59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3373 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3373  methyltransferase type 11  100 
 
 		 266 aa  521  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.104552 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2168  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 		 1770 aa  91.3  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.377633 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1475  hypothetical protein  24.63 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5195  Methyltransferase type 11  28.69 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  46.27 
 
 		 259 aa  53.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20830  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.82 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0789  methyltransferase type 11  45.76 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2368  Methyltransferase type 11  39.32 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000109502  hitchhiker  0.000328016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5905  Methyltransferase type 11  36.81 
 
 		 245 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4435  methyltransferase type 11  45.76 
 
 		 247 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.937365  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  60.47 
 
 		 274 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  60.47 
 
 		 274 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  35.96 
 
 		 225 aa  49.3  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.71 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  39.18 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2063  Methyltransferase type 11  40.21 
 
 		 188 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.571363 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  32.38 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  33.33 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  48.15 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  52 
 
 		 294 aa  47  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  39.73 
 
 		 242 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  39.73 
 
 		 242 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 		 249 aa  46.6  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  50 
 
 		 253 aa  46.2  0.0006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  46.15 
 
 		 276 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2179  Methyltransferase type 11  40.24 
 
 		 304 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  37.88 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2517  biotin biosynthesis protein BioC  42.86 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000257486 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  48.21 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  41.56 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  36.13 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.82 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4470  Methyltransferase type 11  30.88 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.09133  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3259  hypothetical protein  27.83 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39860  methylase  36.19 
 
 		 241 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  42.37 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  45.1 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  48 
 
 		 294 aa  43.5  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  38.95 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  34.23 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  32.41 
 
 		 347 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  35.37 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  38.33 
 
 		 270 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0557  Methyltransferase type 11  51.02 
 
 		 255 aa  43.5  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.492421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2343  biotin biosynthesis protein BioC  43.75 
 
 		 269 aa  43.5  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 254 aa  43.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6235  methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 204 aa  42.7  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  42.59 
 
 		 263 aa  42.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  35.37 
 
 		 295 aa  42.7  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  34.56 
 
 		 261 aa  42.7  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  37.5 
 
 		 267 aa  42.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  38.71 
 
 		 246 aa  42.4  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  39.39 
 
 		 275 aa  42.7  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1316  methyltransferase type 12  28.46 
 
 		 293 aa  42.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0420915 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  35.53 
 
 		 309 aa  42  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  33.68 
 
 		 260 aa  42  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  46.81 
 
 		 281 aa  42  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>