More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0834 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0834  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 205 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1918  methyltransferase type 11  73.6 
 
 		 229 aa  295  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3896  methyltransferase type 11  69.85 
 
 		 208 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.744662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4321  UbiE/COQ5 methyltransferase  60.7 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701577  normal  0.237369 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4215  methyltransferase type 12  62.12 
 
 		 208 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.515794  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3983  hypothetical protein  58.29 
 
 		 206 aa  214  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.117251  normal  0.595141 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  38.21 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1749  methyltransferase type 12  40.49 
 
 		 215 aa  124  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.110719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.37 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  34.76 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2658  methyltransferase type 12  45.95 
 
 		 121 aa  90.9  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774781  normal  0.0322757 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  32.92 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1029  methyltransferase type 11  34.05 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  40.19 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  31.18 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0761  Methyltransferase type 11  29.21 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.266045  normal  0.818805 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  40.16 
 
 		 474 aa  65.5  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  38.53 
 
 		 269 aa  65.1  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  35.21 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  34.08 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  33.55 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  32.09 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  32.1 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  32.1 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  29.68 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3089  putative methyltransferase  36.51 
 
 		 241 aa  62  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 268 aa  61.6  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8173  Methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781909  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  31.65 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  39.13 
 
 		 252 aa  61.2  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  32.46 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  29.77 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1392  putative S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  32.45 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0586874  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5296  Beta-ketoacyl synthase  31.75 
 
 		 5802 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0721794 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  33.55 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  28.45 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2962  methyltransferase type 11  33.87 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  30.88 
 
 		 400 aa  59.3  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04590  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.33 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.886413  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  36.97 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  30.86 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  35.4 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  28.28 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  37.38 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  30.48 
 
 		 327 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  33.76 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  27.88 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.14 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  31.58 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1091  Methyltransferase type 11  35.65 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 328 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4039  methyltransferase type 12  33.56 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1665  polyketide synthase, putative  31.16 
 
 		 4649 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3814  Methyltransferase type 11  29.47 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212556  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 328 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2149  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  34.03 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 328 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1562  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.68 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1474  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.68 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0302671  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0061  Orf34  30.68 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1845  methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  25.84 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  31.18 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  29.01 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1419  methyltransferase type 11  30 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  33.09 
 
 		 365 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2862  methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  27.88 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  32.1 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3569  Methyltransferase type 11  32.8 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  32.24 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  37.82 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  29.59 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01034  polyketide synthase, putative (JCVI)  32.8 
 
 		 2793 aa  55.5  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.276801 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  31.97 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  34.96 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2161  Methyltransferase type 12  32.47 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  37.39 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  33.33 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  36 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.93 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  26.36 
 
 		 269 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  28.69 
 
 		 244 aa  54.3  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  26.79 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.500309 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  26.92 
 
 		 269 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1304  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.12 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308237  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.13 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  31.35 
 
 		 241 aa  53.9  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  34.13 
 
 		 263 aa  54.3  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>