110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_7379 on replicon NC_007489
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007489  RSP_7379  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 242 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1510  hypothetical protein  40.09 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.702399  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5480  methyltransferase type 12  37.77 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2836  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.167679 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 810 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  33.61 
 
 		 206 aa  52.8  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6865  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 282 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  32.26 
 
 		 261 aa  52  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  29.27 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  26.99 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  30.15 
 
 		 634 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  29.51 
 
 		 249 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0807  type 11 methyltransferase  29.6 
 
 		 245 aa  48.9  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.887141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  29.46 
 
 		 273 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3743  methyltransferase type 11  31.96 
 
 		 331 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 257 aa  48.9  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0994  methyltransferase type 11  33.82 
 
 		 245 aa  48.5  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  28.15 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.29 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.88 
 
 		 345 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  30.59 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  35.82 
 
 		 1162 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2692  methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 206 aa  47.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253841 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  28.69 
 
 		 305 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  29.57 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0094  methyltransferase type 11  41.94 
 
 		 254 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.116481 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0584  methyltransferase type 11  44.44 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.950676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0658  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.382141  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1022  Methyltransferase type 11  26.14 
 
 		 273 aa  46.2  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  27.03 
 
 		 248 aa  46.6  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0919  chromosome segregation ATPase  27.87 
 
 		 646 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.446373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 298 aa  45.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1514  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.04 
 
 		 280 aa  45.8  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.732855  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72050  hypothetical protein  25.44 
 
 		 278 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.892313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0070  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 254 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  33.73 
 
 		 259 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 242 aa  45.4  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3998  methyltransferase type 11  39.29 
 
 		 322 aa  45.4  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  29.58 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  29.7 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00196  biotin synthesis protein  21.66 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.505545  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  37.93 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2883  methyltransferase type 11  47.62 
 
 		 221 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0898399  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1137  transcriptional regulator  22.9 
 
 		 395 aa  43.9  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000736319  hitchhiker  0.00587761 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  24.69 
 
 		 436 aa  44.3  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  27.61 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0357  methyltransferase type 11  31.73 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 711 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  31.71 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2509  methyltransferase type 11  35.38 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  0.163861 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3574  methyltransferase type 11  30.09 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0431  methyltransferase type 11  35.44 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.336271 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  35.45 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0613  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168434  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1899  methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.749926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2732  Methyltransferase type 11  35.38 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.31 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2880  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.51 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2131  hypothetical protein  27.83 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.967434  normal  0.0119772 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3845  glycosyl transferase, group 1  36.21 
 
 		 802 aa  43.5  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.880485  normal  0.505849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0218  methyltransferase type 11  37.21 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0956  methyltransferase type 11  28 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2999  methyltransferase type 11  25.66 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0921858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0228  methyltransferase type 11  37.21 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0208  methyltransferase type 11  37.21 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3927  methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.852956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  29.63 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2893  methyltransferase type 11  26.62 
 
 		 317 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 		 624 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3076  Methyltransferase type 11  45.24 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.851189  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1204  Methyltransferase type 11  25.45 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.19766  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2320  Methyltransferase type 11  24.55 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46525  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  42.22 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  42.11 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1544  Generic methyltransferase  22.36 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  27.27 
 
 		 276 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0559  methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2064  methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394236  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  40 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0141  methyltransferase type 11  35.53 
 
 		 227 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2437  Methyltransferase type 11  33.85 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0447  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 246 aa  42.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  25.54 
 
 		 245 aa  42.7  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  29.06 
 
 		 276 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  24.06 
 
 		 196 aa  42.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  28.57 
 
 		 258 aa  42.7  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0427  methyltransferase type 11  34.88 
 
 		 255 aa  42.7  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100064  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  25 
 
 		 206 aa  42.7  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4035  hypothetical protein  28.48 
 
 		 253 aa  42.4  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  26.98 
 
 		 249 aa  42.4  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3019  hypothetical protein  24.44 
 
 		 306 aa  42.4  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5795  Methyltransferase type 11  29 
 
 		 293 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 263 aa  42.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  28.45 
 
 		 382 aa  42  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10226  methyltransferase  37.21 
 
 		 254 aa  42  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  38.71 
 
 		 255 aa  42.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  29.85 
 
 		 265 aa  42  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>