More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2465 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2465  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  499  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16743  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0264  Methyltransferase type 11  76.86 
 
 		 252 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0807  type 11 methyltransferase  72.2 
 
 		 245 aa  362  3e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.887141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  73.25 
 
 		 255 aa  360  8e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  64.61 
 
 		 249 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3743  methyltransferase type 11  57.2 
 
 		 331 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0994  methyltransferase type 11  57.45 
 
 		 245 aa  268  5.9999999999999995e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2999  methyltransferase type 11  55.87 
 
 		 246 aa  249  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0921858  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0427  methyltransferase type 11  54.47 
 
 		 255 aa  248  6e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100064  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4470  Methyltransferase type 11  55.32 
 
 		 252 aa  244  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.09133  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0241  methyltransferase type 11  52.44 
 
 		 255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114576 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0218  methyltransferase type 11  51.64 
 
 		 252 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0228  methyltransferase type 11  51.64 
 
 		 252 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0208  methyltransferase type 11  51.64 
 
 		 252 aa  225  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0401  Methyltransferase type 11  50.64 
 
 		 257 aa  223  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10226  methyltransferase  50.61 
 
 		 254 aa  218  5e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  37.5 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  37.5 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  36.44 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.07 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.63 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  36.08 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  37 
 
 		 235 aa  57  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.54 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0742  type 11 methyltransferase  32.59 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.166057 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0666  hypothetical protein  31.68 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  31.58 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  34.78 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  34.81 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  43.3 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  32.26 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  31.87 
 
 		 293 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  33.91 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  32.31 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  39.58 
 
 		 307 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  36.19 
 
 		 241 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  27.88 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  29.46 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  33.04 
 
 		 309 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  30.87 
 
 		 281 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.65 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 261 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  33.9 
 
 		 202 aa  53.1  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  29.29 
 
 		 206 aa  53.1  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0557  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.492421 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  30.5 
 
 		 291 aa  52.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.21 
 
 		 238 aa  52.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  25 
 
 		 229 aa  52.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  32.31 
 
 		 248 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 267 aa  52.4  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  39.6 
 
 		 265 aa  52.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34 
 
 		 296 aa  52.4  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.91 
 
 		 237 aa  52  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1111  methyltransferase type 11  36.54 
 
 		 367 aa  52  0.000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.0000134358  hitchhiker  0.0000106237 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  22.76 
 
 		 207 aa  52  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  37.11 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  29.14 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0435  methyltransferase type 11  48.15 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252383  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2301  methyltransferase type 11  39.13 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0365  methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  35.58 
 
 		 312 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  28.18 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0491  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  23.33 
 
 		 229 aa  51.2  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372241  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2429  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0131748 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  32.09 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  27.41 
 
 		 238 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  32.69 
 
 		 272 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.83 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 223 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 264 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  37.76 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2471  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.09 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.08 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2357  biotin biosynthesis protein BioC  32.48 
 
 		 275 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020473 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0839  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.09 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  36.29 
 
 		 274 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  27.14 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4065  methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.991618  normal  0.0815821 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4822  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2517  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000257486 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  27.34 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1844  Methyltransferase type 11  29.06 
 
 		 225 aa  50.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00648646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0603  methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 288 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000027512  unclonable  0.00000842033 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1588  Methyltransferase type 11  29.08 
 
 		 224 aa  50.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.666171  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  34.74 
 
 		 196 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2580  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.62 
 
 		 249 aa  49.3  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0711  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.88 
 
 		 247 aa  49.3  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0438785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  31.93 
 
 		 304 aa  49.3  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>