More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0557 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0557  Methyltransferase type 11  100 
 
 
255 aa  491  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.492421 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  34.18 
 
 
239 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3259  hypothetical protein  28.38 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1619  methyltransferase type 11  34.14 
 
 
244 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 
246 aa  68.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  40.16 
 
 
634 aa  67.8  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  28.22 
 
 
273 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  28 
 
 
276 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  26.75 
 
 
269 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  31.51 
 
 
215 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  38.53 
 
 
319 aa  57  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3743  methyltransferase type 11  34.29 
 
 
331 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3569  methyltransferase type 11  30.97 
 
 
208 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  38.74 
 
 
258 aa  56.6  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  25.98 
 
 
265 aa  56.6  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  40.2 
 
 
256 aa  56.2  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  24.77 
 
 
249 aa  56.2  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  37.01 
 
 
362 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  29.6 
 
 
284 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  29.94 
 
 
263 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  32.06 
 
 
305 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  29.53 
 
 
244 aa  55.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  32.48 
 
 
253 aa  55.1  0.000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
211 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  26.16 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  38.78 
 
 
1106 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3400  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.76 
 
 
232 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0006  hypothetical protein  25.65 
 
 
271 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.868865  normal  0.0557095 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  33.11 
 
 
348 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  30.63 
 
 
279 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  34.62 
 
 
283 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  37.62 
 
 
226 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  32.76 
 
 
280 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.43 
 
 
234 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2465  hypothetical protein  38.14 
 
 
246 aa  53.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16743  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  36.27 
 
 
269 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 
249 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
269 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  46.15 
 
 
245 aa  53.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  34.02 
 
 
244 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  35.87 
 
 
259 aa  52.8  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  33.57 
 
 
260 aa  52.8  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  47.27 
 
 
261 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  38.14 
 
 
260 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.97 
 
 
280 aa  52.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0994  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
245 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295346  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 
259 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.74 
 
 
251 aa  52.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  34.68 
 
 
268 aa  52  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 
221 aa  52  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  40 
 
 
254 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  34.69 
 
 
267 aa  51.6  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  41.38 
 
 
254 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0248  methyltransferase type 11  23.68 
 
 
195 aa  51.6  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  34.69 
 
 
267 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  39.45 
 
 
263 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  38.18 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  30.99 
 
 
304 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  34.69 
 
 
267 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  30.77 
 
 
312 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  36.97 
 
 
237 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  35.38 
 
 
276 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  25.52 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
210 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2269  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.541668  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  38.38 
 
 
255 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0218  methyltransferase type 11  30.38 
 
 
252 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1922  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 
226 aa  50.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0228  methyltransferase type 11  30.38 
 
 
252 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1607  Methyltransferase type 11  33.67 
 
 
238 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  47.27 
 
 
263 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0842  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.67 
 
 
235 aa  50.8  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3305  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  38.38 
 
 
248 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2736  Methyltransferase type 11  37.38 
 
 
225 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  26.5 
 
 
244 aa  50.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  26.43 
 
 
286 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0314  putative methyltransferase  22.58 
 
 
211 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4070  MerR family transcriptional regulator  23.26 
 
 
260 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.354959 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.79 
 
 
251 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  37.21 
 
 
276 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.54 
 
 
255 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  24.82 
 
 
283 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  25.67 
 
 
624 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  33.6 
 
 
216 aa  50.4  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6428  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
237 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  36.28 
 
 
202 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  38.14 
 
 
259 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  36.52 
 
 
260 aa  50.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 
207 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0114  hypothetical protein  34.17 
 
 
268 aa  50.4  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 
268 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  34.02 
 
 
268 aa  50.1  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0455  methyltransferase type 11  30.08 
 
 
264 aa  50.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5881  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
237 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.79 
 
 
251 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 
207 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  34.86 
 
 
253 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.26 
 
 
230 aa  50.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1512  methyltransferase type 11  30.19 
 
 
190 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.358179  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2429  biotin biosynthesis protein BioC  30.08 
 
 
275 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0131748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>