More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4063 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4063  methyltransferase type 11  100 
 
 
271 aa  552  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0840  Methyltransferase type 11  65.79 
 
 
272 aa  343  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4254  UbiE/COQ5 methyltransferase  57.36 
 
 
272 aa  299  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  53.76 
 
 
279 aa  293  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  54.51 
 
 
272 aa  287  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  52.99 
 
 
269 aa  279  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3488  Methyltransferase type 11  53.41 
 
 
272 aa  277  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.299223 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4560  Methyltransferase type 11  53.41 
 
 
272 aa  277  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.605076 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  52.26 
 
 
270 aa  275  6e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  50.19 
 
 
269 aa  268  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1392  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 
280 aa  194  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  38.46 
 
 
526 aa  151  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
275 aa  109  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1935  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.84 
 
 
192 aa  95.1  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2018  MCP methyltransferase, CheR-type  37.33 
 
 
865 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.854917  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2080  MCP methyltransferase, CheR-type  39.71 
 
 
825 aa  81.6  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.646014  normal  0.992336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  44 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2838  methyltransferase type 11  32.91 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  31.49 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  42.31 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66900  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.28 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  41.82 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  32.47 
 
 
287 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  34.78 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4432  methyltransferase type 11  37.75 
 
 
284 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.83 
 
 
256 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2700  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  36.89 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  31.41 
 
 
251 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4859  methyltransferase type 11  30 
 
 
281 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  35 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  38.1 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  35.38 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  39.22 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5802  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.85 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3362  methyltransferase type 11  32.58 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0826191  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  38.05 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.05 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1066  putative methyltransferase  35.29 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000495873  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0387  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.17 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1067  methyltransferase type 11  27.4 
 
 
272 aa  68.9  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.58 
 
 
219 aa  68.6  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  39.47 
 
 
230 aa  68.2  0.0000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.512948  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.14 
 
 
271 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  36.24 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  26.87 
 
 
581 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  39.05 
 
 
277 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4212  methyltransferase type 11  32.02 
 
 
282 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4154  methyltransferase type 11  32.02 
 
 
282 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538399  hitchhiker  0.00787832 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.43 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  29.61 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.43 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.07 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  33.12 
 
 
281 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.11 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4209  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  35.71 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.29 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  31.61 
 
 
291 aa  65.5  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.24 
 
 
249 aa  65.1  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1991  Methyltransferase type 11  29.53 
 
 
283 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306887  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2229  methyltransferase type 11  38.46 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4919  methyltransferase type 11  36.28 
 
 
285 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.232669  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4638  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.25 
 
 
258 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0233383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1032  methyltransferase type 11  28.06 
 
 
282 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3930  Methyltransferase type 11  39.42 
 
 
250 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.56855 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4043  Methyltransferase type 11  39.42 
 
 
250 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2907  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.14 
 
 
259 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  37.14 
 
 
236 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  28.64 
 
 
266 aa  63.9  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1159  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 
282 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0308306  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.89 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0533  methyltransferase type 12  29.22 
 
 
325 aa  63.9  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  26.44 
 
 
233 aa  63.5  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2195  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  34.51 
 
 
213 aa  63.9  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3415  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.31 
 
 
260 aa  63.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3367  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
235 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3565  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 
288 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1119  MCP methyltransferase, CheR-type  31.54 
 
 
287 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.4 
 
 
254 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.36 
 
 
241 aa  62.8  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 
255 aa  63.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4233  Methyltransferase type 11  34.72 
 
 
274 aa  63.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
263 aa  62.8  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6294  methyltransferase type 11  31.54 
 
 
287 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0454  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.9 
 
 
256 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0799871  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  40.57 
 
 
195 aa  62.8  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0746  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.75 
 
 
251 aa  62.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3054  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.83 
 
 
290 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0064  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
247 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6529  Methyltransferase type 11  29.22 
 
 
287 aa  62.4  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0889937 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.89 
 
 
253 aa  62.4  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179927  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3895  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.71 
 
 
251 aa  62.4  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.4649  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5925  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.29 
 
 
248 aa  62.4  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0445  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.71 
 
 
251 aa  62.4  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187756  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0431  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.71 
 
 
251 aa  62.4  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159062  hitchhiker  0.0000667 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0506  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.71 
 
 
251 aa  62.4  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2248  demethylmenaquinone methyltransferase  36.84 
 
 
250 aa  62.4  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.71 
 
 
251 aa  62.4  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0806  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  31.48 
 
 
231 aa  62  0.000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.622934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>