209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3056 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3056  methyltransferase type 11  100 
 
 		 223 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000799279  normal  0.774854 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2422  methyltransferase type 11  86.3 
 
 		 221 aa  385  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.840321  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3821  methyltransferase type 11  50.25 
 
 		 203 aa  219  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951673  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2233  Methyltransferase type 11  53.96 
 
 		 204 aa  210  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.569046  hitchhiker  0.00169364 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  30.81 
 
 		 365 aa  62.4  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3321  methyltransferase type 12  32.12 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.619193  normal  0.25285 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 317 aa  58.5  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2158  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2301  methyltransferase type 11  35.77 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  25.68 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  36.76 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  36.36 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.06 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0705  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 300 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2577  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  33.91 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 244 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87708  predicted protein  31.4 
 
 		 267 aa  53.1  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 266 aa  52.4  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4122  methyltransferase type 11  31.63 
 
 		 231 aa  52  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  25.41 
 
 		 283 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 202 aa  51.6  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2343  methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 367 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2205  Methyltransferase type 11  24.63 
 
 		 362 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000273998 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2414  hypothetical protein  28.97 
 
 		 351 aa  50.1  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177274  normal  0.0190439 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1692  23S rRNA methyltransferase A  29.63 
 
 		 273 aa  49.7  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653904  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 232 aa  49.7  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0991  methyltransferase type 11  36.19 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10291  methyltransferase  23.58 
 
 		 352 aa  49.7  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.55915 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 		 241 aa  49.3  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0152  methyltransferase type 11  26.55 
 
 		 296 aa  49.3  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2354  methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.202193  normal  0.578326 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  29.69 
 
 		 237 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 208 aa  48.9  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4181  methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 239 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16301  methyltransferase  29.41 
 
 		 357 aa  48.5  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.346442 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2020  methyltransferase type 11  34.44 
 
 		 230 aa  48.5  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.525149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  27 
 
 		 261 aa  48.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  36 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  32 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  25.69 
 
 		 351 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2347  Methyltransferase type 11  29.87 
 
 		 265 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2038  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.678124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0312  Methyltransferase type 11  36 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07721  methyltransferase  23.58 
 
 		 353 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0608577 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1504  Methyltransferase type 11  34.52 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 285 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  28.92 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.25 
 
 		 291 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0140  methyltransferase  23.58 
 
 		 353 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.73 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.416549  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1898  methyltransferase type 11  32.32 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1361  methyltransferase type 11  28 
 
 		 854 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.610168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  34.34 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3745  methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195128  normal  0.0952192 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3562  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 200 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.50395 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  36.73 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.57 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 		 733 aa  47  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1589  23S rRNA methyltransferase A  27.27 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972827  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1316  methyltransferase type 12  28.06 
 
 		 293 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0420915 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2472  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 367 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4457  hypothetical protein  25.83 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.643189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4271  hypothetical protein  25.83 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.208511  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4603  hypothetical protein  25.83 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.964338  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4508  hypothetical protein  25.83 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000692373  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  26.36 
 
 		 363 aa  46.6  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  32.29 
 
 		 259 aa  46.6  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4455  hypothetical protein  25.83 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.821165 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51145  predicted protein  25.44 
 
 		 363 aa  46.6  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4494  hypothetical protein  25.83 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0149  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.44 
 
 		 351 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2995  Methyltransferase type 11  26.17 
 
 		 363 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5571  methyltransferase type 11  30.6 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1453  SAM-dependent methyltransferase  23.08 
 
 		 252 aa  46.2  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.938233  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 240 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  25.86 
 
 		 249 aa  45.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4235  methyltransferase type 11  31.34 
 
 		 244 aa  45.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0933321 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2820  methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 279 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0981  methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 229 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0178  methyltransferase type 11  33 
 
 		 265 aa  45.8  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0742  hypothetical protein  25 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  26.85 
 
 		 287 aa  45.8  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 285 aa  45.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 285 aa  45.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 204 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4108  hypothetical protein  25.83 
 
 		 212 aa  45.8  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.404315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4222  methyltransferase type 11  25.83 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3875  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 268 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1613  23S rRNA methyltransferase A  32.56 
 
 		 270 aa  45.8  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0846237  hitchhiker  0.00925315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>