More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4086 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  100 
 
 		 249 aa  508  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  36.69 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  36.69 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  36.69 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  35.97 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  35.97 
 
 		 332 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  31.22 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  42.16 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  31.1 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  37 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4181  methyltransferase type 11  37.93 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3821  methyltransferase type 11  34.81 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951673  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  37.11 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  31.48 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  34.53 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.04 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  36.03 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1078  SAM-dependent methyltransferase  29.1 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.215412  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.09 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3984  methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.237178  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  36.07 
 
 		 319 aa  65.5  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0427  methyltransferase type 11  30.85 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100064  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.37 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  34.93 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2233  Methyltransferase type 11  39.6 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.569046  hitchhiker  0.00169364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  28.28 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  31.97 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1922  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0611  hypothetical protein  30.12 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2605  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.79 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0775549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.35 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 330 aa  62  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  39.05 
 
 		 257 aa  62  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  35.42 
 
 		 331 aa  62  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2577  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8173  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781909  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.95 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.22 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  35.45 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1721  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0157757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  37.84 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  38.89 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2736  Methyltransferase type 11  35.56 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41621  predicted protein  32.5 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0117429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  36.45 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36712  predicted protein  32.5 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.214896  hitchhiker  0.00091812 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  33.33 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  36.94 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  36.45 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3056  methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000799279  normal  0.774854 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0208  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  43.75 
 
 		 457 aa  58.9  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  28.28 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  33.85 
 
 		 328 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3154  hypothetical protein  33.33 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3338  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2892  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0124  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.528868  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1464  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  33.67 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  33.13 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0062  methyltransferase  30.3 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.48034  normal  0.0312794 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  28.03 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  36.21 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.15 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0842  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.21 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3305  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2782  methyltransferase type 11  36.08 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320592  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.58 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.84 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  32.3 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  27.07 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2422  methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.840321  normal  0.14599 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>