More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1510 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1510  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  513  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.702399  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5480  methyltransferase type 12  47.13 
 
 
245 aa  231  9e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7379  SAM-dependent methyltransferase  40.09 
 
 
242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2836  methyltransferase type 11  34.95 
 
 
234 aa  90.1  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.167679 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  31.1 
 
 
273 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  36.07 
 
 
634 aa  58.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.04 
 
 
296 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  36.44 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 
1106 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  30.23 
 
 
222 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  43.64 
 
 
279 aa  56.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  27.34 
 
 
240 aa  56.6  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  34.96 
 
 
276 aa  55.8  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.63 
 
 
345 aa  55.5  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  35.92 
 
 
870 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 
251 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2840  Methyltransferase type 11  27.4 
 
 
239 aa  55.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3137  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
236 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2320  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 
239 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46525  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1142  Methyltransferase type 11  28.41 
 
 
236 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 
196 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  31.88 
 
 
222 aa  53.5  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2999  methyltransferase type 11  35.09 
 
 
246 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0921858  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1022  Methyltransferase type 11  34.03 
 
 
273 aa  53.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  31.86 
 
 
216 aa  53.1  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  34.69 
 
 
1476 aa  52.8  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0910  methyltransferase type 11  35.9 
 
 
239 aa  52.8  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  28.09 
 
 
239 aa  52.8  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3308  demethylmenaquinone methyltransferase  30.88 
 
 
256 aa  52.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.717606 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1008  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 
239 aa  52.4  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.30893  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1320  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
315 aa  52.4  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.065684 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  34.15 
 
 
249 aa  52  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  42.03 
 
 
265 aa  52  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  33.86 
 
 
261 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0789  methyltransferase type 11  34.21 
 
 
264 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1107  methyltransferase type 11  32.48 
 
 
239 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  30.7 
 
 
243 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2374  methyltransferase type 11  38.6 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.404257 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2684  hypothetical protein  32.48 
 
 
239 aa  51.6  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0282263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1053  putative methyltransferase  32.48 
 
 
239 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.600444  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14451  SAM-dependent methyltransferase  32.61 
 
 
223 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0742  type 11 methyltransferase  38.55 
 
 
266 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.166057 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1722  hypothetical protein  40 
 
 
350 aa  50.4  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  32.43 
 
 
251 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  36.62 
 
 
238 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.27 
 
 
279 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  31.3 
 
 
237 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  30 
 
 
810 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 
250 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  36.51 
 
 
228 aa  49.7  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  38.6 
 
 
246 aa  49.7  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  34.23 
 
 
259 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3286  Methyltransferase type 11  33 
 
 
272 aa  49.7  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
263 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0747  hypothetical protein  44.44 
 
 
230 aa  49.3  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.034536  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1822  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
213 aa  49.3  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00574627  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 
285 aa  49.3  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.97 
 
 
256 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  46 
 
 
284 aa  49.3  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2962  methyltransferase type 11  27.21 
 
 
401 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
241 aa  48.9  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1146  Methyltransferase type 11  38 
 
 
256 aa  48.9  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00784878 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.97 
 
 
256 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
293 aa  48.9  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3114  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
262 aa  48.9  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000861338  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6874  Methyltransferase type 11  32.53 
 
 
260 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413969  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  55.32 
 
 
274 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  29.63 
 
 
256 aa  48.5  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0807  type 11 methyltransferase  31.3 
 
 
245 aa  48.5  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.887141  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  31.96 
 
 
240 aa  48.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1619  methyltransferase type 11  47.62 
 
 
244 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0658  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 
233 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.382141  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  44.83 
 
 
235 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  28.83 
 
 
211 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
310 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  27.27 
 
 
297 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.97 
 
 
256 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  30.58 
 
 
244 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  29.57 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0746  Methyltransferase type 11  48.98 
 
 
314 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  30.36 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  29.03 
 
 
283 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.97 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  25.17 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1658  methyltransferase type 11  32.76 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3574  methyltransferase type 11  33.04 
 
 
235 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0445  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 
399 aa  47  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.832039  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2330  hypothetical protein  34.94 
 
 
403 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0440768  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  34.65 
 
 
250 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
197 aa  47  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  26.7 
 
 
258 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  46.15 
 
 
242 aa  47  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2186  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 
254 aa  47  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.47 
 
 
258 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 
258 aa  47  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  25.71 
 
 
286 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0357  methyltransferase type 11  46.81 
 
 
194 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  57.89 
 
 
235 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>