More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4470 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4470  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 252 aa  506  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.09133  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0401  Methyltransferase type 11  64.26 
 
 		 257 aa  293  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0427  methyltransferase type 11  60.78 
 
 		 255 aa  289  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100064  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10226  methyltransferase  60.63 
 
 		 254 aa  288  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0241  methyltransferase type 11  61.42 
 
 		 255 aa  286  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114576 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0208  methyltransferase type 11  60.47 
 
 		 252 aa  285  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0218  methyltransferase type 11  59.68 
 
 		 252 aa  282  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0228  methyltransferase type 11  59.68 
 
 		 252 aa  282  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  54.58 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2999  methyltransferase type 11  58.7 
 
 		 246 aa  246  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0921858  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3743  methyltransferase type 11  51.69 
 
 		 331 aa  238  5.999999999999999e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0807  type 11 methyltransferase  51.25 
 
 		 245 aa  237  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.887141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0994  methyltransferase type 11  52.34 
 
 		 245 aa  236  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2465  hypothetical protein  55.23 
 
 		 246 aa  231  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16743  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  50.21 
 
 		 249 aa  228  9e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0264  Methyltransferase type 11  53.14 
 
 		 252 aa  224  9e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1320  Methyltransferase type 11  45.07 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.065684 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  39.39 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2880  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.33 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2418  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.224648 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  37.38 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  27.34 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3286  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0666  hypothetical protein  31.73 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4088  Methyltransferase type 11  36.56 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  34.51 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2320  Methyltransferase type 11  27.52 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46525  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  31.78 
 
 		 310 aa  53.9  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5881  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  37.76 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00196  biotin synthesis protein  34.26 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.505545  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1815  methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  32.29 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  34.43 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2374  methyltransferase type 11  25.58 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.404257 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 225 aa  53.1  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  26.97 
 
 		 245 aa  53.1  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  35.34 
 
 		 710 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2520  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.38 
 
 		 233 aa  52.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.783143  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3487  methyltransferase type 11  37.62 
 
 		 253 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.703718  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0965  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 261 aa  52.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0162273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.43 
 
 		 265 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3639  Methyltransferase type 11  39.13 
 
 		 253 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  35.42 
 
 		 197 aa  52.4  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  32.48 
 
 		 263 aa  52.4  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 196 aa  52.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 237 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 281 aa  52  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  26.03 
 
 		 249 aa  52  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  25.95 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 		 1106 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.58 
 
 		 345 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.06 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  27 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.2 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1618  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 299 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  32.74 
 
 		 711 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  31.25 
 
 		 267 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  27.03 
 
 		 223 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  31.4 
 
 		 267 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1848  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.63 
 
 		 282 aa  50.4  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.329247 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3114  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 262 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000861338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  30.97 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 273 aa  50.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.08 
 
 		 272 aa  50.4  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 267 aa  50.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  28.95 
 
 		 215 aa  50.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 409 aa  49.7  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.43 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  30.93 
 
 		 243 aa  50.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.09 
 
 		 258 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  35.42 
 
 		 258 aa  49.3  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.48 
 
 		 258 aa  49.7  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  24.09 
 
 		 240 aa  49.7  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0981  methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 229 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.7 
 
 		 258 aa  49.3  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4235  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 244 aa  49.3  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0933321 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 216 aa  49.3  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 250 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4099  methyltransferase type 11  34.35 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4330  methyltransferase type 11  34.35 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.510233  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4175  methyltransferase type 11  34.35 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  34.29 
 
 		 275 aa  49.3  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3400  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.3 
 
 		 232 aa  49.3  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 241 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.55 
 
 		 259 aa  48.9  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0756  methyltransferase type 11  30.21 
 
 		 234 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.055358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>