222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2422 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2422  methyltransferase type 11  100 
 
 		 221 aa  450  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.840321  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3056  methyltransferase type 11  86.3 
 
 		 223 aa  385  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000799279  normal  0.774854 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3821  methyltransferase type 11  50.25 
 
 		 203 aa  218  7e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951673  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2233  Methyltransferase type 11  50.99 
 
 		 204 aa  201  8e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.569046  hitchhiker  0.00169364 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  30.81 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2158  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 363 aa  59.3  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  37.37 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0705  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3321  methyltransferase type 12  30.07 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.619193  normal  0.25285 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  25.16 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  36.21 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2577  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.68 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87708  predicted protein  31.39 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2301  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  32.6 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4122  methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.15 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2343  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 367 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09391  methyltransferase  27.75 
 
 		 351 aa  52.4  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.67 
 
 		 221 aa  52.4  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 244 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 232 aa  52.4  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09381  methyltransferase  27.75 
 
 		 351 aa  52  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.398692  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  24.59 
 
 		 283 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  26.39 
 
 		 351 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  39.82 
 
 		 354 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 266 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  33.91 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0977  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.67 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.270473 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  26.96 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2472  methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 367 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1309  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.0297047 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  26.62 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  33 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0152  methyltransferase type 11  27.43 
 
 		 296 aa  49.3  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 		 733 aa  49.3  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  28.43 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16301  methyltransferase  29.05 
 
 		 357 aa  49.3  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.346442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1316  methyltransferase type 12  28.78 
 
 		 293 aa  48.9  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0420915 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3788  type 11 methyltransferase  27.78 
 
 		 306 aa  48.9  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0981  methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 229 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6874  Methyltransferase type 11  34.68 
 
 		 260 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413969  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.86 
 
 		 291 aa  48.5  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.23 
 
 		 241 aa  48.1  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3913  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 305 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal  0.248183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3864  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 305 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10291  methyltransferase  22.76 
 
 		 352 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.55915 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1453  SAM-dependent methyltransferase  23.78 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.938233  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3557  Methyltransferase type 11  26.89 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 259 aa  47.8  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07721  methyltransferase  24.65 
 
 		 353 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0608577 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2038  Methyltransferase type 11  27.36 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.678124 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  24.14 
 
 		 311 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0140  methyltransferase  24.65 
 
 		 353 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.56 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2401  hypothetical protein  29.59 
 
 		 288 aa  47.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 337 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0312  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  34.74 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  30 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10041  methyltransferase  23.46 
 
 		 351 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0991  methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  26 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  35.42 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  27.87 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  32.29 
 
 		 271 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2020  methyltransferase type 11  34.44 
 
 		 230 aa  46.2  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.525149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  23.14 
 
 		 247 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.77 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.416549  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1504  Methyltransferase type 11  34.52 
 
 		 198 aa  46.2  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  29.41 
 
 		 240 aa  46.2  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2956  methyltransferase type 11  22.36 
 
 		 304 aa  46.2  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626473  normal  0.0682436 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1692  23S rRNA methyltransferase A  24.68 
 
 		 273 aa  46.2  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653904  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0240  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 217 aa  46.2  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.164188 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 285 aa  46.2  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2347  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 		 265 aa  45.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  39.09 
 
 		 257 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3130  hypothetical protein  24.14 
 
 		 305 aa  45.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51145  predicted protein  23.77 
 
 		 363 aa  45.8  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3961  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.29 
 
 		 212 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  25.81 
 
 		 191 aa  45.4  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2354  methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 231 aa  45.8  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.202193  normal  0.578326 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1266  generic methyl-transferase  24.65 
 
 		 357 aa  45.4  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4181  methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 239 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4235  methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 244 aa  45.4  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0933321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>