More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2273 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  100 
 
 		 204 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  97.06 
 
 		 204 aa  410  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  94.61 
 
 		 204 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  82.84 
 
 		 204 aa  357  6e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  79.1 
 
 		 204 aa  343  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  78.11 
 
 		 204 aa  341  5e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  77.61 
 
 		 204 aa  337  7e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  77.61 
 
 		 204 aa  337  7e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  75.62 
 
 		 205 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  51.47 
 
 		 202 aa  208  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  42 
 
 		 203 aa  143  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2862  methyltransferase type 11  38.74 
 
 		 207 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  41.3 
 
 		 202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19610  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  41.9 
 
 		 207 aa  128  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0633091  normal  0.0668245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3244  methyltransferase type 11  41.94 
 
 		 208 aa  121  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5739  methyltransferase type 11  41.4 
 
 		 208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  33.12 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  31.1 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  31.41 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  37.74 
 
 		 347 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  38.52 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  30.49 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  31.93 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  30.13 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  35.78 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2635  Methyltransferase type 11  46.43 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  37.84 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4780  methyltransferase type 11  41.51 
 
 		 256 aa  71.6  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0464151  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  41.82 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  39.25 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  41.35 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  33.33 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  34.92 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  34.92 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  34.92 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.92 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.06 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  34.92 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  34.92 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12966  methyltransferase  36.45 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  37.38 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  33.02 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  42.06 
 
 		 332 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 263 aa  68.2  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  36 
 
 		 268 aa  68.2  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  42.06 
 
 		 328 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  42.06 
 
 		 328 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  42.06 
 
 		 328 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  41.28 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  42.06 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3033  thioesterase  31.03 
 
 		 829 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.862159  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  42.06 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_003296  RS00761  hypothetical protein  30.06 
 
 		 246 aa  67  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286204  normal  0.107855 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  33.87 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  35.48 
 
 		 292 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 328 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1811  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  34.53 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  27.15 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  29.05 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  36.45 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  44.44 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 634 aa  66.2  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  34.34 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1559  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00538046  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1567  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.05 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00051335  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  28.83 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 328 aa  65.1  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2376  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578401  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  40.19 
 
 		 258 aa  65.1  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 		 266 aa  65.1  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 309 aa  64.7  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0147  Methyltransferase type 11  32.33 
 
 		 240 aa  64.7  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  36.45 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.59 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1022  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5564  methyltransferase type 11  37.7 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  33.9 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  30.36 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1535  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  34.88 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000727979 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0834  Methyltransferase type 12  33.55 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.85 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1605  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  34.88 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000158565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>