More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3338 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3338  Methyltransferase type 11  100 
 
 
210 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  38.51 
 
 
200 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  38.51 
 
 
200 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  39.57 
 
 
199 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.46 
 
 
205 aa  96.3  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  35.66 
 
 
202 aa  95.1  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  30.94 
 
 
201 aa  85.5  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0756  Methyltransferase type 11  42.28 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  40 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  40.32 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  41.88 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  38.1 
 
 
284 aa  74.7  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  37.14 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  37.37 
 
 
213 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  34.59 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  37.9 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.62 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  42.16 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  44.23 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  35.65 
 
 
333 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.04 
 
 
386 aa  68.6  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  33.91 
 
 
300 aa  68.2  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  43.27 
 
 
275 aa  68.2  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0235  Methyltransferase type 11  36.3 
 
 
313 aa  68.2  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  37.5 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  35.65 
 
 
367 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.591727 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  36.94 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0216  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 
313 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.320783 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  36.09 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51145  predicted protein  38.68 
 
 
363 aa  66.2  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  39.42 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.93 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  39.45 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.61 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
363 aa  65.5  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  30.94 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1927  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.170226  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3665  Methyltransferase type 11  41.51 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2411  methyltransferase type 11  33.09 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.39 
 
 
258 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.39 
 
 
258 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  30.39 
 
 
261 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  30.39 
 
 
261 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.39 
 
 
261 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  39.09 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.39 
 
 
261 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0312  Methyltransferase type 11  40.91 
 
 
232 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  34.43 
 
 
204 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  31.51 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  31.51 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  34.43 
 
 
204 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 
207 aa  63.9  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4254  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.38 
 
 
272 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  40 
 
 
269 aa  63.2  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.63 
 
 
201 aa  63.2  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1113  methyltransferase type 11  34.34 
 
 
319 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629842  normal  0.748747 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16301  methyltransferase  38.53 
 
 
357 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.346442 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  34.43 
 
 
204 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09381  methyltransferase  30.77 
 
 
351 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.398692  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0241  hypothetical protein  27.72 
 
 
324 aa  62.8  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  39.62 
 
 
242 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  39.62 
 
 
242 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.54 
 
 
244 aa  62.4  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  34.51 
 
 
278 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  33.93 
 
 
285 aa  62.4  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0895  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.66 
 
 
220 aa  62.4  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195725 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09391  methyltransferase  30.77 
 
 
351 aa  62  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 
271 aa  62.4  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  33.93 
 
 
285 aa  62.4  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.8 
 
 
261 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2500  Methyltransferase type 11  30.86 
 
 
221 aa  62  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126168  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1266  generic methyl-transferase  36.7 
 
 
357 aa  62  0.000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  27.59 
 
 
351 aa  62  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  33.06 
 
 
319 aa  62  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  32.77 
 
 
204 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  34.17 
 
 
263 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3961  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.67 
 
 
212 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3572  Methyltransferase type 11  45 
 
 
270 aa  61.6  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  30.41 
 
 
239 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1338  Methyltransferase type 11  42.16 
 
 
249 aa  61.6  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00439312  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  41.12 
 
 
240 aa  61.6  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  38.26 
 
 
225 aa  61.6  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
285 aa  61.6  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 
204 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.39 
 
 
261 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4063  methyltransferase type 11  29.03 
 
 
271 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0242  hypothetical protein  26.73 
 
 
363 aa  60.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  33.07 
 
 
250 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0008  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.14 
 
 
199 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257422  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  38.39 
 
 
291 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0808  methyltransferase type 11  36.29 
 
 
182 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0203629 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 
266 aa  61.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  34.57 
 
 
239 aa  60.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  33.65 
 
 
266 aa  60.8  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7117  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 
229 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.829004  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3821  methyltransferase type 11  33.9 
 
 
203 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951673  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.34 
 
 
232 aa  60.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1078  SAM-dependent methyltransferase  31.43 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.215412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.41 
 
 
261 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>