  45.45 
 
 		 244 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  37.8 
 
 		 238 aa  49.3  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 285 aa  49.3  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  51.11 
 
 		 310 aa  48.9  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  42.03 
 
 		 282 aa  48.9  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3581  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 258 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.76 
 
 		 296 aa  48.5  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.21 
 
 		 272 aa  48.5  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3874  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 246 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269939  normal  0.0852061 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  25.53 
 
 		 270 aa  48.1  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4035  hypothetical protein  40 
 
 		 253 aa  48.1  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 		 272 aa  48.1  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  42.31 
 
 		 267 aa  48.1  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  34.86 
 
 		 258 aa  48.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  43.14 
 
 		 239 aa  48.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 251 aa  48.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3081  methyltransferase type 11  36.23 
 
 		 258 aa  47.8  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609499  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 276 aa  48.1  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1515  hypothetical protein  40.23 
 
 		 535 aa  47.4  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  45.28 
 
 		 251 aa  47.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.51 
 
 		 853 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3545  hypothetical protein  38.24 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3345  hypothetical protein  47.62 
 
 		 241 aa  47.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.51 
 
 		 853 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  40 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1376  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 274 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.331989 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 353 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0045  Methyltransferase type 12  46.94 
 
 		 264 aa  47  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  34.65 
 
 		 353 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1510  hypothetical protein  46.81 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.702399  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  44.9 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  37.68 
 
 		 271 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0334  methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  42.59 
 
 		 286 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  48 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0994  methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 259 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1124 aa  46.2  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1919  hypothetical protein  40.28 
 
 		 241 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.596935  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  50 
 
 		 706 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  47.83 
 
 		 255 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  44.9 
 
 		 240 aa  46.2  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  40 
 
 		 241 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5899  Methyltransferase type 11  27.96 
 
 		 230 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.331708  normal  0.516672 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2813  hypothetical protein  25.89 
 
 		 240 aa  45.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00156648  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3033  hypothetical protein  40 
 
 		 302 aa  45.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767056  hitchhiker  0.000169463 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1658  methyltransferase type 11  40.74 
 
 		 256 aa  45.8  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  47.06 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 282 aa  45.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>