31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1316 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1316  methyltransferase type 12  100 
 
 		 293 aa  599  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0420915 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4143  methyltransferase type 12  73.14 
 
 		 285 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000140533 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2422  methyltransferase type 11  28.78 
 
 		 221 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.840321  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2232  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.76 
 
 		 232 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.618001  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5195  Methyltransferase type 11  23.79 
 
 		 273 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3056  methyltransferase type 11  28.06 
 
 		 223 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000799279  normal  0.774854 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  24.84 
 
 		 258 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 276 aa  46.6  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 269 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  31.86 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.5 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72030  hypothetical protein  27.15 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0333  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.26 
 
 		 445 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5678  hypothetical protein  26 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.622302  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4485  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.36 
 
 		 341 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0493356  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2347  Methyltransferase type 11  25.84 
 
 		 265 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4281  putative methyltransferase  27.1 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.13 
 
 		 229 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.416549  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 360 aa  43.5  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1440  methyltransferase, putative  27.1 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  25.83 
 
 		 260 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.33 
 
 		 246 aa  43.1  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  22.73 
 
 		 390 aa  43.1  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  25.83 
 
 		 269 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1720  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.91 
 
 		 440 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2401  hypothetical protein  27.59 
 
 		 288 aa  42.7  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.33 
 
 		 246 aa  42.7  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4558  hypothetical protein  26.49 
 
 		 247 aa  42.4  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.200899 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3373  methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 266 aa  42.4  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.104552 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2228  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.91 
 
 		 427 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.773726  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5884  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.91 
 
 		 422 aa  42.4  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0711978  normal  0.210944 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>