More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0789 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0789  methyltransferase type 11  100 
 
 
264 aa  532  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4435  methyltransferase type 11  88.66 
 
 
247 aa  448  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.937365  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2836  methyltransferase type 11  37.84 
 
 
234 aa  63.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.167679 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5881  methyltransferase type 11  40.91 
 
 
237 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  39.09 
 
 
237 aa  62  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  44.87 
 
 
235 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  41.09 
 
 
291 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  35.82 
 
 
237 aa  60.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2520  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  55.77 
 
 
233 aa  59.7  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.783143  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  30.61 
 
 
238 aa  59.7  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  28.8 
 
 
237 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  32.88 
 
 
251 aa  56.6  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  32.53 
 
 
235 aa  56.2  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2351  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
270 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  34.86 
 
 
279 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.14 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.14 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  29.8 
 
 
240 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 
242 aa  53.9  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  32.45 
 
 
255 aa  53.1  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  42.42 
 
 
219 aa  52.8  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  31.36 
 
 
274 aa  52.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0261  hypothetical protein  32.43 
 
 
240 aa  52.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1645  methyltransferase type 11  38.6 
 
 
281 aa  52.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5195  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 
273 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.82 
 
 
244 aa  52  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.23 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  33.11 
 
 
289 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  29.41 
 
 
168 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1510  hypothetical protein  34.21 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.702399  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  36.67 
 
 
238 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  35.09 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.23 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.23 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.23 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0301  hypothetical protein  32.43 
 
 
240 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0854  methyltransferase type 11  43.55 
 
 
266 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.860107  normal  0.0122771 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  39.71 
 
 
213 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  52.17 
 
 
201 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.94 
 
 
251 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0127  Methyltransferase type 11  41.94 
 
 
246 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.72 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  33.12 
 
 
237 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1760  methyltransferase type 11  32.41 
 
 
320 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3373  methyltransferase type 11  45.76 
 
 
266 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.104552 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  33.53 
 
 
239 aa  50.4  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  35.88 
 
 
281 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  30.3 
 
 
274 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  37.29 
 
 
282 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  28.29 
 
 
240 aa  50.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  34.86 
 
 
634 aa  50.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 
284 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1567  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.82 
 
 
258 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00051335  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3246  Methyltransferase type 11  49.02 
 
 
255 aa  49.7  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00392072  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0275  hypothetical protein  31.08 
 
 
240 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64589  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  34.62 
 
 
243 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 
251 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  35.56 
 
 
242 aa  49.7  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.97 
 
 
223 aa  49.7  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  52.17 
 
 
347 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2517  biotin biosynthesis protein BioC  29.79 
 
 
275 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000257486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 
271 aa  49.7  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  34.88 
 
 
377 aa  49.3  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3846  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.73 
 
 
258 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000212433  hitchhiker  0.00000000403337 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  42.5 
 
 
331 aa  49.3  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.46 
 
 
259 aa  49.3  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0255  methyltransferase type 11  31.08 
 
 
240 aa  49.3  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1922  Methyltransferase type 11  39.68 
 
 
226 aa  49.3  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2357  biotin biosynthesis protein BioC  36.47 
 
 
275 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000020473 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2429  biotin biosynthesis protein BioC  36.47 
 
 
275 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0131748 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1499  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.73 
 
 
258 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0560874  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0321  hypothetical protein  32.43 
 
 
240 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1180  methyltransferase type 11  29.48 
 
 
279 aa  48.9  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1605  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  38.78 
 
 
258 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000158565  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  29.86 
 
 
305 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.19 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2738  biotin synthesis protein BioC  27.27 
 
 
275 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1352  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.78 
 
 
258 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2736  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
225 aa  48.5  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  24.1 
 
 
377 aa  48.5  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  54.76 
 
 
331 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.17 
 
 
234 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 
711 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1167  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
259 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000217887  hitchhiker  0.00731668 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1462  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.78 
 
 
258 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.114073  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  48.94 
 
 
267 aa  48.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1367  methyltransferase type 11  38.78 
 
 
258 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000820801  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3236  methyltransferase type 11  36.76 
 
 
239 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  53.19 
 
 
204 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  53.19 
 
 
204 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  29.93 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 
244 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  48.15 
 
 
204 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1535  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  38.78 
 
 
258 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000727979 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2472  methyltransferase type 11  49.06 
 
 
367 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  29.61 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  30.92 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 
244 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 
268 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1282  methyltransferase type 11  54.17 
 
 
220 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>