More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3896 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3896  methyltransferase type 11  100 
 
 		 208 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.744662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1918  methyltransferase type 11  69.57 
 
 		 229 aa  297  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0834  Methyltransferase type 12  69.85 
 
 		 205 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4321  UbiE/COQ5 methyltransferase  56.22 
 
 		 208 aa  224  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701577  normal  0.237369 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3983  hypothetical protein  56.52 
 
 		 206 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.117251  normal  0.595141 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4215  methyltransferase type 12  57.07 
 
 		 208 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.515794  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.98 
 
 		 212 aa  126  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  37.32 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1749  methyltransferase type 12  40.76 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.110719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  41.84 
 
 		 209 aa  98.6  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2658  methyltransferase type 12  40.87 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774781  normal  0.0322757 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3089  putative methyltransferase  41.84 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0761  Methyltransferase type 11  35.07 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.266045  normal  0.818805 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1029  methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04590  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.82 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.886413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  32.62 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  29.46 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  32.34 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8173  Methyltransferase type 11  35.97 
 
 		 254 aa  62  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781909  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  30.23 
 
 		 269 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3814  Methyltransferase type 11  35.43 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212556  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  30.23 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  37.25 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1845  methyltransferase type 11  29.89 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  33.63 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  29.68 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  34.39 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1091  Methyltransferase type 11  33.91 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4055  putative methyltransferase  30 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  37.7 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  29.38 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.14 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  31.01 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.2 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4887  methyltransferase type 11  34.07 
 
 		 236 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  29.77 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3569  Methyltransferase type 11  37.84 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  29.71 
 
 		 241 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  26.97 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5458  methyltransferase type 12  38.18 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 259 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  37.39 
 
 		 474 aa  55.8  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  31.41 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3359  hypothetical protein  23.81 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  28.85 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2676  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  32.19 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  30.49 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 328 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 328 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 328 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  31.4 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.85 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.72 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 332 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  33.61 
 
 		 327 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 341 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  27.88 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001478  SAM-dependent methyltransferase  30.22 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.544466  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  41.67 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.5 
 
 		 256 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.65 
 
 		 244 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  36.17 
 
 		 241 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.41 
 
 		 260 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 240 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 270 aa  54.3  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2078  methyltransferase type 12  33.83 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1234  hypothetical protein  23.84 
 
 		 524 aa  54.7  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0873345 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5920  beta-ketoacyl synthase  29.38 
 
 		 2975 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0135718 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 363 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5079  methyltransferase type 12  37.27 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  36.21 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  35.46 
 
 		 241 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  32.09 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 344 aa  53.9  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4367  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.36 
 
 		 258 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822046 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  36.54 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5167  methyltransferase type 12  37.27 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>